Protein–RNA interactions for Protein: B2RV38

Rd3l, BC048943 protein, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rd3lB2RV38 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Rd3lB2RV38 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rd3lB2RV38 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rd3lB2RV38 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rd3lB2RV38 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Rd3lB2RV38 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rd3lB2RV38 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rd3lB2RV38 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rd3lB2RV38 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rd3lB2RV38 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rd3lB2RV38 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Rd3lB2RV38 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rd3lB2RV38 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rd3lB2RV38 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rd3lB2RV38 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rd3lB2RV38 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rd3lB2RV38 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rd3lB2RV38 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rd3lB2RV38 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rd3lB2RV38 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rd3lB2RV38 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rd3lB2RV38 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rd3lB2RV38 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rd3lB2RV38 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rd3lB2RV38 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rd3lB2RV38 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rd3lB2RV38 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Rd3lB2RV38 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rd3lB2RV38 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rd3lB2RV38 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rd3lB2RV38 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rd3lB2RV38 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rd3lB2RV38 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rd3lB2RV38 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rd3lB2RV38 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rd3lB2RV38 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rd3lB2RV38 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rd3lB2RV38 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rd3lB2RV38 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rd3lB2RV38 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rd3lB2RV38 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rd3lB2RV38 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rd3lB2RV38 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Rd3lB2RV38 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rd3lB2RV38 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rd3lB2RV38 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rd3lB2RV38 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rd3lB2RV38 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rd3lB2RV38 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rd3lB2RV38 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rd3lB2RV38 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rd3lB2RV38 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rd3lB2RV38 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rd3lB2RV38 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rd3lB2RV38 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rd3lB2RV38 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rd3lB2RV38 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Rd3lB2RV38 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rd3lB2RV38 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rd3lB2RV38 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rd3lB2RV38 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rd3lB2RV38 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rd3lB2RV38 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rd3lB2RV38 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rd3lB2RV38 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rd3lB2RV38 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rd3lB2RV38 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rd3lB2RV38 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rd3lB2RV38 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rd3lB2RV38 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rd3lB2RV38 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rd3lB2RV38 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rd3lB2RV38 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rd3lB2RV38 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rd3lB2RV38 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rd3lB2RV38 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rd3lB2RV38 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rd3lB2RV38 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rd3lB2RV38 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Rd3lB2RV38 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rd3lB2RV38 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rd3lB2RV38 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rd3lB2RV38 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rd3lB2RV38 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rd3lB2RV38 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Rd3lB2RV38 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Rd3lB2RV38 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
Rd3lB2RV38 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Rd3lB2RV38 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
Rd3lB2RV38 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rd3lB2RV38 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rd3lB2RV38 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rd3lB2RV38 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rd3lB2RV38 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rd3lB2RV38 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rd3lB2RV38 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rd3lB2RV38 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rd3lB2RV38 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rd3lB2RV38 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rd3lB2RV38 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.5 ms