Protein–RNA interactions for Protein: B2RS91

Rrn3, RNA polymerase I-specific transcription initiation factor RRN3, mousemouse

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrn3B2RS91 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rrn3B2RS91 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rrn3B2RS91 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rrn3B2RS91 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rrn3B2RS91 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rrn3B2RS91 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rrn3B2RS91 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rrn3B2RS91 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rrn3B2RS91 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rrn3B2RS91 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rrn3B2RS91 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rrn3B2RS91 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rrn3B2RS91 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rrn3B2RS91 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rrn3B2RS91 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rrn3B2RS91 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rrn3B2RS91 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rrn3B2RS91 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rrn3B2RS91 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rrn3B2RS91 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rrn3B2RS91 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rrn3B2RS91 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rrn3B2RS91 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rrn3B2RS91 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rrn3B2RS91 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Rrn3B2RS91 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rrn3B2RS91 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rrn3B2RS91 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rrn3B2RS91 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rrn3B2RS91 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Rrn3B2RS91 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rrn3B2RS91 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Rrn3B2RS91 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Rrn3B2RS91 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Rrn3B2RS91 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Rrn3B2RS91 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Rrn3B2RS91 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Rrn3B2RS91 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Rrn3B2RS91 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Rrn3B2RS91 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Rrn3B2RS91 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Rrn3B2RS91 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Rrn3B2RS91 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Rrn3B2RS91 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Rrn3B2RS91 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Rrn3B2RS91 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rrn3B2RS91 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rrn3B2RS91 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rrn3B2RS91 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rrn3B2RS91 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rrn3B2RS91 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rrn3B2RS91 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rrn3B2RS91 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rrn3B2RS91 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rrn3B2RS91 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rrn3B2RS91 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rrn3B2RS91 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rrn3B2RS91 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rrn3B2RS91 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rrn3B2RS91 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rrn3B2RS91 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rrn3B2RS91 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rrn3B2RS91 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rrn3B2RS91 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rrn3B2RS91 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rrn3B2RS91 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rrn3B2RS91 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rrn3B2RS91 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rrn3B2RS91 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rrn3B2RS91 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rrn3B2RS91 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rrn3B2RS91 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rrn3B2RS91 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rrn3B2RS91 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rrn3B2RS91 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rrn3B2RS91 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rrn3B2RS91 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rrn3B2RS91 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rrn3B2RS91 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rrn3B2RS91 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Rrn3B2RS91 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rrn3B2RS91 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rrn3B2RS91 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rrn3B2RS91 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rrn3B2RS91 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rrn3B2RS91 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rrn3B2RS91 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rrn3B2RS91 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rrn3B2RS91 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rrn3B2RS91 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rrn3B2RS91 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rrn3B2RS91 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rrn3B2RS91 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rrn3B2RS91 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rrn3B2RS91 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rrn3B2RS91 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Rrn3B2RS91 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rrn3B2RS91 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rrn3B2RS91 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rrn3B2RS91 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms