Protein–RNA interactions for Protein: B1B0V2

AU022751, Expressed sequence AU022751, mousemouse

Predictions only

Length 589 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AU022751B1B0V2 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
AU022751B1B0V2 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
AU022751B1B0V2 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
AU022751B1B0V2 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
AU022751B1B0V2 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
AU022751B1B0V2 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
AU022751B1B0V2 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
AU022751B1B0V2 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
AU022751B1B0V2 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
AU022751B1B0V2 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
AU022751B1B0V2 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
AU022751B1B0V2 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
AU022751B1B0V2 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
AU022751B1B0V2 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
AU022751B1B0V2 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
AU022751B1B0V2 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
AU022751B1B0V2 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
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AU022751B1B0V2 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
AU022751B1B0V2 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
AU022751B1B0V2 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
AU022751B1B0V2 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
AU022751B1B0V2 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
AU022751B1B0V2 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
AU022751B1B0V2 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
AU022751B1B0V2 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
AU022751B1B0V2 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
AU022751B1B0V2 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
AU022751B1B0V2 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
AU022751B1B0V2 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
AU022751B1B0V2 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
AU022751B1B0V2 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
AU022751B1B0V2 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
AU022751B1B0V2 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC28.86■■■□□ 2.21
AU022751B1B0V2 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
AU022751B1B0V2 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
AU022751B1B0V2 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
AU022751B1B0V2 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC28.86■■■□□ 2.21
AU022751B1B0V2 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
AU022751B1B0V2 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
AU022751B1B0V2 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
AU022751B1B0V2 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
AU022751B1B0V2 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC28.85■■■□□ 2.21
AU022751B1B0V2 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
AU022751B1B0V2 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
AU022751B1B0V2 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
AU022751B1B0V2 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
AU022751B1B0V2 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
AU022751B1B0V2 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
AU022751B1B0V2 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
AU022751B1B0V2 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
AU022751B1B0V2 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
AU022751B1B0V2 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
AU022751B1B0V2 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
AU022751B1B0V2 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
AU022751B1B0V2 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
AU022751B1B0V2 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
AU022751B1B0V2 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
AU022751B1B0V2 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
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AU022751B1B0V2 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
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AU022751B1B0V2 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.2
AU022751B1B0V2 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
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AU022751B1B0V2 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
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AU022751B1B0V2 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
AU022751B1B0V2 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
AU022751B1B0V2 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
AU022751B1B0V2 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
AU022751B1B0V2 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
AU022751B1B0V2 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
AU022751B1B0V2 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
AU022751B1B0V2 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
AU022751B1B0V2 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
AU022751B1B0V2 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
AU022751B1B0V2 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
AU022751B1B0V2 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
AU022751B1B0V2 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
AU022751B1B0V2 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
AU022751B1B0V2 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
AU022751B1B0V2 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
AU022751B1B0V2 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
AU022751B1B0V2 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
AU022751B1B0V2 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
AU022751B1B0V2 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
AU022751B1B0V2 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
AU022751B1B0V2 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
AU022751B1B0V2 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
AU022751B1B0V2 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
AU022751B1B0V2 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
AU022751B1B0V2 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
AU022751B1B0V2 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
AU022751B1B0V2 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
AU022751B1B0V2 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
AU022751B1B0V2 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms