Protein–RNA interactions for Protein: B1AUH1

Ptpru, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase U, mousemouse

Predictions only

Length 1,446 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpruB1AUH1 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PtpruB1AUH1 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PtpruB1AUH1 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PtpruB1AUH1 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PtpruB1AUH1 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PtpruB1AUH1 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PtpruB1AUH1 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PtpruB1AUH1 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PtpruB1AUH1 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PtpruB1AUH1 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
PtpruB1AUH1 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PtpruB1AUH1 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PtpruB1AUH1 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
PtpruB1AUH1 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
PtpruB1AUH1 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.07
PtpruB1AUH1 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
PtpruB1AUH1 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
PtpruB1AUH1 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
PtpruB1AUH1 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PtpruB1AUH1 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PtpruB1AUH1 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
PtpruB1AUH1 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PtpruB1AUH1 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PtpruB1AUH1 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PtpruB1AUH1 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PtpruB1AUH1 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
PtpruB1AUH1 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
PtpruB1AUH1 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
PtpruB1AUH1 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PtpruB1AUH1 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PtpruB1AUH1 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PtpruB1AUH1 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PtpruB1AUH1 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PtpruB1AUH1 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PtpruB1AUH1 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PtpruB1AUH1 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
PtpruB1AUH1 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PtpruB1AUH1 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PtpruB1AUH1 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PtpruB1AUH1 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PtpruB1AUH1 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
PtpruB1AUH1 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PtpruB1AUH1 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PtpruB1AUH1 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PtpruB1AUH1 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PtpruB1AUH1 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PtpruB1AUH1 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PtpruB1AUH1 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PtpruB1AUH1 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PtpruB1AUH1 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PtpruB1AUH1 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PtpruB1AUH1 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PtpruB1AUH1 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PtpruB1AUH1 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PtpruB1AUH1 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PtpruB1AUH1 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PtpruB1AUH1 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PtpruB1AUH1 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PtpruB1AUH1 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PtpruB1AUH1 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PtpruB1AUH1 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PtpruB1AUH1 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PtpruB1AUH1 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
PtpruB1AUH1 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PtpruB1AUH1 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PtpruB1AUH1 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PtpruB1AUH1 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PtpruB1AUH1 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PtpruB1AUH1 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PtpruB1AUH1 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
PtpruB1AUH1 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PtpruB1AUH1 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PtpruB1AUH1 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PtpruB1AUH1 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PtpruB1AUH1 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
PtpruB1AUH1 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PtpruB1AUH1 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PtpruB1AUH1 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PtpruB1AUH1 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PtpruB1AUH1 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PtpruB1AUH1 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PtpruB1AUH1 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PtpruB1AUH1 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PtpruB1AUH1 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PtpruB1AUH1 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
PtpruB1AUH1 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PtpruB1AUH1 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PtpruB1AUH1 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PtpruB1AUH1 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PtpruB1AUH1 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PtpruB1AUH1 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PtpruB1AUH1 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PtpruB1AUH1 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PtpruB1AUH1 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PtpruB1AUH1 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
PtpruB1AUH1 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
PtpruB1AUH1 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
PtpruB1AUH1 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PtpruB1AUH1 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PtpruB1AUH1 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
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