Protein–RNA interactions for Protein: B1AQJ2

Usp36, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 36, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,098 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp36B1AQJ2 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Usp36B1AQJ2 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Usp36B1AQJ2 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Usp36B1AQJ2 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC19■□□□□ 0.63
Usp36B1AQJ2 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Usp36B1AQJ2 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Usp36B1AQJ2 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Usp36B1AQJ2 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Usp36B1AQJ2 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Usp36B1AQJ2 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Usp36B1AQJ2 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Usp36B1AQJ2 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Usp36B1AQJ2 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Usp36B1AQJ2 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Usp36B1AQJ2 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Usp36B1AQJ2 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Usp36B1AQJ2 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Usp36B1AQJ2 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Usp36B1AQJ2 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Usp36B1AQJ2 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Usp36B1AQJ2 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Usp36B1AQJ2 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Usp36B1AQJ2 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Usp36B1AQJ2 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Usp36B1AQJ2 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Usp36B1AQJ2 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Usp36B1AQJ2 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Usp36B1AQJ2 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Usp36B1AQJ2 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Usp36B1AQJ2 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Usp36B1AQJ2 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Usp36B1AQJ2 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Usp36B1AQJ2 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Usp36B1AQJ2 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Usp36B1AQJ2 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Usp36B1AQJ2 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Usp36B1AQJ2 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Usp36B1AQJ2 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Usp36B1AQJ2 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Usp36B1AQJ2 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Usp36B1AQJ2 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Usp36B1AQJ2 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Usp36B1AQJ2 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Usp36B1AQJ2 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Usp36B1AQJ2 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Usp36B1AQJ2 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Usp36B1AQJ2 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Usp36B1AQJ2 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Usp36B1AQJ2 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Usp36B1AQJ2 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Usp36B1AQJ2 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Usp36B1AQJ2 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Usp36B1AQJ2 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Usp36B1AQJ2 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Usp36B1AQJ2 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Usp36B1AQJ2 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Usp36B1AQJ2 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Usp36B1AQJ2 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Usp36B1AQJ2 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Usp36B1AQJ2 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Usp36B1AQJ2 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Usp36B1AQJ2 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Usp36B1AQJ2 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Usp36B1AQJ2 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Usp36B1AQJ2 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Usp36B1AQJ2 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Usp36B1AQJ2 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Usp36B1AQJ2 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Usp36B1AQJ2 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Usp36B1AQJ2 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Usp36B1AQJ2 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Usp36B1AQJ2 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Usp36B1AQJ2 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Usp36B1AQJ2 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Usp36B1AQJ2 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Usp36B1AQJ2 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Usp36B1AQJ2 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Usp36B1AQJ2 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Usp36B1AQJ2 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Usp36B1AQJ2 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Usp36B1AQJ2 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Usp36B1AQJ2 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Usp36B1AQJ2 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Usp36B1AQJ2 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Usp36B1AQJ2 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Usp36B1AQJ2 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Usp36B1AQJ2 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Usp36B1AQJ2 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Usp36B1AQJ2 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Usp36B1AQJ2 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Usp36B1AQJ2 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Usp36B1AQJ2 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Usp36B1AQJ2 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Usp36B1AQJ2 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Usp36B1AQJ2 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Usp36B1AQJ2 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Usp36B1AQJ2 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Usp36B1AQJ2 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Usp36B1AQJ2 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Usp36B1AQJ2 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms