Protein–RNA interactions for Protein: A2RT81

Rnf39, MCG22610, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf39A2RT81 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rnf39A2RT81 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rnf39A2RT81 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rnf39A2RT81 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rnf39A2RT81 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rnf39A2RT81 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rnf39A2RT81 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rnf39A2RT81 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rnf39A2RT81 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.79
Rnf39A2RT81 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Rnf39A2RT81 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rnf39A2RT81 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rnf39A2RT81 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rnf39A2RT81 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rnf39A2RT81 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rnf39A2RT81 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rnf39A2RT81 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rnf39A2RT81 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rnf39A2RT81 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rnf39A2RT81 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Rnf39A2RT81 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rnf39A2RT81 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rnf39A2RT81 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rnf39A2RT81 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rnf39A2RT81 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rnf39A2RT81 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rnf39A2RT81 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rnf39A2RT81 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rnf39A2RT81 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rnf39A2RT81 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rnf39A2RT81 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rnf39A2RT81 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rnf39A2RT81 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rnf39A2RT81 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rnf39A2RT81 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rnf39A2RT81 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rnf39A2RT81 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rnf39A2RT81 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rnf39A2RT81 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rnf39A2RT81 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rnf39A2RT81 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rnf39A2RT81 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rnf39A2RT81 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rnf39A2RT81 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rnf39A2RT81 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rnf39A2RT81 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rnf39A2RT81 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Rnf39A2RT81 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rnf39A2RT81 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rnf39A2RT81 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rnf39A2RT81 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Rnf39A2RT81 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rnf39A2RT81 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rnf39A2RT81 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rnf39A2RT81 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Rnf39A2RT81 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rnf39A2RT81 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rnf39A2RT81 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rnf39A2RT81 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rnf39A2RT81 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rnf39A2RT81 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Rnf39A2RT81 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rnf39A2RT81 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rnf39A2RT81 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rnf39A2RT81 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rnf39A2RT81 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rnf39A2RT81 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rnf39A2RT81 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rnf39A2RT81 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rnf39A2RT81 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rnf39A2RT81 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rnf39A2RT81 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rnf39A2RT81 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rnf39A2RT81 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rnf39A2RT81 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rnf39A2RT81 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rnf39A2RT81 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rnf39A2RT81 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rnf39A2RT81 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rnf39A2RT81 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rnf39A2RT81 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rnf39A2RT81 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rnf39A2RT81 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rnf39A2RT81 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Rnf39A2RT81 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rnf39A2RT81 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rnf39A2RT81 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rnf39A2RT81 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rnf39A2RT81 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Rnf39A2RT81 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rnf39A2RT81 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rnf39A2RT81 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rnf39A2RT81 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rnf39A2RT81 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rnf39A2RT81 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Rnf39A2RT81 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Rnf39A2RT81 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Rnf39A2RT81 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Rnf39A2RT81 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Rnf39A2RT81 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms