Protein–RNA interactions for Protein: A2RT60

Htra4, Serine protease HTRA4, mousemouse

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Htra4A2RT60 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Htra4A2RT60 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Htra4A2RT60 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Htra4A2RT60 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Htra4A2RT60 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Htra4A2RT60 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Htra4A2RT60 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Htra4A2RT60 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Htra4A2RT60 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Htra4A2RT60 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Htra4A2RT60 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Htra4A2RT60 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Htra4A2RT60 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Htra4A2RT60 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Htra4A2RT60 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Htra4A2RT60 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Htra4A2RT60 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Htra4A2RT60 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Htra4A2RT60 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Htra4A2RT60 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Htra4A2RT60 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Htra4A2RT60 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Htra4A2RT60 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Htra4A2RT60 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Htra4A2RT60 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Htra4A2RT60 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Htra4A2RT60 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Htra4A2RT60 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Htra4A2RT60 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Htra4A2RT60 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Htra4A2RT60 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Htra4A2RT60 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Htra4A2RT60 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Htra4A2RT60 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Htra4A2RT60 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Htra4A2RT60 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Htra4A2RT60 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Htra4A2RT60 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Htra4A2RT60 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Htra4A2RT60 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Htra4A2RT60 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Htra4A2RT60 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Htra4A2RT60 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Htra4A2RT60 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Htra4A2RT60 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Htra4A2RT60 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Htra4A2RT60 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Htra4A2RT60 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Htra4A2RT60 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Htra4A2RT60 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Htra4A2RT60 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Htra4A2RT60 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Htra4A2RT60 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Htra4A2RT60 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Htra4A2RT60 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Htra4A2RT60 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Htra4A2RT60 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Htra4A2RT60 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Htra4A2RT60 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Htra4A2RT60 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Htra4A2RT60 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Htra4A2RT60 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Htra4A2RT60 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Htra4A2RT60 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Htra4A2RT60 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Htra4A2RT60 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Htra4A2RT60 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Htra4A2RT60 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Htra4A2RT60 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Htra4A2RT60 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Htra4A2RT60 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Htra4A2RT60 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Htra4A2RT60 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Htra4A2RT60 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Htra4A2RT60 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Htra4A2RT60 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Htra4A2RT60 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Htra4A2RT60 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Htra4A2RT60 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Htra4A2RT60 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Htra4A2RT60 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Htra4A2RT60 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Htra4A2RT60 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Htra4A2RT60 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Htra4A2RT60 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Htra4A2RT60 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Htra4A2RT60 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Htra4A2RT60 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Htra4A2RT60 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Htra4A2RT60 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Htra4A2RT60 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Htra4A2RT60 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Htra4A2RT60 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Htra4A2RT60 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Htra4A2RT60 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Htra4A2RT60 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Htra4A2RT60 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Htra4A2RT60 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Htra4A2RT60 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Htra4A2RT60 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms