Protein–RNA interactions for Protein: A2RSY6

Trmt1l, TRMT1-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 728 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trmt1lA2RSY6 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trmt1lA2RSY6 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trmt1lA2RSY6 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trmt1lA2RSY6 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trmt1lA2RSY6 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trmt1lA2RSY6 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trmt1lA2RSY6 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trmt1lA2RSY6 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trmt1lA2RSY6 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Trmt1lA2RSY6 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trmt1lA2RSY6 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trmt1lA2RSY6 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trmt1lA2RSY6 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trmt1lA2RSY6 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trmt1lA2RSY6 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trmt1lA2RSY6 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trmt1lA2RSY6 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trmt1lA2RSY6 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trmt1lA2RSY6 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trmt1lA2RSY6 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trmt1lA2RSY6 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trmt1lA2RSY6 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trmt1lA2RSY6 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trmt1lA2RSY6 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trmt1lA2RSY6 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trmt1lA2RSY6 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Trmt1lA2RSY6 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trmt1lA2RSY6 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trmt1lA2RSY6 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trmt1lA2RSY6 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trmt1lA2RSY6 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trmt1lA2RSY6 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trmt1lA2RSY6 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trmt1lA2RSY6 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trmt1lA2RSY6 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trmt1lA2RSY6 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trmt1lA2RSY6 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trmt1lA2RSY6 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trmt1lA2RSY6 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trmt1lA2RSY6 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trmt1lA2RSY6 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Trmt1lA2RSY6 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Trmt1lA2RSY6 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trmt1lA2RSY6 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trmt1lA2RSY6 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trmt1lA2RSY6 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trmt1lA2RSY6 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trmt1lA2RSY6 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trmt1lA2RSY6 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trmt1lA2RSY6 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trmt1lA2RSY6 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trmt1lA2RSY6 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trmt1lA2RSY6 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trmt1lA2RSY6 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trmt1lA2RSY6 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trmt1lA2RSY6 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trmt1lA2RSY6 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trmt1lA2RSY6 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trmt1lA2RSY6 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trmt1lA2RSY6 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trmt1lA2RSY6 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trmt1lA2RSY6 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trmt1lA2RSY6 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trmt1lA2RSY6 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trmt1lA2RSY6 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trmt1lA2RSY6 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trmt1lA2RSY6 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trmt1lA2RSY6 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trmt1lA2RSY6 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Trmt1lA2RSY6 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Trmt1lA2RSY6 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Trmt1lA2RSY6 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Trmt1lA2RSY6 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Trmt1lA2RSY6 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trmt1lA2RSY6 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trmt1lA2RSY6 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trmt1lA2RSY6 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trmt1lA2RSY6 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trmt1lA2RSY6 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trmt1lA2RSY6 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trmt1lA2RSY6 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trmt1lA2RSY6 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trmt1lA2RSY6 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trmt1lA2RSY6 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trmt1lA2RSY6 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trmt1lA2RSY6 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trmt1lA2RSY6 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Trmt1lA2RSY6 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trmt1lA2RSY6 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trmt1lA2RSY6 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trmt1lA2RSY6 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Trmt1lA2RSY6 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trmt1lA2RSY6 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Trmt1lA2RSY6 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Trmt1lA2RSY6 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Trmt1lA2RSY6 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Trmt1lA2RSY6 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Trmt1lA2RSY6 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Trmt1lA2RSY6 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Trmt1lA2RSY6 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms