Protein–RNA interactions for Protein: A2ASI5

Scn3a, Sodium channel protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,947 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn3aA2ASI5 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Scn3aA2ASI5 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Scn3aA2ASI5 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Scn3aA2ASI5 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Scn3aA2ASI5 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Scn3aA2ASI5 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Scn3aA2ASI5 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Scn3aA2ASI5 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Scn3aA2ASI5 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Scn3aA2ASI5 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Scn3aA2ASI5 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Scn3aA2ASI5 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Scn3aA2ASI5 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Scn3aA2ASI5 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Scn3aA2ASI5 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Scn3aA2ASI5 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Scn3aA2ASI5 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Scn3aA2ASI5 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Scn3aA2ASI5 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Scn3aA2ASI5 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Scn3aA2ASI5 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Scn3aA2ASI5 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Scn3aA2ASI5 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Scn3aA2ASI5 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Scn3aA2ASI5 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Scn3aA2ASI5 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Scn3aA2ASI5 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Scn3aA2ASI5 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Scn3aA2ASI5 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Scn3aA2ASI5 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Scn3aA2ASI5 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Scn3aA2ASI5 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Scn3aA2ASI5 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Scn3aA2ASI5 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Scn3aA2ASI5 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Scn3aA2ASI5 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Scn3aA2ASI5 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Scn3aA2ASI5 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Scn3aA2ASI5 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Scn3aA2ASI5 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Scn3aA2ASI5 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Scn3aA2ASI5 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Scn3aA2ASI5 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Scn3aA2ASI5 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Scn3aA2ASI5 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Scn3aA2ASI5 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Scn3aA2ASI5 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Scn3aA2ASI5 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Scn3aA2ASI5 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Scn3aA2ASI5 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Scn3aA2ASI5 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Scn3aA2ASI5 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Scn3aA2ASI5 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Scn3aA2ASI5 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Scn3aA2ASI5 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Scn3aA2ASI5 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Scn3aA2ASI5 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Scn3aA2ASI5 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Scn3aA2ASI5 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Scn3aA2ASI5 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Scn3aA2ASI5 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Scn3aA2ASI5 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Scn3aA2ASI5 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Scn3aA2ASI5 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Scn3aA2ASI5 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Scn3aA2ASI5 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Scn3aA2ASI5 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Scn3aA2ASI5 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Scn3aA2ASI5 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Scn3aA2ASI5 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Scn3aA2ASI5 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Scn3aA2ASI5 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Scn3aA2ASI5 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Scn3aA2ASI5 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Scn3aA2ASI5 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Scn3aA2ASI5 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Scn3aA2ASI5 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Scn3aA2ASI5 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Scn3aA2ASI5 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Scn3aA2ASI5 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Scn3aA2ASI5 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.31
Scn3aA2ASI5 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Scn3aA2ASI5 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Scn3aA2ASI5 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Scn3aA2ASI5 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Scn3aA2ASI5 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Scn3aA2ASI5 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Scn3aA2ASI5 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Scn3aA2ASI5 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Scn3aA2ASI5 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Scn3aA2ASI5 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Scn3aA2ASI5 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Scn3aA2ASI5 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Scn3aA2ASI5 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Scn3aA2ASI5 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Scn3aA2ASI5 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Scn3aA2ASI5 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Scn3aA2ASI5 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Scn3aA2ASI5 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Scn3aA2ASI5 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms