Protein–RNA interactions for Protein: A2ANE1

Rhox3f, Reproductive homeobox 3F, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox3fA2ANE1 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rhox3fA2ANE1 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rhox3fA2ANE1 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rhox3fA2ANE1 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rhox3fA2ANE1 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rhox3fA2ANE1 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rhox3fA2ANE1 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rhox3fA2ANE1 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rhox3fA2ANE1 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rhox3fA2ANE1 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rhox3fA2ANE1 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rhox3fA2ANE1 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rhox3fA2ANE1 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rhox3fA2ANE1 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rhox3fA2ANE1 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rhox3fA2ANE1 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rhox3fA2ANE1 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rhox3fA2ANE1 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rhox3fA2ANE1 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rhox3fA2ANE1 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rhox3fA2ANE1 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rhox3fA2ANE1 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rhox3fA2ANE1 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rhox3fA2ANE1 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rhox3fA2ANE1 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rhox3fA2ANE1 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rhox3fA2ANE1 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rhox3fA2ANE1 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rhox3fA2ANE1 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rhox3fA2ANE1 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rhox3fA2ANE1 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rhox3fA2ANE1 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rhox3fA2ANE1 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rhox3fA2ANE1 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rhox3fA2ANE1 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rhox3fA2ANE1 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rhox3fA2ANE1 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rhox3fA2ANE1 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rhox3fA2ANE1 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rhox3fA2ANE1 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rhox3fA2ANE1 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rhox3fA2ANE1 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rhox3fA2ANE1 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Rhox3fA2ANE1 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rhox3fA2ANE1 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rhox3fA2ANE1 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rhox3fA2ANE1 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rhox3fA2ANE1 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rhox3fA2ANE1 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rhox3fA2ANE1 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rhox3fA2ANE1 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rhox3fA2ANE1 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rhox3fA2ANE1 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Rhox3fA2ANE1 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Rhox3fA2ANE1 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Rhox3fA2ANE1 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rhox3fA2ANE1 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rhox3fA2ANE1 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rhox3fA2ANE1 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Rhox3fA2ANE1 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rhox3fA2ANE1 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rhox3fA2ANE1 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Rhox3fA2ANE1 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rhox3fA2ANE1 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rhox3fA2ANE1 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rhox3fA2ANE1 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rhox3fA2ANE1 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rhox3fA2ANE1 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rhox3fA2ANE1 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rhox3fA2ANE1 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rhox3fA2ANE1 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rhox3fA2ANE1 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rhox3fA2ANE1 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rhox3fA2ANE1 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rhox3fA2ANE1 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rhox3fA2ANE1 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rhox3fA2ANE1 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rhox3fA2ANE1 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rhox3fA2ANE1 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rhox3fA2ANE1 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rhox3fA2ANE1 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rhox3fA2ANE1 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rhox3fA2ANE1 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rhox3fA2ANE1 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Rhox3fA2ANE1 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rhox3fA2ANE1 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rhox3fA2ANE1 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rhox3fA2ANE1 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rhox3fA2ANE1 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rhox3fA2ANE1 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rhox3fA2ANE1 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rhox3fA2ANE1 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rhox3fA2ANE1 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rhox3fA2ANE1 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rhox3fA2ANE1 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rhox3fA2ANE1 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rhox3fA2ANE1 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rhox3fA2ANE1 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rhox3fA2ANE1 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rhox3fA2ANE1 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms