Protein–RNA interactions for Protein: A2AJB9

Lcn6, LCN6 isoform alpha, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lcn6A2AJB9 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lcn6A2AJB9 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lcn6A2AJB9 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lcn6A2AJB9 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lcn6A2AJB9 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lcn6A2AJB9 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lcn6A2AJB9 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lcn6A2AJB9 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Lcn6A2AJB9 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lcn6A2AJB9 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lcn6A2AJB9 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lcn6A2AJB9 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lcn6A2AJB9 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Lcn6A2AJB9 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lcn6A2AJB9 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lcn6A2AJB9 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lcn6A2AJB9 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lcn6A2AJB9 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lcn6A2AJB9 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Lcn6A2AJB9 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lcn6A2AJB9 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lcn6A2AJB9 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lcn6A2AJB9 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lcn6A2AJB9 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lcn6A2AJB9 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lcn6A2AJB9 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lcn6A2AJB9 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lcn6A2AJB9 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lcn6A2AJB9 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lcn6A2AJB9 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lcn6A2AJB9 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lcn6A2AJB9 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lcn6A2AJB9 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lcn6A2AJB9 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lcn6A2AJB9 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lcn6A2AJB9 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lcn6A2AJB9 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lcn6A2AJB9 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lcn6A2AJB9 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lcn6A2AJB9 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lcn6A2AJB9 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lcn6A2AJB9 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lcn6A2AJB9 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Lcn6A2AJB9 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lcn6A2AJB9 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Lcn6A2AJB9 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Lcn6A2AJB9 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Lcn6A2AJB9 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Lcn6A2AJB9 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Lcn6A2AJB9 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Lcn6A2AJB9 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Lcn6A2AJB9 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Lcn6A2AJB9 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Lcn6A2AJB9 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Lcn6A2AJB9 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Lcn6A2AJB9 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Lcn6A2AJB9 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Lcn6A2AJB9 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Lcn6A2AJB9 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Lcn6A2AJB9 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Lcn6A2AJB9 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Lcn6A2AJB9 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lcn6A2AJB9 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Lcn6A2AJB9 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Lcn6A2AJB9 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lcn6A2AJB9 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lcn6A2AJB9 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lcn6A2AJB9 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lcn6A2AJB9 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lcn6A2AJB9 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lcn6A2AJB9 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Lcn6A2AJB9 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Lcn6A2AJB9 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Lcn6A2AJB9 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lcn6A2AJB9 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lcn6A2AJB9 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lcn6A2AJB9 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lcn6A2AJB9 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lcn6A2AJB9 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lcn6A2AJB9 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lcn6A2AJB9 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lcn6A2AJB9 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Lcn6A2AJB9 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Lcn6A2AJB9 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Lcn6A2AJB9 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Lcn6A2AJB9 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Lcn6A2AJB9 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Lcn6A2AJB9 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Lcn6A2AJB9 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lcn6A2AJB9 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lcn6A2AJB9 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lcn6A2AJB9 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lcn6A2AJB9 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lcn6A2AJB9 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lcn6A2AJB9 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lcn6A2AJB9 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lcn6A2AJB9 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lcn6A2AJB9 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lcn6A2AJB9 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lcn6A2AJB9 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms