Protein–RNA interactions for Protein: A2AB62

1700023F06Rik, RIKEN cDNA 1700023F06 gene, mousemouse

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700023F06RikA2AB62 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
1700023F06RikA2AB62 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
1700023F06RikA2AB62 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
1700023F06RikA2AB62 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
1700023F06RikA2AB62 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
1700023F06RikA2AB62 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
1700023F06RikA2AB62 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
1700023F06RikA2AB62 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
1700023F06RikA2AB62 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
1700023F06RikA2AB62 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
1700023F06RikA2AB62 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
1700023F06RikA2AB62 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
1700023F06RikA2AB62 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
1700023F06RikA2AB62 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
1700023F06RikA2AB62 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
1700023F06RikA2AB62 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
1700023F06RikA2AB62 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
1700023F06RikA2AB62 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
1700023F06RikA2AB62 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
1700023F06RikA2AB62 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
1700023F06RikA2AB62 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
1700023F06RikA2AB62 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
1700023F06RikA2AB62 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
1700023F06RikA2AB62 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
1700023F06RikA2AB62 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
1700023F06RikA2AB62 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
1700023F06RikA2AB62 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
1700023F06RikA2AB62 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
1700023F06RikA2AB62 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
1700023F06RikA2AB62 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
1700023F06RikA2AB62 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
1700023F06RikA2AB62 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
1700023F06RikA2AB62 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
1700023F06RikA2AB62 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
1700023F06RikA2AB62 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
1700023F06RikA2AB62 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
1700023F06RikA2AB62 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
1700023F06RikA2AB62 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
1700023F06RikA2AB62 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
1700023F06RikA2AB62 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
1700023F06RikA2AB62 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
1700023F06RikA2AB62 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
1700023F06RikA2AB62 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
1700023F06RikA2AB62 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
1700023F06RikA2AB62 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
1700023F06RikA2AB62 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
1700023F06RikA2AB62 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
1700023F06RikA2AB62 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
1700023F06RikA2AB62 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
1700023F06RikA2AB62 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
1700023F06RikA2AB62 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
1700023F06RikA2AB62 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
1700023F06RikA2AB62 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
1700023F06RikA2AB62 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
1700023F06RikA2AB62 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
1700023F06RikA2AB62 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
1700023F06RikA2AB62 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
1700023F06RikA2AB62 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
1700023F06RikA2AB62 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
1700023F06RikA2AB62 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
1700023F06RikA2AB62 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
1700023F06RikA2AB62 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
1700023F06RikA2AB62 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
1700023F06RikA2AB62 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
1700023F06RikA2AB62 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
1700023F06RikA2AB62 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
1700023F06RikA2AB62 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
1700023F06RikA2AB62 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
1700023F06RikA2AB62 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
1700023F06RikA2AB62 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
1700023F06RikA2AB62 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
1700023F06RikA2AB62 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
1700023F06RikA2AB62 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
1700023F06RikA2AB62 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
1700023F06RikA2AB62 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
1700023F06RikA2AB62 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
1700023F06RikA2AB62 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
1700023F06RikA2AB62 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
1700023F06RikA2AB62 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
1700023F06RikA2AB62 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
1700023F06RikA2AB62 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
1700023F06RikA2AB62 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
1700023F06RikA2AB62 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
1700023F06RikA2AB62 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
1700023F06RikA2AB62 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
1700023F06RikA2AB62 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
1700023F06RikA2AB62 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
1700023F06RikA2AB62 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
1700023F06RikA2AB62 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
1700023F06RikA2AB62 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
1700023F06RikA2AB62 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
1700023F06RikA2AB62 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
1700023F06RikA2AB62 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
1700023F06RikA2AB62 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
1700023F06RikA2AB62 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
1700023F06RikA2AB62 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
1700023F06RikA2AB62 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
1700023F06RikA2AB62 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
1700023F06RikA2AB62 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
1700023F06RikA2AB62 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms