Protein–RNA interactions for Protein: A2A6C4

Sppl2c, Signal peptide peptidase-like 2C, mousemouse

Predictions only

Length 690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sppl2cA2A6C4 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sppl2cA2A6C4 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sppl2cA2A6C4 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sppl2cA2A6C4 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sppl2cA2A6C4 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sppl2cA2A6C4 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sppl2cA2A6C4 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sppl2cA2A6C4 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sppl2cA2A6C4 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sppl2cA2A6C4 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sppl2cA2A6C4 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sppl2cA2A6C4 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sppl2cA2A6C4 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sppl2cA2A6C4 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sppl2cA2A6C4 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sppl2cA2A6C4 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sppl2cA2A6C4 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sppl2cA2A6C4 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sppl2cA2A6C4 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sppl2cA2A6C4 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sppl2cA2A6C4 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sppl2cA2A6C4 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sppl2cA2A6C4 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sppl2cA2A6C4 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sppl2cA2A6C4 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sppl2cA2A6C4 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sppl2cA2A6C4 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sppl2cA2A6C4 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sppl2cA2A6C4 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Sppl2cA2A6C4 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sppl2cA2A6C4 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sppl2cA2A6C4 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sppl2cA2A6C4 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sppl2cA2A6C4 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sppl2cA2A6C4 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sppl2cA2A6C4 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sppl2cA2A6C4 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sppl2cA2A6C4 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sppl2cA2A6C4 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sppl2cA2A6C4 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sppl2cA2A6C4 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sppl2cA2A6C4 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sppl2cA2A6C4 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sppl2cA2A6C4 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sppl2cA2A6C4 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sppl2cA2A6C4 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sppl2cA2A6C4 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sppl2cA2A6C4 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sppl2cA2A6C4 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sppl2cA2A6C4 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sppl2cA2A6C4 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sppl2cA2A6C4 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sppl2cA2A6C4 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sppl2cA2A6C4 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sppl2cA2A6C4 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sppl2cA2A6C4 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sppl2cA2A6C4 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sppl2cA2A6C4 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Sppl2cA2A6C4 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Sppl2cA2A6C4 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sppl2cA2A6C4 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sppl2cA2A6C4 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sppl2cA2A6C4 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sppl2cA2A6C4 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sppl2cA2A6C4 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sppl2cA2A6C4 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sppl2cA2A6C4 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sppl2cA2A6C4 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sppl2cA2A6C4 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sppl2cA2A6C4 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sppl2cA2A6C4 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Sppl2cA2A6C4 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sppl2cA2A6C4 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sppl2cA2A6C4 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sppl2cA2A6C4 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sppl2cA2A6C4 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sppl2cA2A6C4 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sppl2cA2A6C4 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sppl2cA2A6C4 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sppl2cA2A6C4 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sppl2cA2A6C4 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sppl2cA2A6C4 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sppl2cA2A6C4 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sppl2cA2A6C4 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sppl2cA2A6C4 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sppl2cA2A6C4 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Sppl2cA2A6C4 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sppl2cA2A6C4 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sppl2cA2A6C4 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sppl2cA2A6C4 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sppl2cA2A6C4 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sppl2cA2A6C4 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sppl2cA2A6C4 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Sppl2cA2A6C4 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sppl2cA2A6C4 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sppl2cA2A6C4 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sppl2cA2A6C4 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sppl2cA2A6C4 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sppl2cA2A6C4 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sppl2cA2A6C4 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 100.6 ms