Protein–RNA interactions for Protein: A0A0R4J054

4921501E09Rik, RIKEN cDNA 4921501E09, mousemouse

Predictions only

Length 908 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4921501E09RikA0A0R4J054 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
4921501E09RikA0A0R4J054 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.79
4921501E09RikA0A0R4J054 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
4921501E09RikA0A0R4J054 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
4921501E09RikA0A0R4J054 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
4921501E09RikA0A0R4J054 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
4921501E09RikA0A0R4J054 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
4921501E09RikA0A0R4J054 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
4921501E09RikA0A0R4J054 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
4921501E09RikA0A0R4J054 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
4921501E09RikA0A0R4J054 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
4921501E09RikA0A0R4J054 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
4921501E09RikA0A0R4J054 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
4921501E09RikA0A0R4J054 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
4921501E09RikA0A0R4J054 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
4921501E09RikA0A0R4J054 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
4921501E09RikA0A0R4J054 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
4921501E09RikA0A0R4J054 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
4921501E09RikA0A0R4J054 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
4921501E09RikA0A0R4J054 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
4921501E09RikA0A0R4J054 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
4921501E09RikA0A0R4J054 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
4921501E09RikA0A0R4J054 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
4921501E09RikA0A0R4J054 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
4921501E09RikA0A0R4J054 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
4921501E09RikA0A0R4J054 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
4921501E09RikA0A0R4J054 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
4921501E09RikA0A0R4J054 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
4921501E09RikA0A0R4J054 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
4921501E09RikA0A0R4J054 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
4921501E09RikA0A0R4J054 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
4921501E09RikA0A0R4J054 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
4921501E09RikA0A0R4J054 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
4921501E09RikA0A0R4J054 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
4921501E09RikA0A0R4J054 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
4921501E09RikA0A0R4J054 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
4921501E09RikA0A0R4J054 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
4921501E09RikA0A0R4J054 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
4921501E09RikA0A0R4J054 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
4921501E09RikA0A0R4J054 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
4921501E09RikA0A0R4J054 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
4921501E09RikA0A0R4J054 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
4921501E09RikA0A0R4J054 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
4921501E09RikA0A0R4J054 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
4921501E09RikA0A0R4J054 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
4921501E09RikA0A0R4J054 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
4921501E09RikA0A0R4J054 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
4921501E09RikA0A0R4J054 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
4921501E09RikA0A0R4J054 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
4921501E09RikA0A0R4J054 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
4921501E09RikA0A0R4J054 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
4921501E09RikA0A0R4J054 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
4921501E09RikA0A0R4J054 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
4921501E09RikA0A0R4J054 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
4921501E09RikA0A0R4J054 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
4921501E09RikA0A0R4J054 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
4921501E09RikA0A0R4J054 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
4921501E09RikA0A0R4J054 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
4921501E09RikA0A0R4J054 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
4921501E09RikA0A0R4J054 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
4921501E09RikA0A0R4J054 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
4921501E09RikA0A0R4J054 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
4921501E09RikA0A0R4J054 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
4921501E09RikA0A0R4J054 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
4921501E09RikA0A0R4J054 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
4921501E09RikA0A0R4J054 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
4921501E09RikA0A0R4J054 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
4921501E09RikA0A0R4J054 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
4921501E09RikA0A0R4J054 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
4921501E09RikA0A0R4J054 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
4921501E09RikA0A0R4J054 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
4921501E09RikA0A0R4J054 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
4921501E09RikA0A0R4J054 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
4921501E09RikA0A0R4J054 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
4921501E09RikA0A0R4J054 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
4921501E09RikA0A0R4J054 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
4921501E09RikA0A0R4J054 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
4921501E09RikA0A0R4J054 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
4921501E09RikA0A0R4J054 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
4921501E09RikA0A0R4J054 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
4921501E09RikA0A0R4J054 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
4921501E09RikA0A0R4J054 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
4921501E09RikA0A0R4J054 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
4921501E09RikA0A0R4J054 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
4921501E09RikA0A0R4J054 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
4921501E09RikA0A0R4J054 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
4921501E09RikA0A0R4J054 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
4921501E09RikA0A0R4J054 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
4921501E09RikA0A0R4J054 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
4921501E09RikA0A0R4J054 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
4921501E09RikA0A0R4J054 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
4921501E09RikA0A0R4J054 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
4921501E09RikA0A0R4J054 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
4921501E09RikA0A0R4J054 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
4921501E09RikA0A0R4J054 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms