Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1P5

Trbv26, T cell receptor beta, variable 26 (Fragment), mousemouse

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Length 115 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv26A0A0B4J1P5 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trbv26A0A0B4J1P5 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trbv26A0A0B4J1P5 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trbv26A0A0B4J1P5 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trbv26A0A0B4J1P5 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trbv26A0A0B4J1P5 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trbv26A0A0B4J1P5 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trbv26A0A0B4J1P5 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trbv26A0A0B4J1P5 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Trbv26A0A0B4J1P5 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trbv26A0A0B4J1P5 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trbv26A0A0B4J1P5 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trbv26A0A0B4J1P5 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trbv26A0A0B4J1P5 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trbv26A0A0B4J1P5 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trbv26A0A0B4J1P5 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trbv26A0A0B4J1P5 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trbv26A0A0B4J1P5 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trbv26A0A0B4J1P5 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trbv26A0A0B4J1P5 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trbv26A0A0B4J1P5 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trbv26A0A0B4J1P5 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trbv26A0A0B4J1P5 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trbv26A0A0B4J1P5 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trbv26A0A0B4J1P5 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trbv26A0A0B4J1P5 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trbv26A0A0B4J1P5 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Trbv26A0A0B4J1P5 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trbv26A0A0B4J1P5 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trbv26A0A0B4J1P5 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trbv26A0A0B4J1P5 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trbv26A0A0B4J1P5 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trbv26A0A0B4J1P5 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trbv26A0A0B4J1P5 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trbv26A0A0B4J1P5 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trbv26A0A0B4J1P5 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trbv26A0A0B4J1P5 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trbv26A0A0B4J1P5 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trbv26A0A0B4J1P5 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trbv26A0A0B4J1P5 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trbv26A0A0B4J1P5 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trbv26A0A0B4J1P5 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trbv26A0A0B4J1P5 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trbv26A0A0B4J1P5 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trbv26A0A0B4J1P5 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trbv26A0A0B4J1P5 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trbv26A0A0B4J1P5 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Trbv26A0A0B4J1P5 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Trbv26A0A0B4J1P5 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trbv26A0A0B4J1P5 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trbv26A0A0B4J1P5 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trbv26A0A0B4J1P5 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trbv26A0A0B4J1P5 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trbv26A0A0B4J1P5 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trbv26A0A0B4J1P5 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trbv26A0A0B4J1P5 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trbv26A0A0B4J1P5 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trbv26A0A0B4J1P5 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Trbv26A0A0B4J1P5 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trbv26A0A0B4J1P5 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trbv26A0A0B4J1P5 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trbv26A0A0B4J1P5 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trbv26A0A0B4J1P5 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trbv26A0A0B4J1P5 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trbv26A0A0B4J1P5 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trbv26A0A0B4J1P5 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trbv26A0A0B4J1P5 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trbv26A0A0B4J1P5 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Trbv26A0A0B4J1P5 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Trbv26A0A0B4J1P5 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Trbv26A0A0B4J1P5 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trbv26A0A0B4J1P5 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trbv26A0A0B4J1P5 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC17■□□□□ 0.31
Trbv26A0A0B4J1P5 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trbv26A0A0B4J1P5 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trbv26A0A0B4J1P5 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trbv26A0A0B4J1P5 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trbv26A0A0B4J1P5 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trbv26A0A0B4J1P5 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trbv26A0A0B4J1P5 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trbv26A0A0B4J1P5 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trbv26A0A0B4J1P5 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trbv26A0A0B4J1P5 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trbv26A0A0B4J1P5 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trbv26A0A0B4J1P5 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trbv26A0A0B4J1P5 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Trbv26A0A0B4J1P5 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Trbv26A0A0B4J1P5 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Trbv26A0A0B4J1P5 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trbv26A0A0B4J1P5 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trbv26A0A0B4J1P5 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trbv26A0A0B4J1P5 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trbv26A0A0B4J1P5 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trbv26A0A0B4J1P5 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trbv26A0A0B4J1P5 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trbv26A0A0B4J1P5 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trbv26A0A0B4J1P5 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trbv26A0A0B4J1P5 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trbv26A0A0B4J1P5 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trbv26A0A0B4J1P5 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
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