Protein–RNA interactions for Protein: Q9R233

Tapbp, Tapasin, mousemouse

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Length 465 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TapbpQ9R233 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
TapbpQ9R233 Fen1-202ENSMUST00000116542 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
TapbpQ9R233 Dbx2-201ENSMUST00000054244 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
TapbpQ9R233 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
TapbpQ9R233 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
TapbpQ9R233 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
TapbpQ9R233 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
TapbpQ9R233 Gpld1-201ENSMUST00000021773 5224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
TapbpQ9R233 Ces3b-201ENSMUST00000074403 1907 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
TapbpQ9R233 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
TapbpQ9R233 Csf1-201ENSMUST00000014743 4176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
TapbpQ9R233 Gm13553-201ENSMUST00000133025 1970 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
TapbpQ9R233 Rbm10-205ENSMUST00000115375 3698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
TapbpQ9R233 D130017N08Rik-203ENSMUST00000196629 2265 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
TapbpQ9R233 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
TapbpQ9R233 Acat1-201ENSMUST00000034547 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
TapbpQ9R233 Rsc1a1-201ENSMUST00000105782 1749 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
TapbpQ9R233 Nrap-203ENSMUST00000095947 5214 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
TapbpQ9R233 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
TapbpQ9R233 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
TapbpQ9R233 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
TapbpQ9R233 Epm2aip1-202ENSMUST00000135807 4245 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
TapbpQ9R233 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
TapbpQ9R233 Ints6l-207ENSMUST00000186445 3608 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
TapbpQ9R233 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
TapbpQ9R233 Bub3-203ENSMUST00000207442 3414 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
TapbpQ9R233 Pabpc1-201ENSMUST00000001809 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
TapbpQ9R233 Fosb-201ENSMUST00000003640 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
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TapbpQ9R233 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
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TapbpQ9R233 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
TapbpQ9R233 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
TapbpQ9R233 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
TapbpQ9R233 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
TapbpQ9R233 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
TapbpQ9R233 AC124171.1-201ENSMUST00000221151 567 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
TapbpQ9R233 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
TapbpQ9R233 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
TapbpQ9R233 Olfr541-203ENSMUST00000210357 1642 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
TapbpQ9R233 Gucy2e-203ENSMUST00000108665 3645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
TapbpQ9R233 4930431P19Rik-202ENSMUST00000207761 2959 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
TapbpQ9R233 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
TapbpQ9R233 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
TapbpQ9R233 Sec23a-201ENSMUST00000021375 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
TapbpQ9R233 A130010J15Rik-204ENSMUST00000161235 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
TapbpQ9R233 Nnt-201ENSMUST00000069902 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
TapbpQ9R233 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
TapbpQ9R233 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
TapbpQ9R233 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
TapbpQ9R233 Rbms2-201ENSMUST00000092033 1481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
TapbpQ9R233 Kirrel3-209ENSMUST00000190549 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
TapbpQ9R233 Pcif1-201ENSMUST00000041643 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
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TapbpQ9R233 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
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TapbpQ9R233 Gm11525-201ENSMUST00000134436 2804 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
TapbpQ9R233 4932443L11Rik-202ENSMUST00000177130 2827 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
TapbpQ9R233 Olfm4-201ENSMUST00000088735 1640 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
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TapbpQ9R233 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
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TapbpQ9R233 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
TapbpQ9R233 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
TapbpQ9R233 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
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TapbpQ9R233 Fhit-201ENSMUST00000160340 1094 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
TapbpQ9R233 Fam166b-206ENSMUST00000171134 1198 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
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TapbpQ9R233 Mir3547-201ENSMUST00000175461 88 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
TapbpQ9R233 Fhit-208ENSMUST00000179394 453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
TapbpQ9R233 Gm18212-201ENSMUST00000211678 889 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
TapbpQ9R233 Gm32828-202ENSMUST00000219198 2111 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
TapbpQ9R233 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
TapbpQ9R233 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
TapbpQ9R233 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
TapbpQ9R233 Fut2-201ENSMUST00000069800 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
TapbpQ9R233 Snap29-201ENSMUST00000023449 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
TapbpQ9R233 Vrk1-201ENSMUST00000021539 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
TapbpQ9R233 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
TapbpQ9R233 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
TapbpQ9R233 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
TapbpQ9R233 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
TapbpQ9R233 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
TapbpQ9R233 Sowahc-201ENSMUST00000182161 4482 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
TapbpQ9R233 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
TapbpQ9R233 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
TapbpQ9R233 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
TapbpQ9R233 Gpr155-203ENSMUST00000112043 3284 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
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