Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES64

Ush1c, Harmonin, mousemouse

Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ush1cQ9ES64 Tmprss3-201ENSMUST00000024833 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ush1cQ9ES64 Inpp4a-208ENSMUST00000137266 2934 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ush1cQ9ES64 Lvrn-201ENSMUST00000025358 3219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ush1cQ9ES64 Bach1-201ENSMUST00000026703 5867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ush1cQ9ES64 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ush1cQ9ES64 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Ush1cQ9ES64 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Ush1cQ9ES64 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ush1cQ9ES64 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ush1cQ9ES64 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ush1cQ9ES64 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Ush1cQ9ES64 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ush1cQ9ES64 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Ush1cQ9ES64 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ush1cQ9ES64 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ush1cQ9ES64 Gm38089-201ENSMUST00000193585 1514 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Ush1cQ9ES64 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ush1cQ9ES64 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ush1cQ9ES64 Isl1-201ENSMUST00000036060 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ush1cQ9ES64 Cxcr5-202ENSMUST00000179828 2824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ush1cQ9ES64 Tia1-206ENSMUST00000113713 3108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ush1cQ9ES64 Samhd1-203ENSMUST00000109549 3245 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ush1cQ9ES64 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ush1cQ9ES64 Ncdn-201ENSMUST00000030637 3681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ush1cQ9ES64 Vwa5b2-207ENSMUST00000159780 4042 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ush1cQ9ES64 Csnk1a1-204ENSMUST00000165123 4083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ush1cQ9ES64 Scaf4-202ENSMUST00000163419 4169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ush1cQ9ES64 Ankrd52-201ENSMUST00000014642 6620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ush1cQ9ES64 Zfp773-201ENSMUST00000032622 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ush1cQ9ES64 Cpne9-201ENSMUST00000041203 2777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ush1cQ9ES64 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ush1cQ9ES64 Ddx56-201ENSMUST00000004507 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ush1cQ9ES64 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ush1cQ9ES64 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Ush1cQ9ES64 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ush1cQ9ES64 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ush1cQ9ES64 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Ush1cQ9ES64 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ush1cQ9ES64 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ush1cQ9ES64 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Ush1cQ9ES64 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Ush1cQ9ES64 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ush1cQ9ES64 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Ush1cQ9ES64 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ush1cQ9ES64 CT010486.3-201ENSMUST00000224555 811 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Ush1cQ9ES64 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ush1cQ9ES64 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ush1cQ9ES64 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ush1cQ9ES64 Mroh8-202ENSMUST00000143663 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ush1cQ9ES64 Tacc2-217ENSMUST00000209108 3310 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ush1cQ9ES64 Thsd4-206ENSMUST00000171654 8522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ush1cQ9ES64 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ush1cQ9ES64 Pitpnb-204ENSMUST00000200298 2632 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ush1cQ9ES64 Caprin1-202ENSMUST00000111147 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ush1cQ9ES64 Elovl7-201ENSMUST00000022207 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ush1cQ9ES64 Tfip11-201ENSMUST00000031288 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ush1cQ9ES64 Lrba-202ENSMUST00000192145 8843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ush1cQ9ES64 Atl2-202ENSMUST00000112437 3371 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ush1cQ9ES64 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Ush1cQ9ES64 Gm38901-201ENSMUST00000202448 3008 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ush1cQ9ES64 Fxyd5-212ENSMUST00000162733 2998 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ush1cQ9ES64 BC034090-201ENSMUST00000035914 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ush1cQ9ES64 Dscaml1-201ENSMUST00000034592 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ush1cQ9ES64 Tas1r2-202ENSMUST00000166773 2524 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ush1cQ9ES64 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ush1cQ9ES64 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ush1cQ9ES64 Arhgap11a-202ENSMUST00000110947 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ush1cQ9ES64 Acin1-203ENSMUST00000111484 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ush1cQ9ES64 Zcwpw1-201ENSMUST00000035852 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ush1cQ9ES64 Neurod6-201ENSMUST00000044767 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ush1cQ9ES64 Amotl1-201ENSMUST00000013220 8957 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ush1cQ9ES64 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ush1cQ9ES64 Zfp189-202ENSMUST00000107696 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ush1cQ9ES64 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Ush1cQ9ES64 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ush1cQ9ES64 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ush1cQ9ES64 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Ush1cQ9ES64 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Ush1cQ9ES64 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Ush1cQ9ES64 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ush1cQ9ES64 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ush1cQ9ES64 Slc45a4-201ENSMUST00000054266 4664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ush1cQ9ES64 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ush1cQ9ES64 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ush1cQ9ES64 Pck2-207ENSMUST00000226519 4625 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ush1cQ9ES64 Sh3gl2-201ENSMUST00000030212 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ush1cQ9ES64 AC207128.2-201ENSMUST00000223708 1924 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Ush1cQ9ES64 Gm19327-201ENSMUST00000220651 3271 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Ush1cQ9ES64 Trpv4-205ENSMUST00000112225 3226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ush1cQ9ES64 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ush1cQ9ES64 Ccdc15-206ENSMUST00000217238 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ush1cQ9ES64 Mybph-202ENSMUST00000191577 2320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ush1cQ9ES64 Spg20-203ENSMUST00000117341 2957 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ush1cQ9ES64 Asb8-204ENSMUST00000143400 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ush1cQ9ES64 Brat1-202ENSMUST00000100505 3431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ush1cQ9ES64 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ush1cQ9ES64 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ush1cQ9ES64 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Ush1cQ9ES64 Gal3st4-201ENSMUST00000100530 3162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ush1cQ9ES64 Ctcfl-202ENSMUST00000179693 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.2 ms