Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWX4

Rpusd4, Mitochondrial RNA pseudouridine synthase Rpusd4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd4Q9CWX4 Gtf2ird2-201ENSMUST00000016086 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rpusd4Q9CWX4 Phactr1-213ENSMUST00000148891 5307 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rpusd4Q9CWX4 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rpusd4Q9CWX4 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rpusd4Q9CWX4 Pcdhga10-201ENSMUST00000193404 4732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rpusd4Q9CWX4 Rprd1b-203ENSMUST00000109518 4399 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rpusd4Q9CWX4 Thrap3-201ENSMUST00000080919 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rpusd4Q9CWX4 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rpusd4Q9CWX4 Fam120b-201ENSMUST00000055352 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rpusd4Q9CWX4 Rab3gap2-204ENSMUST00000194740 4418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rpusd4Q9CWX4 Ddx54-201ENSMUST00000031598 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rpusd4Q9CWX4 Scn8a-203ENSMUST00000108908 7030 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rpusd4Q9CWX4 Siglec1-203ENSMUST00000110227 5790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rpusd4Q9CWX4 Nefl-201ENSMUST00000022639 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rpusd4Q9CWX4 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rpusd4Q9CWX4 Axl-201ENSMUST00000002677 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rpusd4Q9CWX4 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rpusd4Q9CWX4 Gm9877-201ENSMUST00000064271 2627 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Rpusd4Q9CWX4 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rpusd4Q9CWX4 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rpusd4Q9CWX4 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rpusd4Q9CWX4 Qsox1-201ENSMUST00000035325 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rpusd4Q9CWX4 Agrn-203ENSMUST00000105575 7262 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rpusd4Q9CWX4 Bms1-201ENSMUST00000032237 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rpusd4Q9CWX4 Rbm47-205ENSMUST00000167950 4895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rpusd4Q9CWX4 Glyctk-202ENSMUST00000112543 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rpusd4Q9CWX4 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rpusd4Q9CWX4 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rpusd4Q9CWX4 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rpusd4Q9CWX4 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rpusd4Q9CWX4 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rpusd4Q9CWX4 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Rpusd4Q9CWX4 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rpusd4Q9CWX4 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rpusd4Q9CWX4 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rpusd4Q9CWX4 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rpusd4Q9CWX4 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rpusd4Q9CWX4 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Rpusd4Q9CWX4 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Rpusd4Q9CWX4 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Rpusd4Q9CWX4 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Rpusd4Q9CWX4 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rpusd4Q9CWX4 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Rpusd4Q9CWX4 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rpusd4Q9CWX4 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rpusd4Q9CWX4 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rpusd4Q9CWX4 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rpusd4Q9CWX4 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rpusd4Q9CWX4 Eif3a-201ENSMUST00000025955 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rpusd4Q9CWX4 Gm45902-202ENSMUST00000140494 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rpusd4Q9CWX4 Thbs2-201ENSMUST00000170872 5922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rpusd4Q9CWX4 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rpusd4Q9CWX4 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rpusd4Q9CWX4 Gm32828-202ENSMUST00000219198 2111 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rpusd4Q9CWX4 Cad-204ENSMUST00000201182 6529 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rpusd4Q9CWX4 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rpusd4Q9CWX4 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rpusd4Q9CWX4 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Rpusd4Q9CWX4 Agpat3-211ENSMUST00000166360 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rpusd4Q9CWX4 Bahcc1-203ENSMUST00000122148 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rpusd4Q9CWX4 Gm37422-201ENSMUST00000193794 4718 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Rpusd4Q9CWX4 Mroh7-201ENSMUST00000106770 4346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rpusd4Q9CWX4 Cyb5b-201ENSMUST00000034400 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rpusd4Q9CWX4 Tcf7l2-207ENSMUST00000111653 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rpusd4Q9CWX4 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rpusd4Q9CWX4 Hmbox1-202ENSMUST00000067843 2931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rpusd4Q9CWX4 Col9a1-202ENSMUST00000088349 3059 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rpusd4Q9CWX4 Rxra-206ENSMUST00000166775 3216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rpusd4Q9CWX4 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rpusd4Q9CWX4 Vcan-202ENSMUST00000109544 5702 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rpusd4Q9CWX4 Lrtm2-204ENSMUST00000168793 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rpusd4Q9CWX4 Ccdc57-201ENSMUST00000056781 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rpusd4Q9CWX4 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rpusd4Q9CWX4 Gpcpd1-205ENSMUST00000110142 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rpusd4Q9CWX4 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rpusd4Q9CWX4 Gm42449-201ENSMUST00000200349 2258 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Rpusd4Q9CWX4 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rpusd4Q9CWX4 Rpgrip1-202ENSMUST00000111603 5380 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rpusd4Q9CWX4 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rpusd4Q9CWX4 Yeats2-202ENSMUST00000115560 6116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rpusd4Q9CWX4 Lef1-201ENSMUST00000029611 3482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rpusd4Q9CWX4 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rpusd4Q9CWX4 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rpusd4Q9CWX4 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Rpusd4Q9CWX4 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rpusd4Q9CWX4 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rpusd4Q9CWX4 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rpusd4Q9CWX4 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rpusd4Q9CWX4 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rpusd4Q9CWX4 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Rpusd4Q9CWX4 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rpusd4Q9CWX4 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rpusd4Q9CWX4 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Rpusd4Q9CWX4 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rpusd4Q9CWX4 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rpusd4Q9CWX4 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Rpusd4Q9CWX4 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rpusd4Q9CWX4 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rpusd4Q9CWX4 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rpusd4Q9CWX4 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
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