Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWM4

Pfdn1, Prefoldin subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn1Q9CWM4 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Pfdn1Q9CWM4 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Pfdn1Q9CWM4 Ctnnd1-211ENSMUST00000111685 5985 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Pfdn1Q9CWM4 Ctnnd1-215ENSMUST00000111689 5961 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Pfdn1Q9CWM4 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Pfdn1Q9CWM4 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Pfdn1Q9CWM4 Ptchd4-201ENSMUST00000048691 6890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Pfdn1Q9CWM4 Tmprss3-202ENSMUST00000114549 2872 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Pfdn1Q9CWM4 Nfrkb-201ENSMUST00000086167 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Pfdn1Q9CWM4 Pa2g4-202ENSMUST00000131728 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Pfdn1Q9CWM4 Agbl2-201ENSMUST00000037206 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Pfdn1Q9CWM4 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Pfdn1Q9CWM4 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Pfdn1Q9CWM4 Sfi1-202ENSMUST00000081318 3969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Pfdn1Q9CWM4 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Pfdn1Q9CWM4 Nwd1-201ENSMUST00000093427 7840 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Pfdn1Q9CWM4 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Pfdn1Q9CWM4 Ncam1-203ENSMUST00000192584 2525 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Pfdn1Q9CWM4 Adam22-204ENSMUST00000088761 9077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Pfdn1Q9CWM4 Nkap-201ENSMUST00000016553 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Pfdn1Q9CWM4 Gm4884-201ENSMUST00000164422 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Pfdn1Q9CWM4 Mab21l2-201ENSMUST00000077524 2703 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Pfdn1Q9CWM4 Itih3-205ENSMUST00000227995 2100 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Pfdn1Q9CWM4 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Pfdn1Q9CWM4 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Pfdn1Q9CWM4 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Pfdn1Q9CWM4 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Pfdn1Q9CWM4 G3bp1-201ENSMUST00000018727 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Pfdn1Q9CWM4 Mcam-202ENSMUST00000098852 2772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Pfdn1Q9CWM4 Ldb3-205ENSMUST00000090040 4981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Pfdn1Q9CWM4 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Pfdn1Q9CWM4 Setd1b-201ENSMUST00000056053 7362 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Pfdn1Q9CWM4 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Pfdn1Q9CWM4 Smarcc2-202ENSMUST00000099131 4562 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Pfdn1Q9CWM4 Herc6-201ENSMUST00000031817 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Pfdn1Q9CWM4 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Pfdn1Q9CWM4 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Pfdn1Q9CWM4 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Pfdn1Q9CWM4 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Pfdn1Q9CWM4 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Pfdn1Q9CWM4 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Pfdn1Q9CWM4 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Pfdn1Q9CWM4 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Pfdn1Q9CWM4 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Pfdn1Q9CWM4 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Pfdn1Q9CWM4 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Pfdn1Q9CWM4 Zfp454-201ENSMUST00000050595 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Pfdn1Q9CWM4 Mthfd1l-203ENSMUST00000120585 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Pfdn1Q9CWM4 Espl1-201ENSMUST00000064924 6630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Pfdn1Q9CWM4 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Pfdn1Q9CWM4 Astn1-201ENSMUST00000046110 7195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Pfdn1Q9CWM4 Myh10-201ENSMUST00000018887 7667 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Pfdn1Q9CWM4 Smyd1-202ENSMUST00000114186 3292 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Pfdn1Q9CWM4 Abcg1-201ENSMUST00000024829 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Pfdn1Q9CWM4 Arfgap3-202ENSMUST00000226124 2461 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Pfdn1Q9CWM4 Zfp189-202ENSMUST00000107696 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Pfdn1Q9CWM4 Tcf4-251ENSMUST00000202474 1810 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Pfdn1Q9CWM4 Frmd4b-201ENSMUST00000032146 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Pfdn1Q9CWM4 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Pfdn1Q9CWM4 9430064I24Rik-201ENSMUST00000206516 2669 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Pfdn1Q9CWM4 Eif4g2-206ENSMUST00000161051 3548 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Pfdn1Q9CWM4 Zfp24-201ENSMUST00000066497 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Pfdn1Q9CWM4 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Pfdn1Q9CWM4 Zc3hav1-203ENSMUST00000114900 4944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Pfdn1Q9CWM4 Pcdhb9-201ENSMUST00000057228 3055 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Pfdn1Q9CWM4 1700018A04Rik-204ENSMUST00000221561 2569 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Pfdn1Q9CWM4 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Pfdn1Q9CWM4 Igf2bp3-201ENSMUST00000031838 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Pfdn1Q9CWM4 Mpo-203ENSMUST00000121303 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Pfdn1Q9CWM4 Adgrl3-204ENSMUST00000117407 5705 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Pfdn1Q9CWM4 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Pfdn1Q9CWM4 Mad1l1-201ENSMUST00000031534 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Pfdn1Q9CWM4 D030028A08Rik-202ENSMUST00000131501 3542 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Pfdn1Q9CWM4 Abcc3-201ENSMUST00000021231 4999 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Pfdn1Q9CWM4 Gm17980-201ENSMUST00000217977 2349 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Pfdn1Q9CWM4 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Pfdn1Q9CWM4 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Pfdn1Q9CWM4 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Pfdn1Q9CWM4 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Pfdn1Q9CWM4 Gm12316-201ENSMUST00000125853 406 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Pfdn1Q9CWM4 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Pfdn1Q9CWM4 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Pfdn1Q9CWM4 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Pfdn1Q9CWM4 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Pfdn1Q9CWM4 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Pfdn1Q9CWM4 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Pfdn1Q9CWM4 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Pfdn1Q9CWM4 Nanos3-202ENSMUST00000210202 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Pfdn1Q9CWM4 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Pfdn1Q9CWM4 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Pfdn1Q9CWM4 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Pfdn1Q9CWM4 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Pfdn1Q9CWM4 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Pfdn1Q9CWM4 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Pfdn1Q9CWM4 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Pfdn1Q9CWM4 Phf20-201ENSMUST00000037401 5737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Pfdn1Q9CWM4 Sorbs1-201ENSMUST00000099466 2223 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Pfdn1Q9CWM4 Adgrl2-208ENSMUST00000197567 5585 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Pfdn1Q9CWM4 Firre-206ENSMUST00000203933 5555 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Pfdn1Q9CWM4 Gm43517-201ENSMUST00000110746 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms