Protein–RNA interactions for Protein: Q99J83

Atg5, Autophagy protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 275 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg5Q99J83 AC159195.3-201ENSMUST00000225162 2211 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Atg5Q99J83 Srrt-201ENSMUST00000040873 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
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Atg5Q99J83 Rnf13-210ENSMUST00000200497 2573 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Atg5Q99J83 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Atg5Q99J83 Slc6a5-202ENSMUST00000107605 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
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Atg5Q99J83 Dph6-203ENSMUST00000102542 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Atg5Q99J83 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Atg5Q99J83 Slc23a2-201ENSMUST00000028815 6364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Atg5Q99J83 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Atg5Q99J83 Pin1-201ENSMUST00000034689 3843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
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Atg5Q99J83 Serhl-205ENSMUST00000166427 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Atg5Q99J83 Fermt3-201ENSMUST00000040772 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
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Atg5Q99J83 BC004004-201ENSMUST00000064709 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
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Atg5Q99J83 1810014B01Rik-202ENSMUST00000218095 1622 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Atg5Q99J83 Fyb2-202ENSMUST00000106804 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
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Atg5Q99J83 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
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Atg5Q99J83 Elovl7-201ENSMUST00000022207 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
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Atg5Q99J83 Cyb5r3-202ENSMUST00000162178 2547 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
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Atg5Q99J83 Pdp2-201ENSMUST00000059588 5692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Atg5Q99J83 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Atg5Q99J83 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Atg5Q99J83 Nr5a2-205ENSMUST00000192929 1756 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Atg5Q99J83 Rxra-206ENSMUST00000166775 3216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Atg5Q99J83 Susd4-201ENSMUST00000085724 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Atg5Q99J83 Tmc5-202ENSMUST00000098088 3774 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Atg5Q99J83 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Atg5Q99J83 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Atg5Q99J83 Rsl24d1-201ENSMUST00000034738 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Atg5Q99J83 Itga11-201ENSMUST00000034774 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Atg5Q99J83 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Atg5Q99J83 Ctsb-201ENSMUST00000006235 4743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Atg5Q99J83 Nup210-202ENSMUST00000113509 6893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Atg5Q99J83 4632404M16Rik-201ENSMUST00000197326 2882 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Atg5Q99J83 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Atg5Q99J83 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Atg5Q99J83 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Atg5Q99J83 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
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