Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE18

Smg8, Protein SMG8, mousemouse

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Length 991 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg8Q8VE18 Cela3b-201ENSMUST00000102522 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Smg8Q8VE18 Tnnt3-211ENSMUST00000105949 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Smg8Q8VE18 Rtn2-202ENSMUST00000108468 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Smg8Q8VE18 Tprkb-203ENSMUST00000113751 692 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Smg8Q8VE18 Gm12419-201ENSMUST00000116649 636 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Smg8Q8VE18 Gm13605-201ENSMUST00000124489 658 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Smg8Q8VE18 Spx-202ENSMUST00000126521 357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Smg8Q8VE18 Gm15764-201ENSMUST00000150389 672 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Smg8Q8VE18 Gm6485-201ENSMUST00000160676 439 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Smg8Q8VE18 Fam166b-206ENSMUST00000171134 1198 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Smg8Q8VE18 Higd1c-201ENSMUST00000175683 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Smg8Q8VE18 Wdr53-204ENSMUST00000178573 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Smg8Q8VE18 Mir7076-201ENSMUST00000183519 74 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Smg8Q8VE18 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Smg8Q8VE18 Gm37458-201ENSMUST00000194055 410 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Smg8Q8VE18 1700016D08Rik-202ENSMUST00000195807 368 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Smg8Q8VE18 Gm9645-201ENSMUST00000197131 792 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Smg8Q8VE18 0610033M10Rik-201ENSMUST00000204546 506 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Smg8Q8VE18 Cplx3-203ENSMUST00000217015 540 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Smg8Q8VE18 AC134869.4-202ENSMUST00000224350 837 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Smg8Q8VE18 Tex35-201ENSMUST00000027884 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Smg8Q8VE18 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
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Smg8Q8VE18 H3f3a-201ENSMUST00000081026 888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Smg8Q8VE18 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Smg8Q8VE18 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Smg8Q8VE18 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Smg8Q8VE18 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Smg8Q8VE18 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Smg8Q8VE18 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Smg8Q8VE18 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Smg8Q8VE18 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Smg8Q8VE18 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Smg8Q8VE18 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Smg8Q8VE18 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Smg8Q8VE18 Gm12200-201ENSMUST00000144876 1858 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Smg8Q8VE18 Snai2-201ENSMUST00000023356 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Smg8Q8VE18 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Smg8Q8VE18 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Smg8Q8VE18 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Smg8Q8VE18 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Smg8Q8VE18 AC166836.1-201ENSMUST00000219933 1795 ntBASIC12.58□□□□□ -0.39
Smg8Q8VE18 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Smg8Q8VE18 Odf2l-201ENSMUST00000029920 2239 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Smg8Q8VE18 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Smg8Q8VE18 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Smg8Q8VE18 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Smg8Q8VE18 Pstpip2-201ENSMUST00000114741 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Smg8Q8VE18 Gm45199-201ENSMUST00000207640 1507 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Smg8Q8VE18 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Smg8Q8VE18 4933438K21Rik-201ENSMUST00000175787 1693 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Smg8Q8VE18 Gm26714-201ENSMUST00000181338 1655 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Smg8Q8VE18 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Smg8Q8VE18 Nelfcd-201ENSMUST00000016397 2280 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Smg8Q8VE18 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
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Smg8Q8VE18 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
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Smg8Q8VE18 Gm14199-201ENSMUST00000130021 495 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
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Smg8Q8VE18 Hmgn3-201ENSMUST00000161796 862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Smg8Q8VE18 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
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Smg8Q8VE18 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Smg8Q8VE18 Dcaf11-202ENSMUST00000117236 2538 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Smg8Q8VE18 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Smg8Q8VE18 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Smg8Q8VE18 Hspa14-201ENSMUST00000027961 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Smg8Q8VE18 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Smg8Q8VE18 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Smg8Q8VE18 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Smg8Q8VE18 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Smg8Q8VE18 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Smg8Q8VE18 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Smg8Q8VE18 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Smg8Q8VE18 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Smg8Q8VE18 Fetub-204ENSMUST00000170805 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Smg8Q8VE18 Gm13347-201ENSMUST00000120298 1353 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Smg8Q8VE18 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Smg8Q8VE18 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Smg8Q8VE18 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Smg8Q8VE18 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Smg8Q8VE18 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Smg8Q8VE18 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Smg8Q8VE18 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Smg8Q8VE18 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Smg8Q8VE18 Oscar-203ENSMUST00000148012 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
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