Protein–RNA interactions for Protein: Q8K243

Trim68, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM68, mousemouse

Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim68Q8K243 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trim68Q8K243 Aff3-203ENSMUST00000095027 5857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trim68Q8K243 Slc35b3-202ENSMUST00000167513 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trim68Q8K243 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trim68Q8K243 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trim68Q8K243 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trim68Q8K243 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trim68Q8K243 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trim68Q8K243 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trim68Q8K243 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trim68Q8K243 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trim68Q8K243 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trim68Q8K243 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trim68Q8K243 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trim68Q8K243 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trim68Q8K243 Pcnp-203ENSMUST00000119981 901 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trim68Q8K243 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trim68Q8K243 Gm22144-201ENSMUST00000157402 102 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Trim68Q8K243 Erh-202ENSMUST00000166931 506 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trim68Q8K243 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trim68Q8K243 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trim68Q8K243 Mir6998-201ENSMUST00000183343 64 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Trim68Q8K243 Gm28516-201ENSMUST00000190257 663 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trim68Q8K243 Timm10b-210ENSMUST00000209588 373 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trim68Q8K243 Gm3028-201ENSMUST00000213805 1119 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Trim68Q8K243 Gm9785-201ENSMUST00000062642 1006 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Trim68Q8K243 Orc4-202ENSMUST00000090976 1153 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trim68Q8K243 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trim68Q8K243 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trim68Q8K243 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trim68Q8K243 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trim68Q8K243 Olfr742-202ENSMUST00000213935 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trim68Q8K243 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trim68Q8K243 Vdr-201ENSMUST00000023119 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trim68Q8K243 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trim68Q8K243 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trim68Q8K243 Myo3b-202ENSMUST00000112241 1319 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trim68Q8K243 Tectb-202ENSMUST00000120936 1349 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trim68Q8K243 Nphs1os-201ENSMUST00000152625 1339 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trim68Q8K243 Sec16a-202ENSMUST00000114082 8797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trim68Q8K243 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trim68Q8K243 Gm12248-202ENSMUST00000218429 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trim68Q8K243 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trim68Q8K243 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trim68Q8K243 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trim68Q8K243 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trim68Q8K243 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trim68Q8K243 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trim68Q8K243 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trim68Q8K243 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trim68Q8K243 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trim68Q8K243 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trim68Q8K243 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trim68Q8K243 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trim68Q8K243 Wbp1l-201ENSMUST00000099376 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trim68Q8K243 Trpv3-201ENSMUST00000049676 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trim68Q8K243 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trim68Q8K243 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trim68Q8K243 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trim68Q8K243 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trim68Q8K243 Timm10b-204ENSMUST00000106784 494 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trim68Q8K243 Ccl27a-204ENSMUST00000108035 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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Trim68Q8K243 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
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Trim68Q8K243 Dnmt3bos-201ENSMUST00000124988 718 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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Trim68Q8K243 Isl1-202ENSMUST00000176044 1198 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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Trim68Q8K243 Mir7076-201ENSMUST00000183519 74 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Trim68Q8K243 8030442B05Rik-201ENSMUST00000192626 1035 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trim68Q8K243 Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trim68Q8K243 Gm34821-201ENSMUST00000208399 1031 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trim68Q8K243 1110019B22Rik-202ENSMUST00000218396 989 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trim68Q8K243 Olfr1347-205ENSMUST00000220413 964 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Trim68Q8K243 5830428M24Rik-204ENSMUST00000223143 1034 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trim68Q8K243 AC154176.1-201ENSMUST00000225897 220 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Trim68Q8K243 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trim68Q8K243 Olfr1347-201ENSMUST00000036357 964 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trim68Q8K243 Prrc2b-202ENSMUST00000069817 10671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trim68Q8K243 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trim68Q8K243 Rsrc1-206ENSMUST00000162036 1406 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trim68Q8K243 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trim68Q8K243 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trim68Q8K243 Ndc1-204ENSMUST00000139560 4584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trim68Q8K243 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trim68Q8K243 Iqsec2-201ENSMUST00000096275 5252 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trim68Q8K243 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trim68Q8K243 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trim68Q8K243 Rims1-206ENSMUST00000115273 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trim68Q8K243 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trim68Q8K243 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trim68Q8K243 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trim68Q8K243 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trim68Q8K243 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trim68Q8K243 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trim68Q8K243 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
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