Protein–RNA interactions for Protein: Q8K099

Lrit1, Leucine-rich repeat, immunoglobulin-like domain and transmembrane domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 624 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrit1Q8K099 Gm15976-201ENSMUST00000129701 429 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lrit1Q8K099 Gm14004-201ENSMUST00000138875 590 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lrit1Q8K099 Gm17226-201ENSMUST00000166637 780 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lrit1Q8K099 1110036E04Rik-201ENSMUST00000181151 777 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lrit1Q8K099 Marc1-203ENSMUST00000189492 1239 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lrit1Q8K099 Gm20781-201ENSMUST00000193154 693 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Lrit1Q8K099 Gm37257-201ENSMUST00000194871 717 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lrit1Q8K099 Gm21736-201ENSMUST00000195399 693 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Lrit1Q8K099 Il18-203ENSMUST00000213916 885 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lrit1Q8K099 Ppm1a-205ENSMUST00000222896 1103 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lrit1Q8K099 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lrit1Q8K099 Olfr71-201ENSMUST00000055401 939 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lrit1Q8K099 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lrit1Q8K099 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lrit1Q8K099 Gm43167-201ENSMUST00000202001 1606 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Lrit1Q8K099 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lrit1Q8K099 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lrit1Q8K099 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lrit1Q8K099 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lrit1Q8K099 Rtn4ip1-201ENSMUST00000054418 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lrit1Q8K099 Lgals4-201ENSMUST00000066723 1384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lrit1Q8K099 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lrit1Q8K099 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lrit1Q8K099 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lrit1Q8K099 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lrit1Q8K099 Gadl1-202ENSMUST00000119291 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lrit1Q8K099 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lrit1Q8K099 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lrit1Q8K099 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lrit1Q8K099 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lrit1Q8K099 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lrit1Q8K099 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lrit1Q8K099 Bckdk-202ENSMUST00000124533 1792 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lrit1Q8K099 Gm3409-202ENSMUST00000110599 1154 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lrit1Q8K099 Atp5g3-202ENSMUST00000111996 723 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lrit1Q8K099 Gm8302-201ENSMUST00000119217 852 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Lrit1Q8K099 Pet100-201ENSMUST00000156380 1193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lrit1Q8K099 Pax4-202ENSMUST00000164519 1229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lrit1Q8K099 Pax4-203ENSMUST00000171089 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lrit1Q8K099 Gm5294-201ENSMUST00000179205 651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lrit1Q8K099 Gm3415-202ENSMUST00000179214 1154 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lrit1Q8K099 Gm7572-201ENSMUST00000182616 766 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Lrit1Q8K099 Mllt11-204ENSMUST00000198948 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lrit1Q8K099 Gm3409-203ENSMUST00000199142 1167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lrit1Q8K099 Gm3402-203ENSMUST00000200228 1154 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lrit1Q8K099 D5Ertd605e-201ENSMUST00000201128 1081 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lrit1Q8K099 Mcpt4-201ENSMUST00000043249 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lrit1Q8K099 Naca-201ENSMUST00000073868 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lrit1Q8K099 Iqcf1-201ENSMUST00000085114 613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Lrit1Q8K099 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lrit1Q8K099 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lrit1Q8K099 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lrit1Q8K099 Evi2a-201ENSMUST00000103236 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lrit1Q8K099 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lrit1Q8K099 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lrit1Q8K099 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lrit1Q8K099 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lrit1Q8K099 Lmo3-206ENSMUST00000163024 1331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Lrit1Q8K099 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lrit1Q8K099 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Lrit1Q8K099 Rufy2-204ENSMUST00000131718 2816 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lrit1Q8K099 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lrit1Q8K099 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lrit1Q8K099 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Lrit1Q8K099 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lrit1Q8K099 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lrit1Q8K099 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lrit1Q8K099 H2afv-202ENSMUST00000109737 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lrit1Q8K099 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lrit1Q8K099 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Lrit1Q8K099 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lrit1Q8K099 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lrit1Q8K099 1700025C18Rik-201ENSMUST00000109304 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lrit1Q8K099 Nup188-202ENSMUST00000113634 534 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lrit1Q8K099 Camk2a-205ENSMUST00000115297 499 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lrit1Q8K099 Gm15412-201ENSMUST00000137193 1096 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lrit1Q8K099 Tnnt1-206ENSMUST00000163710 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lrit1Q8K099 Gm27003-201ENSMUST00000182590 497 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lrit1Q8K099 Gm27440-201ENSMUST00000184785 107 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Lrit1Q8K099 Ighv1-70-201ENSMUST00000196509 351 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Lrit1Q8K099 Gm44698-201ENSMUST00000207382 384 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lrit1Q8K099 Gm6518-201ENSMUST00000208450 342 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Lrit1Q8K099 Lsm8-201ENSMUST00000056398 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lrit1Q8K099 Hax1-201ENSMUST00000079724 1139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Lrit1Q8K099 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Lrit1Q8K099 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lrit1Q8K099 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lrit1Q8K099 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Lrit1Q8K099 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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