Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHZ9

Mterf1a, Transcription termination factor 1a, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 379 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mterf1aQ8CHZ9 Rsc1a1-201ENSMUST00000105782 1749 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Mterf1aQ8CHZ9 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Mterf1aQ8CHZ9 Gm26778-201ENSMUST00000181443 3805 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Mterf1aQ8CHZ9 Sema3g-201ENSMUST00000090180 4540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Mterf1aQ8CHZ9 Unkl-204ENSMUST00000160896 4787 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Mterf1aQ8CHZ9 Hdac7-205ENSMUST00000118294 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Mterf1aQ8CHZ9 Edc4-202ENSMUST00000119261 4645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Mterf1aQ8CHZ9 Zfp866-202ENSMUST00000137573 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Mterf1aQ8CHZ9 Wdcp-202ENSMUST00000085793 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Mterf1aQ8CHZ9 Rcor3-202ENSMUST00000110849 3791 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Mterf1aQ8CHZ9 Angptl4-201ENSMUST00000002360 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Mterf1aQ8CHZ9 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Mterf1aQ8CHZ9 Gm12395-201ENSMUST00000144765 536 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Mterf1aQ8CHZ9 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Mterf1aQ8CHZ9 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Mterf1aQ8CHZ9 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Mterf1aQ8CHZ9 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Mterf1aQ8CHZ9 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Mterf1aQ8CHZ9 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Mterf1aQ8CHZ9 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Mterf1aQ8CHZ9 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Mterf1aQ8CHZ9 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Mterf1aQ8CHZ9 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Mterf1aQ8CHZ9 Tardbp-206ENSMUST00000105702 6425 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Mterf1aQ8CHZ9 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Mterf1aQ8CHZ9 Mcam-202ENSMUST00000098852 2772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Mterf1aQ8CHZ9 Rims2-202ENSMUST00000082054 4800 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Mterf1aQ8CHZ9 Susd4-201ENSMUST00000085724 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Mterf1aQ8CHZ9 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Mterf1aQ8CHZ9 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Mterf1aQ8CHZ9 Pdha1-201ENSMUST00000033662 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Mterf1aQ8CHZ9 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Mterf1aQ8CHZ9 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Mterf1aQ8CHZ9 Plcd4-206ENSMUST00000113750 2692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Mterf1aQ8CHZ9 Dcaf12l1-202ENSMUST00000115056 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Mterf1aQ8CHZ9 4933431E20Rik-201ENSMUST00000131345 5407 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Mterf1aQ8CHZ9 Gmppb-202ENSMUST00000112295 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Mterf1aQ8CHZ9 Capn15-201ENSMUST00000041641 3520 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Mterf1aQ8CHZ9 2310043M15Rik-201ENSMUST00000180967 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Mterf1aQ8CHZ9 Avpr2-202ENSMUST00000101470 2787 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Mterf1aQ8CHZ9 Uspl1-201ENSMUST00000050472 3757 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Mterf1aQ8CHZ9 Ikbkg-205ENSMUST00000114129 2222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Mterf1aQ8CHZ9 Rgs6-211ENSMUST00000191107 1621 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Mterf1aQ8CHZ9 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Mterf1aQ8CHZ9 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Mterf1aQ8CHZ9 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Mterf1aQ8CHZ9 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Mterf1aQ8CHZ9 B230317F23Rik-201ENSMUST00000052189 2472 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Mterf1aQ8CHZ9 5031434O11Rik-201ENSMUST00000180404 3731 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Mterf1aQ8CHZ9 Zswim9-203ENSMUST00000119558 3111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Mterf1aQ8CHZ9 Ces2d-ps-201ENSMUST00000043209 1656 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Mterf1aQ8CHZ9 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Mterf1aQ8CHZ9 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Mterf1aQ8CHZ9 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Mterf1aQ8CHZ9 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Mterf1aQ8CHZ9 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Mterf1aQ8CHZ9 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Mterf1aQ8CHZ9 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Mterf1aQ8CHZ9 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Mterf1aQ8CHZ9 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Mterf1aQ8CHZ9 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Mterf1aQ8CHZ9 Gm20442-201ENSMUST00000174630 492 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Mterf1aQ8CHZ9 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Mterf1aQ8CHZ9 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Mterf1aQ8CHZ9 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Mterf1aQ8CHZ9 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Mterf1aQ8CHZ9 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Mterf1aQ8CHZ9 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Mterf1aQ8CHZ9 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Mterf1aQ8CHZ9 Atp1a3-201ENSMUST00000080882 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Mterf1aQ8CHZ9 Rnf13-210ENSMUST00000200497 2573 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Mterf1aQ8CHZ9 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Mterf1aQ8CHZ9 Pspc1-201ENSMUST00000022507 4114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Mterf1aQ8CHZ9 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Mterf1aQ8CHZ9 Wnt5a-201ENSMUST00000063465 7010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Mterf1aQ8CHZ9 Hnrnph2-203ENSMUST00000074950 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Mterf1aQ8CHZ9 Nr2c1-202ENSMUST00000099343 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Mterf1aQ8CHZ9 Chek1-202ENSMUST00000172702 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Mterf1aQ8CHZ9 Ccl22-201ENSMUST00000034231 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Mterf1aQ8CHZ9 Dph6-203ENSMUST00000102542 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Mterf1aQ8CHZ9 Gm9796-201ENSMUST00000062249 2250 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Mterf1aQ8CHZ9 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Mterf1aQ8CHZ9 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Mterf1aQ8CHZ9 Dnajc5-203ENSMUST00000108797 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Mterf1aQ8CHZ9 Tmbim1-202ENSMUST00000113796 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Mterf1aQ8CHZ9 Gm26642-201ENSMUST00000180981 2782 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Mterf1aQ8CHZ9 Eef1d-205ENSMUST00000109972 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Mterf1aQ8CHZ9 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Mterf1aQ8CHZ9 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Mterf1aQ8CHZ9 Cxcr5-202ENSMUST00000179828 2824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Mterf1aQ8CHZ9 Vasn-201ENSMUST00000038770 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Mterf1aQ8CHZ9 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Mterf1aQ8CHZ9 Col18a1-203ENSMUST00000105409 4791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Mterf1aQ8CHZ9 CT010498.2-201ENSMUST00000225690 1659 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Mterf1aQ8CHZ9 Hsd3b1-201ENSMUST00000029465 1663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Mterf1aQ8CHZ9 Abi1-208ENSMUST00000139038 2899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Mterf1aQ8CHZ9 Msh5-201ENSMUST00000007250 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Mterf1aQ8CHZ9 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Mterf1aQ8CHZ9 Vipas39-203ENSMUST00000179379 2418 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Mterf1aQ8CHZ9 Lig1-211ENSMUST00000177588 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.6 ms