Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD4

Snx8, Sorting nexin-8, mousemouse

Predictions only

Length 459 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx8Q8CFD4 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Snx8Q8CFD4 Gtf2i-210ENSMUST00000173341 4302 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Snx8Q8CFD4 Olfr279-203ENSMUST00000216822 5605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Snx8Q8CFD4 Sstr3-201ENSMUST00000053239 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Snx8Q8CFD4 Pou2f3-201ENSMUST00000034513 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Snx8Q8CFD4 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Snx8Q8CFD4 Zfp384-206ENSMUST00000112425 2691 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Snx8Q8CFD4 Mb21d1-202ENSMUST00000070742 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Snx8Q8CFD4 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Snx8Q8CFD4 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Snx8Q8CFD4 Tmcc1-210ENSMUST00000204353 2851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Snx8Q8CFD4 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Snx8Q8CFD4 Cdc42ep4-202ENSMUST00000106616 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Snx8Q8CFD4 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Snx8Q8CFD4 A430028G04Rik-201ENSMUST00000219095 1973 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Snx8Q8CFD4 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Snx8Q8CFD4 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Snx8Q8CFD4 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Snx8Q8CFD4 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Snx8Q8CFD4 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Snx8Q8CFD4 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Snx8Q8CFD4 Kalrn-211ENSMUST00000114966 3857 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Snx8Q8CFD4 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Snx8Q8CFD4 Ifnar1-201ENSMUST00000023689 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Snx8Q8CFD4 Epha6-201ENSMUST00000068860 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Snx8Q8CFD4 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Snx8Q8CFD4 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Snx8Q8CFD4 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Snx8Q8CFD4 Parp9-203ENSMUST00000114878 3548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Snx8Q8CFD4 Cd300lg-201ENSMUST00000017453 2353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Snx8Q8CFD4 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Snx8Q8CFD4 Rangap1-202ENSMUST00000170134 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Snx8Q8CFD4 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Snx8Q8CFD4 Hnrnph2-203ENSMUST00000074950 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Snx8Q8CFD4 Aoc2-201ENSMUST00000041095 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Snx8Q8CFD4 Gm11989-201ENSMUST00000117240 672 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Snx8Q8CFD4 Gm11362-201ENSMUST00000118838 850 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Snx8Q8CFD4 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Snx8Q8CFD4 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Snx8Q8CFD4 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Snx8Q8CFD4 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Snx8Q8CFD4 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Snx8Q8CFD4 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Snx8Q8CFD4 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Snx8Q8CFD4 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Snx8Q8CFD4 Tspyl4-201ENSMUST00000047935 3879 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Snx8Q8CFD4 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Snx8Q8CFD4 Edc4-202ENSMUST00000119261 4645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Snx8Q8CFD4 Jak3-203ENSMUST00000110013 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Snx8Q8CFD4 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Snx8Q8CFD4 Slc25a48-201ENSMUST00000021971 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Snx8Q8CFD4 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Snx8Q8CFD4 Frmd3-201ENSMUST00000084474 4136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Snx8Q8CFD4 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Snx8Q8CFD4 Gm38140-201ENSMUST00000193617 2755 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Snx8Q8CFD4 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Snx8Q8CFD4 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Snx8Q8CFD4 4632404M16Rik-201ENSMUST00000197326 2882 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Snx8Q8CFD4 Pamr1-201ENSMUST00000028612 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Snx8Q8CFD4 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Snx8Q8CFD4 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Snx8Q8CFD4 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Snx8Q8CFD4 Gm13135-201ENSMUST00000117628 3121 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Snx8Q8CFD4 Hnrnpm-206ENSMUST00000148178 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Snx8Q8CFD4 Sass6-204ENSMUST00000197335 2458 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Snx8Q8CFD4 Epm2aip1-202ENSMUST00000135807 4245 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Snx8Q8CFD4 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Snx8Q8CFD4 Gtf2ird1-203ENSMUST00000100650 3487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Snx8Q8CFD4 Plcd4-206ENSMUST00000113750 2692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Snx8Q8CFD4 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Snx8Q8CFD4 Sema4c-208ENSMUST00000195620 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Snx8Q8CFD4 Gm17746-201ENSMUST00000223429 3772 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Snx8Q8CFD4 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Snx8Q8CFD4 Olfr56-202ENSMUST00000102785 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Snx8Q8CFD4 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Snx8Q8CFD4 Col9a1-202ENSMUST00000088349 3059 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Snx8Q8CFD4 Lrrc36-201ENSMUST00000067305 2082 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Snx8Q8CFD4 Epb41-207ENSMUST00000105975 5235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Snx8Q8CFD4 Erbin-201ENSMUST00000022222 6369 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Snx8Q8CFD4 Gm38055-201ENSMUST00000195353 2217 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Snx8Q8CFD4 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Snx8Q8CFD4 Nfic-203ENSMUST00000105321 6237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Snx8Q8CFD4 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Snx8Q8CFD4 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Snx8Q8CFD4 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Snx8Q8CFD4 Il15ra-204ENSMUST00000114832 468 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Snx8Q8CFD4 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Snx8Q8CFD4 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Snx8Q8CFD4 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Snx8Q8CFD4 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Snx8Q8CFD4 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Snx8Q8CFD4 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Snx8Q8CFD4 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Snx8Q8CFD4 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Snx8Q8CFD4 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Snx8Q8CFD4 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Snx8Q8CFD4 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Snx8Q8CFD4 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Snx8Q8CFD4 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Snx8Q8CFD4 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
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