Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0J2

Atg16l1, Autophagy-related protein 16-1, mousemouse

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Length 607 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg16l1Q8C0J2 Kat6b-204ENSMUST00000182405 6977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Atg16l1Q8C0J2 Dtx3l-202ENSMUST00000114885 2648 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Atg16l1Q8C0J2 Per1-202ENSMUST00000101004 3507 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Atg16l1Q8C0J2 Trmt2a-207ENSMUST00000140206 3520 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Atg16l1Q8C0J2 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Atg16l1Q8C0J2 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Atg16l1Q8C0J2 Gpr101-201ENSMUST00000057645 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Atg16l1Q8C0J2 1700019D03Rik-201ENSMUST00000050567 3641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Atg16l1Q8C0J2 Hbs1l-209ENSMUST00000219915 2733 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Atg16l1Q8C0J2 Entpd4-201ENSMUST00000064831 1842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Atg16l1Q8C0J2 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Atg16l1Q8C0J2 Ankrd31-203ENSMUST00000208758 5859 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Atg16l1Q8C0J2 Cdc42ep4-201ENSMUST00000053536 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Atg16l1Q8C0J2 Sell-201ENSMUST00000027871 2199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Atg16l1Q8C0J2 Pip4k2c-201ENSMUST00000013970 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Atg16l1Q8C0J2 Fkbp15-204ENSMUST00000107461 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Atg16l1Q8C0J2 Otof-201ENSMUST00000074171 7129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Atg16l1Q8C0J2 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
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Atg16l1Q8C0J2 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Atg16l1Q8C0J2 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Atg16l1Q8C0J2 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Atg16l1Q8C0J2 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Atg16l1Q8C0J2 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Atg16l1Q8C0J2 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
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Atg16l1Q8C0J2 Ptpn23-201ENSMUST00000040021 5346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Atg16l1Q8C0J2 Gm20649-201ENSMUST00000160950 2740 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
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Atg16l1Q8C0J2 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
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Atg16l1Q8C0J2 AC125374.1-201ENSMUST00000213573 1400 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Atg16l1Q8C0J2 Inpp4a-206ENSMUST00000132615 3038 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Atg16l1Q8C0J2 Gm38292-201ENSMUST00000192646 3045 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
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Atg16l1Q8C0J2 Ttpa-201ENSMUST00000098244 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
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Atg16l1Q8C0J2 Gm12200-201ENSMUST00000144876 1858 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Atg16l1Q8C0J2 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Atg16l1Q8C0J2 Thbs2-201ENSMUST00000170872 5922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Atg16l1Q8C0J2 Dscaml1-201ENSMUST00000034592 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Atg16l1Q8C0J2 Gm36957-201ENSMUST00000192982 2824 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Atg16l1Q8C0J2 Ank1-204ENSMUST00000117270 5652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Atg16l1Q8C0J2 Lama4-201ENSMUST00000019992 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Atg16l1Q8C0J2 Ackr3-201ENSMUST00000065587 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Atg16l1Q8C0J2 C030034L19Rik-203ENSMUST00000181930 3133 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Atg16l1Q8C0J2 Zbtb42-201ENSMUST00000169593 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Atg16l1Q8C0J2 Sorcs1-202ENSMUST00000111756 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Atg16l1Q8C0J2 Sorcs1-207ENSMUST00000211008 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Atg16l1Q8C0J2 Mb21d1-202ENSMUST00000070742 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Atg16l1Q8C0J2 Tmem151a-201ENSMUST00000077066 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Atg16l1Q8C0J2 Krt7-201ENSMUST00000068904 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Atg16l1Q8C0J2 Srebf1-201ENSMUST00000020846 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Atg16l1Q8C0J2 Cox15-201ENSMUST00000045562 4798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Atg16l1Q8C0J2 Tnnt3-211ENSMUST00000105949 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Atg16l1Q8C0J2 Ccm2-202ENSMUST00000109721 1551 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
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Atg16l1Q8C0J2 Add2-207ENSMUST00000203724 3143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
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Atg16l1Q8C0J2 Larp7-201ENSMUST00000029588 2121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Atg16l1Q8C0J2 Pkp4-201ENSMUST00000037903 4378 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Atg16l1Q8C0J2 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Atg16l1Q8C0J2 Pou2f1-202ENSMUST00000069609 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
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Atg16l1Q8C0J2 Rdh13-201ENSMUST00000008579 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Atg16l1Q8C0J2 Cep250-204ENSMUST00000109619 7977 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Atg16l1Q8C0J2 Cep250-201ENSMUST00000039994 7979 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Atg16l1Q8C0J2 Chek1-202ENSMUST00000172702 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Atg16l1Q8C0J2 Mamld1-202ENSMUST00000114629 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Atg16l1Q8C0J2 Astn1-209ENSMUST00000194369 3344 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Atg16l1Q8C0J2 Olfr1419-202ENSMUST00000213954 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Atg16l1Q8C0J2 Gm38140-201ENSMUST00000193617 2755 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Atg16l1Q8C0J2 Tcf4-240ENSMUST00000201781 2779 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Atg16l1Q8C0J2 Ttll10-206ENSMUST00000184348 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Atg16l1Q8C0J2 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Atg16l1Q8C0J2 Ikbkg-205ENSMUST00000114129 2222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Atg16l1Q8C0J2 4930463O16Rik-201ENSMUST00000020222 2088 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Atg16l1Q8C0J2 AC154404.1-201ENSMUST00000223601 2077 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Atg16l1Q8C0J2 Glyctk-202ENSMUST00000112543 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Atg16l1Q8C0J2 Atg9b-201ENSMUST00000059401 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Atg16l1Q8C0J2 Tgfbr1-201ENSMUST00000007757 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Atg16l1Q8C0J2 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Atg16l1Q8C0J2 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Atg16l1Q8C0J2 Gm17281-201ENSMUST00000180732 3589 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Atg16l1Q8C0J2 Nmrk1-203ENSMUST00000159572 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Atg16l1Q8C0J2 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Atg16l1Q8C0J2 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Atg16l1Q8C0J2 4933407I05Rik-204ENSMUST00000217562 1561 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
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