Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZI1

Sh3rf1, E3 ubiquitin-protein ligase SH3RF1, mousemouse

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Length 892 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3rf1Q69ZI1 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Sh3rf1Q69ZI1 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Sh3rf1Q69ZI1 Arf4os-201ENSMUST00000166902 566 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Sh3rf1Q69ZI1 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Sh3rf1Q69ZI1 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Sh3rf1Q69ZI1 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Sh3rf1Q69ZI1 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Sh3rf1Q69ZI1 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Sh3rf1Q69ZI1 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Sh3rf1Q69ZI1 Cdc34-208ENSMUST00000219791 799 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Sh3rf1Q69ZI1 Psma7-201ENSMUST00000029082 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Sh3rf1Q69ZI1 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Sh3rf1Q69ZI1 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Sh3rf1Q69ZI1 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Sh3rf1Q69ZI1 Gm45677-201ENSMUST00000209975 1341 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Sh3rf1Q69ZI1 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Sh3rf1Q69ZI1 Kat7-203ENSMUST00000103159 3248 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Sh3rf1Q69ZI1 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Sh3rf1Q69ZI1 Hsd3b3-203ENSMUST00000107018 1443 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Sh3rf1Q69ZI1 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Sh3rf1Q69ZI1 Slc45a3-201ENSMUST00000027695 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Sh3rf1Q69ZI1 Tapbpl-201ENSMUST00000043422 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Sh3rf1Q69ZI1 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Sh3rf1Q69ZI1 Klhl14-202ENSMUST00000122333 4423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Sh3rf1Q69ZI1 Gm20658-201ENSMUST00000175871 1489 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Sh3rf1Q69ZI1 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Sh3rf1Q69ZI1 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Sh3rf1Q69ZI1 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Sh3rf1Q69ZI1 Mbtps2-203ENSMUST00000112522 3891 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Sh3rf1Q69ZI1 Mbtps2-208ENSMUST00000179062 3890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Sh3rf1Q69ZI1 Igsf3-201ENSMUST00000043983 7371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Sh3rf1Q69ZI1 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Sh3rf1Q69ZI1 Map4-214ENSMUST00000199498 4055 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Sh3rf1Q69ZI1 Nras-201ENSMUST00000029445 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Sh3rf1Q69ZI1 Ubxn10-202ENSMUST00000105810 3304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sh3rf1Q69ZI1 Stim1-209ENSMUST00000211457 2183 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sh3rf1Q69ZI1 Hnrnph2-205ENSMUST00000113203 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sh3rf1Q69ZI1 Ttll10-202ENSMUST00000051509 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sh3rf1Q69ZI1 Gm15446-201ENSMUST00000112544 2417 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sh3rf1Q69ZI1 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sh3rf1Q69ZI1 Abi1-203ENSMUST00000093171 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sh3rf1Q69ZI1 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sh3rf1Q69ZI1 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sh3rf1Q69ZI1 Pabpc4-203ENSMUST00000106241 3050 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sh3rf1Q69ZI1 Acat1-201ENSMUST00000034547 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sh3rf1Q69ZI1 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Sh3rf1Q69ZI1 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sh3rf1Q69ZI1 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sh3rf1Q69ZI1 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sh3rf1Q69ZI1 Gm20614-201ENSMUST00000177106 632 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Sh3rf1Q69ZI1 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Sh3rf1Q69ZI1 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Sh3rf1Q69ZI1 Kirrel3-209ENSMUST00000190549 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sh3rf1Q69ZI1 Mrgprd-201ENSMUST00000062163 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sh3rf1Q69ZI1 Per1-202ENSMUST00000101004 3507 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sh3rf1Q69ZI1 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sh3rf1Q69ZI1 Hs6st2-202ENSMUST00000114871 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sh3rf1Q69ZI1 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sh3rf1Q69ZI1 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Sh3rf1Q69ZI1 Clvs2-204ENSMUST00000161692 4283 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Sh3rf1Q69ZI1 Sypl2-201ENSMUST00000141387 4090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Sh3rf1Q69ZI1 Ctnnal1-201ENSMUST00000045142 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Sh3rf1Q69ZI1 Trub2-201ENSMUST00000048044 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Sh3rf1Q69ZI1 Rdh13-201ENSMUST00000008579 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Sh3rf1Q69ZI1 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Sh3rf1Q69ZI1 Cpa5-201ENSMUST00000062758 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Sh3rf1Q69ZI1 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Sh3rf1Q69ZI1 Xkr6-202ENSMUST00000120820 1702 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Sh3rf1Q69ZI1 Hnrnpm-206ENSMUST00000148178 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Sh3rf1Q69ZI1 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Sh3rf1Q69ZI1 Hemk1-202ENSMUST00000118051 453 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Sh3rf1Q69ZI1 Gm4909-201ENSMUST00000118749 794 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Sh3rf1Q69ZI1 Gm12176-201ENSMUST00000121420 875 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
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