Protein–RNA interactions for Protein: Q64213

Sf1, Splicing factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 653 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Sf1Q64213 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sf1Q64213 Dmbt1-201ENSMUST00000084509 6243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sf1Q64213 Abcc10-204ENSMUST00000167360 4866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
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Sf1Q64213 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sf1Q64213 Taf6l-202ENSMUST00000010249 848 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sf1Q64213 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
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Sf1Q64213 Spaca6-209ENSMUST00000172097 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
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Sf1Q64213 Gm4131-201ENSMUST00000186010 1264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
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Sf1Q64213 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
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Sf1Q64213 Epb41l1-203ENSMUST00000103136 6249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
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Sf1Q64213 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sf1Q64213 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sf1Q64213 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
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Sf1Q64213 Srsf5-202ENSMUST00000110351 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
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Sf1Q64213 Ncapd2-201ENSMUST00000043848 4629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
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Sf1Q64213 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
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Sf1Q64213 Slc14a2-202ENSMUST00000163367 1428 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
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Sf1Q64213 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
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Sf1Q64213 Slc16a1-201ENSMUST00000046212 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
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Sf1Q64213 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sf1Q64213 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
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Sf1Q64213 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sf1Q64213 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sf1Q64213 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Sf1Q64213 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
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Sf1Q64213 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
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Sf1Q64213 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sf1Q64213 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sf1Q64213 Fcna-201ENSMUST00000028307 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sf1Q64213 Plekha6-204ENSMUST00000187285 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sf1Q64213 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sf1Q64213 Fgd5-202ENSMUST00000113466 5621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sf1Q64213 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49 ms