Protein–RNA interactions for Protein: Q61602

Gli3, Transcriptional activator GLI3, mousemouse

Predictions only

Length 1,583 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gli3Q61602 Nrg1-211ENSMUST00000208497 2096 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gli3Q61602 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gli3Q61602 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gli3Q61602 Gm15411-201ENSMUST00000133243 3488 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gli3Q61602 Gm13031-201ENSMUST00000140501 924 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gli3Q61602 Gm15699-201ENSMUST00000159213 280 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gli3Q61602 Pax5-212ENSMUST00000173733 885 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gli3Q61602 1700084F23Rik-202ENSMUST00000188461 747 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gli3Q61602 Gm42133-201ENSMUST00000196076 637 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gli3Q61602 Hamp2-203ENSMUST00000217812 437 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gli3Q61602 Rps4l-ps-201ENSMUST00000059737 768 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Gli3Q61602 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gli3Q61602 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gli3Q61602 Nxpe1-ps-201ENSMUST00000209981 1454 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Gli3Q61602 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gli3Q61602 Pole-202ENSMUST00000112481 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gli3Q61602 Gm15984-202ENSMUST00000156466 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gli3Q61602 Gm20052-201ENSMUST00000200831 1525 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gli3Q61602 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gli3Q61602 H2afv-202ENSMUST00000109737 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gli3Q61602 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gli3Q61602 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gli3Q61602 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gli3Q61602 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gli3Q61602 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gli3Q61602 Vcp-rs-201ENSMUST00000120233 2406 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Gli3Q61602 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gli3Q61602 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gli3Q61602 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Gli3Q61602 Gm42971-201ENSMUST00000199228 2079 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Gli3Q61602 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gli3Q61602 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gli3Q61602 Scp2-202ENSMUST00000106701 772 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gli3Q61602 Tomm5-203ENSMUST00000107809 738 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gli3Q61602 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gli3Q61602 Camk2a-204ENSMUST00000115295 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gli3Q61602 Ccl19-ps1-201ENSMUST00000119621 327 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Gli3Q61602 Ywhaq-ps3-201ENSMUST00000120944 738 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Gli3Q61602 Gm14817-201ENSMUST00000148522 643 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gli3Q61602 Arl14-201ENSMUST00000183126 1200 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gli3Q61602 Gm5851-201ENSMUST00000194132 1204 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Gli3Q61602 Gm33969-201ENSMUST00000197615 388 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gli3Q61602 AC156633.1-201ENSMUST00000215971 614 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gli3Q61602 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gli3Q61602 Gm9531-201ENSMUST00000055820 638 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gli3Q61602 Olfr61-201ENSMUST00000084455 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gli3Q61602 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gli3Q61602 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gli3Q61602 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Gli3Q61602 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gli3Q61602 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Gli3Q61602 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gli3Q61602 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gli3Q61602 Ikbkg-204ENSMUST00000114128 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gli3Q61602 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gli3Q61602 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gli3Q61602 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gli3Q61602 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gli3Q61602 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gli3Q61602 Triml2-202ENSMUST00000209200 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gli3Q61602 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Gli3Q61602 Enpp7-201ENSMUST00000092373 1370 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gli3Q61602 Eid3-201ENSMUST00000211623 1305 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gli3Q61602 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gli3Q61602 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gli3Q61602 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
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Gli3Q61602 Gm25694-201ENSMUST00000175448 282 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
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Gli3Q61602 AC102327.1-201ENSMUST00000226389 742 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Gli3Q61602 AC163646.3-201ENSMUST00000228879 772 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Gli3Q61602 Fxyd1-201ENSMUST00000039909 620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gli3Q61602 Gm5424-201ENSMUST00000053865 1240 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Gli3Q61602 Gm9244-201ENSMUST00000056767 2129 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Gli3Q61602 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gli3Q61602 Spata7-201ENSMUST00000048402 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gli3Q61602 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gli3Q61602 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gli3Q61602 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gli3Q61602 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gli3Q61602 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gli3Q61602 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gli3Q61602 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gli3Q61602 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gli3Q61602 Pfkfb2-208ENSMUST00000187089 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gli3Q61602 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gli3Q61602 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gli3Q61602 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gli3Q61602 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gli3Q61602 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gli3Q61602 Fbxl12os-203ENSMUST00000138471 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gli3Q61602 Gm29101-201ENSMUST00000188329 1471 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
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