Protein–RNA interactions for Protein: Q61398

Pcolce, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcolceQ61398 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
PcolceQ61398 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
PcolceQ61398 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
PcolceQ61398 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
PcolceQ61398 Gm10152-201ENSMUST00000193475 1344 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
PcolceQ61398 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
PcolceQ61398 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
PcolceQ61398 Ift22-205ENSMUST00000200157 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
PcolceQ61398 Fcna-201ENSMUST00000028307 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
PcolceQ61398 Pnpla6-202ENSMUST00000111070 4496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
PcolceQ61398 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
PcolceQ61398 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
PcolceQ61398 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
PcolceQ61398 Cd79b-201ENSMUST00000044228 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
PcolceQ61398 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
PcolceQ61398 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
PcolceQ61398 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
PcolceQ61398 Npr2-201ENSMUST00000030191 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
PcolceQ61398 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
PcolceQ61398 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
PcolceQ61398 AC129931.1-201ENSMUST00000228865 1861 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
PcolceQ61398 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
PcolceQ61398 Wapl-202ENSMUST00000090027 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
PcolceQ61398 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
PcolceQ61398 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
PcolceQ61398 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
PcolceQ61398 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
PcolceQ61398 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
PcolceQ61398 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
PcolceQ61398 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
PcolceQ61398 Gm13848-202ENSMUST00000211663 1560 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
PcolceQ61398 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
PcolceQ61398 Cyb5rl-202ENSMUST00000106756 1604 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
PcolceQ61398 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
PcolceQ61398 Dync1i2-202ENSMUST00000100028 2097 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
PcolceQ61398 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
PcolceQ61398 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
PcolceQ61398 Ptges3l-203ENSMUST00000107252 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
PcolceQ61398 Got2-ps1-201ENSMUST00000121655 1293 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
PcolceQ61398 Gm14441-201ENSMUST00000121960 540 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
PcolceQ61398 Gm17135-201ENSMUST00000167009 564 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
PcolceQ61398 Gm19353-201ENSMUST00000184561 445 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
PcolceQ61398 Gm27184-201ENSMUST00000185095 607 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
PcolceQ61398 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
PcolceQ61398 9230114K14Rik-203ENSMUST00000199547 437 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
PcolceQ61398 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
PcolceQ61398 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
PcolceQ61398 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
PcolceQ61398 Mmachc-201ENSMUST00000030453 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
PcolceQ61398 Rragd-202ENSMUST00000084747 4295 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
PcolceQ61398 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
PcolceQ61398 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
PcolceQ61398 Gm43773-201ENSMUST00000198548 2162 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
PcolceQ61398 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
PcolceQ61398 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
PcolceQ61398 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
PcolceQ61398 Oscar-203ENSMUST00000148012 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
PcolceQ61398 Cog4-201ENSMUST00000034203 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
PcolceQ61398 Zfp263-201ENSMUST00000023176 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
PcolceQ61398 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
PcolceQ61398 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
PcolceQ61398 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
PcolceQ61398 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
PcolceQ61398 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
PcolceQ61398 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
PcolceQ61398 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
PcolceQ61398 Tfr2-208ENSMUST00000199054 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
PcolceQ61398 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
PcolceQ61398 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
PcolceQ61398 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
PcolceQ61398 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
PcolceQ61398 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
PcolceQ61398 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
PcolceQ61398 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
PcolceQ61398 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
PcolceQ61398 Gm26584-201ENSMUST00000180551 3216 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
PcolceQ61398 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
PcolceQ61398 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
PcolceQ61398 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
PcolceQ61398 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
PcolceQ61398 AC154639.1-201ENSMUST00000224393 2849 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
PcolceQ61398 Cdc25a-204ENSMUST00000198308 2880 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
PcolceQ61398 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
PcolceQ61398 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
PcolceQ61398 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
PcolceQ61398 Cpa5-202ENSMUST00000115138 1778 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
PcolceQ61398 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
PcolceQ61398 Tiam1-214ENSMUST00000164263 3569 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
PcolceQ61398 Gm43760-201ENSMUST00000202120 3015 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
PcolceQ61398 Accs-202ENSMUST00000068513 1872 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
PcolceQ61398 Urad-201ENSMUST00000100433 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
PcolceQ61398 Cd300ld2-202ENSMUST00000106578 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
PcolceQ61398 Gngt2-205ENSMUST00000107711 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
PcolceQ61398 Gm12165-201ENSMUST00000117047 342 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
PcolceQ61398 Gm14460-201ENSMUST00000121511 639 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
PcolceQ61398 Rps2-ps4-201ENSMUST00000121977 633 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
PcolceQ61398 Gm13205-201ENSMUST00000123548 562 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
PcolceQ61398 AA672651-201ENSMUST00000151550 489 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
PcolceQ61398 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
PcolceQ61398 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms