Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDK1

Trafd1, TRAF-type zinc finger domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trafd1Q3UDK1 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Trafd1Q3UDK1 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Trafd1Q3UDK1 Dpep2-206ENSMUST00000227363 1844 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Trafd1Q3UDK1 Entpd4-201ENSMUST00000064831 1842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Trafd1Q3UDK1 Chl1-204ENSMUST00000203912 4628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Trafd1Q3UDK1 Tfr2-201ENSMUST00000031729 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Trafd1Q3UDK1 Vcp-201ENSMUST00000030164 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Trafd1Q3UDK1 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Trafd1Q3UDK1 Spats2l-211ENSMUST00000169772 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Trafd1Q3UDK1 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Trafd1Q3UDK1 Gm11511-201ENSMUST00000118146 540 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Trafd1Q3UDK1 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Trafd1Q3UDK1 Gm12997-201ENSMUST00000120207 640 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Trafd1Q3UDK1 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Trafd1Q3UDK1 Gm16570-201ENSMUST00000161951 436 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Trafd1Q3UDK1 Cryge-202ENSMUST00000161960 690 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Trafd1Q3UDK1 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Trafd1Q3UDK1 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Trafd1Q3UDK1 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Trafd1Q3UDK1 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Trafd1Q3UDK1 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Trafd1Q3UDK1 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Trafd1Q3UDK1 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Trafd1Q3UDK1 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Trafd1Q3UDK1 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Trafd1Q3UDK1 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Trafd1Q3UDK1 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Trafd1Q3UDK1 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Trafd1Q3UDK1 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Trafd1Q3UDK1 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Trafd1Q3UDK1 Gusb-201ENSMUST00000026613 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Trafd1Q3UDK1 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Trafd1Q3UDK1 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Trafd1Q3UDK1 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Trafd1Q3UDK1 Klhl14-202ENSMUST00000122333 4423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Trafd1Q3UDK1 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Trafd1Q3UDK1 Pkn1-208ENSMUST00000144258 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Trafd1Q3UDK1 Rnf144a-202ENSMUST00000062149 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Trafd1Q3UDK1 Olfm4-201ENSMUST00000088735 1640 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Trafd1Q3UDK1 Rbm47-209ENSMUST00000201544 5211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Trafd1Q3UDK1 Banp-204ENSMUST00000170857 5444 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Trafd1Q3UDK1 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Trafd1Q3UDK1 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Trafd1Q3UDK1 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Trafd1Q3UDK1 Scn8a-208ENSMUST00000200963 5814 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Trafd1Q3UDK1 Dao-202ENSMUST00000112292 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Trafd1Q3UDK1 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Trafd1Q3UDK1 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Trafd1Q3UDK1 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Trafd1Q3UDK1 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Trafd1Q3UDK1 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Trafd1Q3UDK1 BC024139-202ENSMUST00000089654 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Trafd1Q3UDK1 Neat1-202ENSMUST00000174287 3004 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Trafd1Q3UDK1 Col9a1-202ENSMUST00000088349 3059 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Trafd1Q3UDK1 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Trafd1Q3UDK1 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Trafd1Q3UDK1 Tex2-201ENSMUST00000042780 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Trafd1Q3UDK1 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Trafd1Q3UDK1 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Trafd1Q3UDK1 Gabrr2-202ENSMUST00000108162 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Trafd1Q3UDK1 Nnt-203ENSMUST00000109204 3198 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Trafd1Q3UDK1 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Trafd1Q3UDK1 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Trafd1Q3UDK1 Maml3-201ENSMUST00000118075 5450 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Trafd1Q3UDK1 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Trafd1Q3UDK1 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Trafd1Q3UDK1 Nol3-201ENSMUST00000014920 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Trafd1Q3UDK1 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Trafd1Q3UDK1 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Trafd1Q3UDK1 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Trafd1Q3UDK1 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Trafd1Q3UDK1 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Trafd1Q3UDK1 Mir7070-201ENSMUST00000183657 86 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Trafd1Q3UDK1 Gm19744-202ENSMUST00000186135 948 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Trafd1Q3UDK1 CT571245.2-201ENSMUST00000218421 305 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Trafd1Q3UDK1 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Trafd1Q3UDK1 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Trafd1Q3UDK1 Rab19-201ENSMUST00000031986 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Trafd1Q3UDK1 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Trafd1Q3UDK1 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Trafd1Q3UDK1 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Trafd1Q3UDK1 Kifc5b-201ENSMUST00000078961 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Trafd1Q3UDK1 Traf7-202ENSMUST00000088464 2504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Trafd1Q3UDK1 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Trafd1Q3UDK1 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Trafd1Q3UDK1 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Trafd1Q3UDK1 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Trafd1Q3UDK1 Dlk1-201ENSMUST00000056110 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Trafd1Q3UDK1 Dsc2-202ENSMUST00000075214 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Trafd1Q3UDK1 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Trafd1Q3UDK1 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Trafd1Q3UDK1 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Trafd1Q3UDK1 Slc2a4-201ENSMUST00000018710 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Trafd1Q3UDK1 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Trafd1Q3UDK1 Spats2l-201ENSMUST00000163239 2313 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Trafd1Q3UDK1 Scpep1-201ENSMUST00000000287 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Trafd1Q3UDK1 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Trafd1Q3UDK1 Gm13553-201ENSMUST00000133025 1970 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Trafd1Q3UDK1 Lgsn-201ENSMUST00000062560 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Trafd1Q3UDK1 Tpst1-202ENSMUST00000118993 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms