Protein–RNA interactions for Protein: Q3U827

Rnf180, E3 ubiquitin-protein ligase RNF180, mousemouse

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Length 592 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf180Q3U827 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rnf180Q3U827 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rnf180Q3U827 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rnf180Q3U827 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rnf180Q3U827 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rnf180Q3U827 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rnf180Q3U827 Adgb-201ENSMUST00000045328 1893 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rnf180Q3U827 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rnf180Q3U827 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rnf180Q3U827 Lime1-202ENSMUST00000108804 960 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rnf180Q3U827 Gm11191-201ENSMUST00000117231 610 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Rnf180Q3U827 Gm8111-201ENSMUST00000117659 987 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Rnf180Q3U827 Gm14639-201ENSMUST00000120850 866 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Rnf180Q3U827 Gm16013-201ENSMUST00000152249 353 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rnf180Q3U827 Gm26379-201ENSMUST00000178125 138 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Rnf180Q3U827 Gm26906-201ENSMUST00000180523 1228 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rnf180Q3U827 Gm9192-201ENSMUST00000183221 985 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Rnf180Q3U827 Gm21577-201ENSMUST00000190823 697 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Rnf180Q3U827 Gm20802-201ENSMUST00000190832 698 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Rnf180Q3U827 Gm38349-201ENSMUST00000195732 462 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Rnf180Q3U827 Ndufa4-205ENSMUST00000204978 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rnf180Q3U827 3110083C13Rik-202ENSMUST00000224786 907 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Rnf180Q3U827 Dcpp2-201ENSMUST00000088598 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rnf180Q3U827 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rnf180Q3U827 Gm8155-201ENSMUST00000216363 1612 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Rnf180Q3U827 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rnf180Q3U827 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rnf180Q3U827 Csde1-207ENSMUST00000197827 2671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rnf180Q3U827 Gm8094-201ENSMUST00000165136 1408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rnf180Q3U827 Gm35963-201ENSMUST00000211762 1425 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rnf180Q3U827 Wfdc8-202ENSMUST00000109338 1794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rnf180Q3U827 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rnf180Q3U827 CT010480.4-201ENSMUST00000224654 2283 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Rnf180Q3U827 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rnf180Q3U827 Zscan21-201ENSMUST00000062350 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rnf180Q3U827 Gadl1-202ENSMUST00000119291 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rnf180Q3U827 2700038G22Rik-201ENSMUST00000181574 1375 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rnf180Q3U827 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rnf180Q3U827 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rnf180Q3U827 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rnf180Q3U827 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rnf180Q3U827 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rnf180Q3U827 Ccdc78-201ENSMUST00000095500 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rnf180Q3U827 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rnf180Q3U827 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rnf180Q3U827 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rnf180Q3U827 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rnf180Q3U827 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rnf180Q3U827 Evl-204ENSMUST00000172409 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rnf180Q3U827 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rnf180Q3U827 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rnf180Q3U827 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rnf180Q3U827 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rnf180Q3U827 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rnf180Q3U827 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rnf180Q3U827 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rnf180Q3U827 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rnf180Q3U827 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
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Rnf180Q3U827 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rnf180Q3U827 Slc44a4-202ENSMUST00000169230 2246 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rnf180Q3U827 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rnf180Q3U827 Gm37582-201ENSMUST00000192953 1409 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Rnf180Q3U827 Olfr171-202ENSMUST00000205467 1406 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rnf180Q3U827 Vstm2a-202ENSMUST00000109647 1745 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rnf180Q3U827 Gm30504-201ENSMUST00000209316 1688 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rnf180Q3U827 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rnf180Q3U827 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rnf180Q3U827 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rnf180Q3U827 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rnf180Q3U827 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rnf180Q3U827 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rnf180Q3U827 Rufy2-204ENSMUST00000131718 2816 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rnf180Q3U827 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rnf180Q3U827 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rnf180Q3U827 Rpl15-202ENSMUST00000080281 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rnf180Q3U827 Setmar-201ENSMUST00000049246 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rnf180Q3U827 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rnf180Q3U827 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rnf180Q3U827 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rnf180Q3U827 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rnf180Q3U827 Arih1-202ENSMUST00000165322 1431 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rnf180Q3U827 Gm8873-201ENSMUST00000217847 1439 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Rnf180Q3U827 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
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