Protein–RNA interactions for Protein: Q00623

Apoa1, Apolipoprotein A-I, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoa1Q00623 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Apoa1Q00623 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Apoa1Q00623 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Apoa1Q00623 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Apoa1Q00623 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Apoa1Q00623 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Apoa1Q00623 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Apoa1Q00623 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Apoa1Q00623 Unk-201ENSMUST00000021116 3735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Apoa1Q00623 Mospd2-203ENSMUST00000112248 2487 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Apoa1Q00623 Htr1b-202ENSMUST00000183482 4724 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Apoa1Q00623 Abcg4-201ENSMUST00000034648 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Apoa1Q00623 Tnc-203ENSMUST00000107372 7106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Apoa1Q00623 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Apoa1Q00623 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Apoa1Q00623 Hnrnph2-203ENSMUST00000074950 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Apoa1Q00623 Pip5k1a-206ENSMUST00000107236 3618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Apoa1Q00623 Gm14698-201ENSMUST00000096420 4226 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Apoa1Q00623 Gm17746-201ENSMUST00000223429 3772 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Apoa1Q00623 Mmp25-201ENSMUST00000024696 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Apoa1Q00623 Calcoco1-204ENSMUST00000171838 2968 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Apoa1Q00623 Gm33677-201ENSMUST00000220074 2765 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Apoa1Q00623 4933406M09Rik-201ENSMUST00000162187 1768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Apoa1Q00623 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Apoa1Q00623 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Apoa1Q00623 Zfp217-202ENSMUST00000109155 5670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Apoa1Q00623 Abi1-211ENSMUST00000149719 3303 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Apoa1Q00623 Bmp1-201ENSMUST00000022693 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Apoa1Q00623 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Apoa1Q00623 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Apoa1Q00623 Ces3b-201ENSMUST00000074403 1907 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Apoa1Q00623 Gm28035-201ENSMUST00000139454 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Apoa1Q00623 Als2-204ENSMUST00000163058 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Apoa1Q00623 A130010J15Rik-204ENSMUST00000161235 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Apoa1Q00623 Gid8-202ENSMUST00000078687 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Apoa1Q00623 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Apoa1Q00623 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Apoa1Q00623 Ikzf2-202ENSMUST00000187184 2013 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Apoa1Q00623 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Apoa1Q00623 Tiprl-201ENSMUST00000043235 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Apoa1Q00623 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Apoa1Q00623 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Apoa1Q00623 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Apoa1Q00623 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Apoa1Q00623 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Apoa1Q00623 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Apoa1Q00623 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Apoa1Q00623 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Apoa1Q00623 Gm6114-201ENSMUST00000182472 968 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Apoa1Q00623 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Apoa1Q00623 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Apoa1Q00623 Gm43002-201ENSMUST00000200310 155 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Apoa1Q00623 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Apoa1Q00623 Emp3-203ENSMUST00000210297 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Apoa1Q00623 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Apoa1Q00623 B230303A05Rik-204ENSMUST00000223006 748 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Apoa1Q00623 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Apoa1Q00623 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Apoa1Q00623 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Apoa1Q00623 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Apoa1Q00623 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Apoa1Q00623 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Apoa1Q00623 Topbp1-201ENSMUST00000035164 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Apoa1Q00623 Pex11g-201ENSMUST00000004686 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Apoa1Q00623 Mmel1-203ENSMUST00000105634 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Apoa1Q00623 Plcd4-206ENSMUST00000113750 2692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Apoa1Q00623 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Apoa1Q00623 Map4-214ENSMUST00000199498 4055 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Apoa1Q00623 6030458C11Rik-204ENSMUST00000228177 3156 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Apoa1Q00623 AC131586.1-201ENSMUST00000228844 2964 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Apoa1Q00623 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Apoa1Q00623 Nf1-202ENSMUST00000108251 9217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Apoa1Q00623 Vipas39-203ENSMUST00000179379 2418 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Apoa1Q00623 Loxhd1-202ENSMUST00000096547 6595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Apoa1Q00623 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Apoa1Q00623 Col6a3-201ENSMUST00000056925 10106 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Apoa1Q00623 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Apoa1Q00623 Col9a1-202ENSMUST00000088349 3059 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Apoa1Q00623 AC123738.2-201ENSMUST00000223791 1899 ntBASIC11.15□□□□□ -0.63
Apoa1Q00623 Ctps2-205ENSMUST00000112302 3223 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Apoa1Q00623 Tmem161a-201ENSMUST00000002413 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Apoa1Q00623 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Apoa1Q00623 Cdc37l1-201ENSMUST00000050148 5179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Apoa1Q00623 Agrn-203ENSMUST00000105575 7262 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Apoa1Q00623 Gm44913-201ENSMUST00000208060 2990 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Apoa1Q00623 Fibcd1-201ENSMUST00000028188 4751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Apoa1Q00623 Arg1-201ENSMUST00000020161 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Apoa1Q00623 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Apoa1Q00623 Scn8a-203ENSMUST00000108908 7030 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Apoa1Q00623 Adarb1-204ENSMUST00000105406 6662 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Apoa1Q00623 Fhl1-204ENSMUST00000114772 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Apoa1Q00623 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Apoa1Q00623 Dglucy-202ENSMUST00000110069 3058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Apoa1Q00623 Dcun1d3-202ENSMUST00000098080 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Apoa1Q00623 Madd-213ENSMUST00000111376 5927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Apoa1Q00623 Madd-206ENSMUST00000099725 5905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Apoa1Q00623 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Apoa1Q00623 Galr1-201ENSMUST00000065224 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Apoa1Q00623 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Apoa1Q00623 Gm5419-201ENSMUST00000119301 527 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.5 ms