Protein–RNA interactions for Protein: P97952

Scn1b, Sodium channel subunit beta-1, mousemouse

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Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn1bP97952 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Scn1bP97952 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Scn1bP97952 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Scn1bP97952 Susd4-201ENSMUST00000085724 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Scn1bP97952 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Scn1bP97952 Fbxl18-202ENSMUST00000110766 7857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Scn1bP97952 Timeless-201ENSMUST00000055539 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Scn1bP97952 Exoc3l4-201ENSMUST00000072646 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Scn1bP97952 Add2-204ENSMUST00000203366 3407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Scn1bP97952 Ric8a-201ENSMUST00000026558 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Scn1bP97952 Tat-201ENSMUST00000001720 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Scn1bP97952 Mroh8-202ENSMUST00000143663 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Scn1bP97952 Tnk2-207ENSMUST00000115126 4358 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Scn1bP97952 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Scn1bP97952 Fam234b-201ENSMUST00000111915 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Scn1bP97952 Pphln1-201ENSMUST00000049122 4023 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Scn1bP97952 Nup50-201ENSMUST00000165443 4741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Scn1bP97952 Pcdhga7-201ENSMUST00000192511 4730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Scn1bP97952 Zfp174-201ENSMUST00000041778 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Scn1bP97952 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Scn1bP97952 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Scn1bP97952 Gpc6-202ENSMUST00000088483 3488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Scn1bP97952 Spem2-201ENSMUST00000056941 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Scn1bP97952 B3galt5-201ENSMUST00000099497 5147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Scn1bP97952 Gm5703-201ENSMUST00000186658 3973 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Scn1bP97952 Atxn1-201ENSMUST00000091628 10569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Scn1bP97952 4932443L11Rik-202ENSMUST00000177130 2827 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Scn1bP97952 Rpap1-201ENSMUST00000048493 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Scn1bP97952 Pias2-203ENSMUST00000168882 4984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Scn1bP97952 Gm13556-201ENSMUST00000132692 1412 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Scn1bP97952 Pip4k2c-201ENSMUST00000013970 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Scn1bP97952 Gm29245-201ENSMUST00000187332 1416 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Scn1bP97952 Scaf1-201ENSMUST00000085383 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Scn1bP97952 Phip-201ENSMUST00000034787 10756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Scn1bP97952 Pex13-201ENSMUST00000020523 4146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Scn1bP97952 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Scn1bP97952 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Scn1bP97952 Tardbp-206ENSMUST00000105702 6425 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Scn1bP97952 Atg14-202ENSMUST00000226299 3729 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Scn1bP97952 Ccdc24-206ENSMUST00000164853 3990 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Scn1bP97952 Pnma2-201ENSMUST00000089236 5518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Scn1bP97952 St14-201ENSMUST00000034478 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Scn1bP97952 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Scn1bP97952 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Scn1bP97952 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Scn1bP97952 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Scn1bP97952 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Scn1bP97952 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Scn1bP97952 Gm12907-201ENSMUST00000148027 507 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Scn1bP97952 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Scn1bP97952 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Scn1bP97952 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Scn1bP97952 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Scn1bP97952 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Scn1bP97952 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Scn1bP97952 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Scn1bP97952 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Scn1bP97952 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Scn1bP97952 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Scn1bP97952 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Scn1bP97952 Colec12-201ENSMUST00000040069 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Scn1bP97952 Col11a1-201ENSMUST00000092155 7667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Scn1bP97952 Serhl-205ENSMUST00000166427 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Scn1bP97952 Akap10-203ENSMUST00000108710 3394 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Scn1bP97952 Tom1l2-206ENSMUST00000102683 4999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Scn1bP97952 Ccdc162-212ENSMUST00000219054 3182 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Scn1bP97952 Ppp6r3-203ENSMUST00000172362 4633 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Scn1bP97952 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Scn1bP97952 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Scn1bP97952 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Scn1bP97952 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Scn1bP97952 Tti2-204ENSMUST00000210129 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Scn1bP97952 Dhx38-201ENSMUST00000042601 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Scn1bP97952 Synpr-201ENSMUST00000070323 2541 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Scn1bP97952 Ncdn-201ENSMUST00000030637 3681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Scn1bP97952 Plekhn1-204ENSMUST00000218699 3196 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Scn1bP97952 Bcl7a-202ENSMUST00000117971 4642 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Scn1bP97952 Supt16-201ENSMUST00000046709 4673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Scn1bP97952 Col6a4-201ENSMUST00000121963 7371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Scn1bP97952 Pyurf-201ENSMUST00000053386 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Scn1bP97952 Ccdc96-201ENSMUST00000060100 3585 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Scn1bP97952 Foxn2-201ENSMUST00000112238 5085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Scn1bP97952 Galnt9-202ENSMUST00000165856 1541 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Scn1bP97952 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Scn1bP97952 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Scn1bP97952 Pml-202ENSMUST00000114136 4343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Scn1bP97952 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Scn1bP97952 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Scn1bP97952 Amigo3-201ENSMUST00000085060 2543 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Scn1bP97952 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Scn1bP97952 1110028F11Rik-201ENSMUST00000137077 837 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Scn1bP97952 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Scn1bP97952 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Scn1bP97952 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Scn1bP97952 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Scn1bP97952 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Scn1bP97952 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Scn1bP97952 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Scn1bP97952 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Scn1bP97952 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
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