Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 680 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Sh3bp1P55194 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Sh3bp1P55194 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Sh3bp1P55194 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sh3bp1P55194 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sh3bp1P55194 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sh3bp1P55194 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sh3bp1P55194 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sh3bp1P55194 Gm37333-201ENSMUST00000192904 2251 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Sh3bp1P55194 Sema4c-202ENSMUST00000191642 3892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sh3bp1P55194 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sh3bp1P55194 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sh3bp1P55194 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Sh3bp1P55194 Sel1l-210ENSMUST00000178462 6150 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sh3bp1P55194 Il27ra-201ENSMUST00000005601 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sh3bp1P55194 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sh3bp1P55194 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sh3bp1P55194 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sh3bp1P55194 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sh3bp1P55194 Sfxn2-201ENSMUST00000026011 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sh3bp1P55194 Atp1a3-205ENSMUST00000196684 3642 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sh3bp1P55194 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sh3bp1P55194 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sh3bp1P55194 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sh3bp1P55194 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sh3bp1P55194 Zfp597-201ENSMUST00000090522 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sh3bp1P55194 Oprm1-212ENSMUST00000105603 2053 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sh3bp1P55194 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sh3bp1P55194 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Sh3bp1P55194 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Sh3bp1P55194 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sh3bp1P55194 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sh3bp1P55194 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sh3bp1P55194 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sh3bp1P55194 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sh3bp1P55194 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Sh3bp1P55194 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Sh3bp1P55194 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sh3bp1P55194 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sh3bp1P55194 4930451G09Rik-201ENSMUST00000090457 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sh3bp1P55194 Cttnbp2nl-201ENSMUST00000077548 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sh3bp1P55194 Grem1-201ENSMUST00000099575 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sh3bp1P55194 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Sh3bp1P55194 Tfr2-206ENSMUST00000198783 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sh3bp1P55194 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sh3bp1P55194 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sh3bp1P55194 Sec14l1-202ENSMUST00000090433 4654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sh3bp1P55194 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sh3bp1P55194 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sh3bp1P55194 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sh3bp1P55194 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sh3bp1P55194 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sh3bp1P55194 Als2cl-206ENSMUST00000155014 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sh3bp1P55194 Chd7-206ENSMUST00000170391 3462 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sh3bp1P55194 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sh3bp1P55194 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sh3bp1P55194 Lpar1-203ENSMUST00000107571 3543 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sh3bp1P55194 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sh3bp1P55194 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sh3bp1P55194 Dmbt1-206ENSMUST00000213064 5779 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sh3bp1P55194 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sh3bp1P55194 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sh3bp1P55194 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sh3bp1P55194 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sh3bp1P55194 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sh3bp1P55194 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sh3bp1P55194 Aar2-202ENSMUST00000109570 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sh3bp1P55194 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sh3bp1P55194 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sh3bp1P55194 Nrf1-206ENSMUST00000115204 2047 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sh3bp1P55194 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sh3bp1P55194 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Sh3bp1P55194 Prr5l-210ENSMUST00000171088 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sh3bp1P55194 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sh3bp1P55194 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Sh3bp1P55194 Pcdhga4-201ENSMUST00000194418 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sh3bp1P55194 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Sh3bp1P55194 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sh3bp1P55194 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Sh3bp1P55194 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Sh3bp1P55194 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sh3bp1P55194 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sh3bp1P55194 Arhgef28-201ENSMUST00000109426 5387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sh3bp1P55194 Plekha7-202ENSMUST00000181981 4633 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sh3bp1P55194 Chl1-204ENSMUST00000203912 4628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sh3bp1P55194 Tfip11-201ENSMUST00000031288 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sh3bp1P55194 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sh3bp1P55194 Zcchc7-203ENSMUST00000107824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sh3bp1P55194 Plin4-201ENSMUST00000002908 5755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sh3bp1P55194 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Sh3bp1P55194 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sh3bp1P55194 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Sh3bp1P55194 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sh3bp1P55194 Gm12296-201ENSMUST00000144922 3220 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sh3bp1P55194 Natd1-201ENSMUST00000019075 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sh3bp1P55194 Gm45449-201ENSMUST00000211485 1960 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sh3bp1P55194 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Sh3bp1P55194 Cyp11b1-201ENSMUST00000170259 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sh3bp1P55194 Tmprss3-201ENSMUST00000024833 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sh3bp1P55194 Gm42669-202ENSMUST00000160160 3080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.3 ms