Protein–RNA interactions for Protein: P36941

LTBR, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBRP36941 TIMP1-205ENST00000456754 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LTBRP36941 BPIFB5P-201ENST00000457066 1099 ntBASIC15.04■□□□□ -0
LTBRP36941 ALG1L3P-201ENST00000503331 765 ntBASIC15.04■□□□□ -0
LTBRP36941 AC132803.1-201ENST00000504204 493 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
LTBRP36941 RPS23-207ENST00000511844 530 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
LTBRP36941 WDYHV1-206ENST00000523356 869 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
LTBRP36941 ANO3-205ENST00000531646 1264 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
LTBRP36941 CYB561A3-208ENST00000536915 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
LTBRP36941 LINC01154-201ENST00000548617 454 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
LTBRP36941 LINC01500-204ENST00000556815 752 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
LTBRP36941 AC068831.5-201ENST00000557387 328 ntBASIC15.04■□□□□ -0
LTBRP36941 AC016266.1-201ENST00000557558 729 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
LTBRP36941 AC012174.1-201ENST00000562349 714 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
LTBRP36941 C19orf70-203ENST00000587589 577 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
LTBRP36941 AC021016.3-201ENST00000608367 477 ntBASIC15.04■□□□□ -0
LTBRP36941 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LTBRP36941 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
LTBRP36941 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LTBRP36941 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LTBRP36941 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
LTBRP36941 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LTBRP36941 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LTBRP36941 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
LTBRP36941 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
LTBRP36941 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
LTBRP36941 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LTBRP36941 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LTBRP36941 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LTBRP36941 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
LTBRP36941 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
LTBRP36941 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
LTBRP36941 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LTBRP36941 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
LTBRP36941 EIF4E2-201ENST00000258416 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LTBRP36941 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LTBRP36941 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LTBRP36941 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LTBRP36941 ATAT1-206ENST00000376485 1476 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
LTBRP36941 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
LTBRP36941 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
LTBRP36941 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LTBRP36941 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LTBRP36941 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LTBRP36941 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LTBRP36941 AL109809.1-201ENST00000418979 1367 ntBASIC15.03■□□□□ -0
LTBRP36941 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LTBRP36941 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LTBRP36941 LAMP5-202ENST00000427562 1309 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
LTBRP36941 DHRS7-209ENST00000557185 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LTBRP36941 ZNF286A-201ENST00000395893 654 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
LTBRP36941 KCNE1-203ENST00000399286 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LTBRP36941 RANGRF-202ENST00000407006 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LTBRP36941 AC018814.1-201ENST00000418972 357 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
LTBRP36941 AC006329.1-201ENST00000419422 705 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
LTBRP36941 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LTBRP36941 AL929302.1-201ENST00000426556 871 ntBASIC15.03■□□□□ -0
LTBRP36941 AL157832.2-206ENST00000428178 601 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
LTBRP36941 AC006372.2-201ENST00000433660 292 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
LTBRP36941 HDAC2-AS2-203ENST00000436876 591 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
LTBRP36941 AL035413.1-201ENST00000437898 507 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
LTBRP36941 GH2-203ENST00000449787 753 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LTBRP36941 MRPL43-211ENST00000477279 903 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
LTBRP36941 MRPS36-204ENST00000512880 1200 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
LTBRP36941 AP000866.5-201ENST00000531241 445 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
LTBRP36941 AC079949.1-201ENST00000541419 505 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
LTBRP36941 AC079174.1-201ENST00000552486 312 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
LTBRP36941 FOXN3-AS2-201ENST00000554071 1262 ntBASIC15.03■□□□□ -0
LTBRP36941 LINC02285-201ENST00000557121 943 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
LTBRP36941 NDUFB10P1-201ENST00000567319 521 ntBASIC15.03■□□□□ -0
LTBRP36941 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LTBRP36941 NAV1-210ENST00000593583 726 ntBASIC15.03■□□□□ -0
LTBRP36941 MRPS36-205ENST00000602380 1200 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
LTBRP36941 APOBEC3H-207ENST00000613996 465 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LTBRP36941 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
LTBRP36941 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
LTBRP36941 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LTBRP36941 SARS2-202ENST00000430193 1886 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
LTBRP36941 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LTBRP36941 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LTBRP36941 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LTBRP36941 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LTBRP36941 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LTBRP36941 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LTBRP36941 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LTBRP36941 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
LTBRP36941 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
LTBRP36941 LACTB2-201ENST00000276590 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
LTBRP36941 MRPS10-201ENST00000053468 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
LTBRP36941 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
LTBRP36941 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
LTBRP36941 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
LTBRP36941 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
LTBRP36941 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
LTBRP36941 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
LTBRP36941 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
LTBRP36941 PDYN-AS1-201ENST00000446562 1802 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
LTBRP36941 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
LTBRP36941 CST5-201ENST00000304710 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
LTBRP36941 SULT1A1-201ENST00000314752 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
LTBRP36941 OTOS-201ENST00000319460 566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms