Protein–RNA interactions for Protein: P29120

PCSK1, Neuroendocrine convertase 1, humanhuman

Predictions only

Length 753 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCSK1P29120 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PCSK1P29120 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PCSK1P29120 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PCSK1P29120 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PCSK1P29120 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PCSK1P29120 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PCSK1P29120 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PCSK1P29120 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PCSK1P29120 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PCSK1P29120 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PCSK1P29120 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PCSK1P29120 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PCSK1P29120 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PCSK1P29120 SERPINA13P-202ENST00000478994 924 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PCSK1P29120 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PCSK1P29120 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PCSK1P29120 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PCSK1P29120 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PCSK1P29120 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PCSK1P29120 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PCSK1P29120 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PCSK1P29120 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PCSK1P29120 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PCSK1P29120 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PCSK1P29120 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PCSK1P29120 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PCSK1P29120 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PCSK1P29120 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PCSK1P29120 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PCSK1P29120 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PCSK1P29120 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PCSK1P29120 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PCSK1P29120 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PCSK1P29120 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PCSK1P29120 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PCSK1P29120 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PCSK1P29120 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PCSK1P29120 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PCSK1P29120 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PCSK1P29120 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PCSK1P29120 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PCSK1P29120 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PCSK1P29120 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PCSK1P29120 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PCSK1P29120 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PCSK1P29120 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PCSK1P29120 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PCSK1P29120 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PCSK1P29120 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PCSK1P29120 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PCSK1P29120 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PCSK1P29120 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PCSK1P29120 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PCSK1P29120 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PCSK1P29120 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PCSK1P29120 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PCSK1P29120 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PCSK1P29120 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PCSK1P29120 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PCSK1P29120 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PCSK1P29120 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PCSK1P29120 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PCSK1P29120 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PCSK1P29120 AC012441.2-201ENST00000444843 739 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PCSK1P29120 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PCSK1P29120 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PCSK1P29120 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PCSK1P29120 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PCSK1P29120 AC005586.1-201ENST00000488310 577 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PCSK1P29120 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PCSK1P29120 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PCSK1P29120 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PCSK1P29120 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PCSK1P29120 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PCSK1P29120 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PCSK1P29120 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PCSK1P29120 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PCSK1P29120 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PCSK1P29120 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PCSK1P29120 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PCSK1P29120 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PCSK1P29120 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PCSK1P29120 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PCSK1P29120 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PCSK1P29120 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PCSK1P29120 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PCSK1P29120 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PCSK1P29120 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PCSK1P29120 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PCSK1P29120 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PCSK1P29120 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PCSK1P29120 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PCSK1P29120 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PCSK1P29120 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PCSK1P29120 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PCSK1P29120 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PCSK1P29120 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PCSK1P29120 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PCSK1P29120 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PCSK1P29120 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.1 ms