Protein–RNA interactions for Protein: P28704

Rxrb, Retinoic acid receptor RXR-beta, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxrbP28704 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
RxrbP28704 Dnajb12-204ENSMUST00000146590 3070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
RxrbP28704 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
RxrbP28704 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
RxrbP28704 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
RxrbP28704 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
RxrbP28704 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
RxrbP28704 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
RxrbP28704 Gm9192-201ENSMUST00000183221 985 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
RxrbP28704 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
RxrbP28704 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
RxrbP28704 Cysrt1-201ENSMUST00000043379 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
RxrbP28704 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
RxrbP28704 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
RxrbP28704 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
RxrbP28704 Rab27b-201ENSMUST00000069749 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
RxrbP28704 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
RxrbP28704 Ppp4r1-201ENSMUST00000073104 3850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
RxrbP28704 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
RxrbP28704 Gm6793-201ENSMUST00000071732 1604 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
RxrbP28704 Tmem8b-209ENSMUST00000167153 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
RxrbP28704 Vstm2a-201ENSMUST00000109645 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
RxrbP28704 AC174678.2-201ENSMUST00000156420 3275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
RxrbP28704 AC169511.2-201ENSMUST00000226674 2063 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
RxrbP28704 Ppara-201ENSMUST00000057979 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
RxrbP28704 Themis2-201ENSMUST00000045154 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
RxrbP28704 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
RxrbP28704 5930430L01Rik-201ENSMUST00000145042 3994 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
RxrbP28704 Cald1-205ENSMUST00000115027 4777 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
RxrbP28704 Gm29358-202ENSMUST00000187941 3227 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
RxrbP28704 Msh5-202ENSMUST00000097338 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
RxrbP28704 Tia1-206ENSMUST00000113713 3108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
RxrbP28704 Rnf41-201ENSMUST00000096386 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
RxrbP28704 Gm6124-201ENSMUST00000188240 2580 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
RxrbP28704 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
RxrbP28704 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
RxrbP28704 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
RxrbP28704 Myo15b-201ENSMUST00000040703 2825 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
RxrbP28704 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
RxrbP28704 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
RxrbP28704 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
RxrbP28704 Rpap2-202ENSMUST00000112650 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
RxrbP28704 Zfp420-202ENSMUST00000074876 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
RxrbP28704 Dpt-201ENSMUST00000027861 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
RxrbP28704 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
RxrbP28704 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
RxrbP28704 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
RxrbP28704 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
RxrbP28704 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
RxrbP28704 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
RxrbP28704 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
RxrbP28704 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
RxrbP28704 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
RxrbP28704 Gm11753-201ENSMUST00000151091 396 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
RxrbP28704 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
RxrbP28704 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
RxrbP28704 Gm36991-201ENSMUST00000191800 648 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
RxrbP28704 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
RxrbP28704 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
RxrbP28704 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
RxrbP28704 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
RxrbP28704 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
RxrbP28704 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
RxrbP28704 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
RxrbP28704 Gm13404-201ENSMUST00000156633 1960 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
RxrbP28704 Ntrk3-205ENSMUST00000193002 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
RxrbP28704 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
RxrbP28704 Unkl-204ENSMUST00000160896 4787 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
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RxrbP28704 Smim1-214ENSMUST00000182191 3535 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
RxrbP28704 Stau2-206ENSMUST00000128957 3907 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
RxrbP28704 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
RxrbP28704 4931429L15Rik-201ENSMUST00000159565 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
RxrbP28704 4931428F04Rik-202ENSMUST00000171788 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
RxrbP28704 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
RxrbP28704 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
RxrbP28704 Mpv17-202ENSMUST00000200744 1653 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
RxrbP28704 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
RxrbP28704 Dcst2-201ENSMUST00000208216 2285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
RxrbP28704 Clec16a-201ENSMUST00000038145 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
RxrbP28704 Mcm2-201ENSMUST00000058011 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
RxrbP28704 Dtl-201ENSMUST00000027933 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
RxrbP28704 Eno3-202ENSMUST00000108548 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
RxrbP28704 Cdh15-201ENSMUST00000034443 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
RxrbP28704 Ap1s2-203ENSMUST00000112294 3199 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
RxrbP28704 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
RxrbP28704 Itgb1bp1-206ENSMUST00000173729 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
RxrbP28704 Gm18798-201ENSMUST00000187264 1700 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
RxrbP28704 Uba1y-ps1-201ENSMUST00000188314 1708 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
RxrbP28704 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
RxrbP28704 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
RxrbP28704 Itgb2-201ENSMUST00000000299 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
RxrbP28704 Rasal1-201ENSMUST00000031606 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
RxrbP28704 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
RxrbP28704 4930432K21Rik-202ENSMUST00000118856 2366 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
RxrbP28704 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
RxrbP28704 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
RxrbP28704 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
RxrbP28704 AI854703-201ENSMUST00000095938 3517 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
RxrbP28704 Gm19327-201ENSMUST00000220651 3271 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
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