Protein–RNA interactions for Protein: P18530

Ig heavy chain V region 7-39, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18530 Abca3-202ENSMUST00000079594 6380 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
P18530 Foxn2-201ENSMUST00000112238 5085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
P18530 Gm20658-201ENSMUST00000175871 1489 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
P18530 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC9.55□□□□□ -0.88
P18530 Rnf20-210ENSMUST00000167496 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
P18530 C530043K16Rik-201ENSMUST00000201865 3109 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
P18530 Fam214a-205ENSMUST00000215370 4205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
P18530 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
P18530 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
P18530 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
P18530 AC091458.1-201ENSMUST00000220902 1361 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
P18530 Jmjd4-202ENSMUST00000108777 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
P18530 Arhgef28-201ENSMUST00000109426 5387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
P18530 Sumo3-203ENSMUST00000124024 776 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
P18530 Psma1-203ENSMUST00000135570 960 ntTSL 3 BASIC9.55□□□□□ -0.88
P18530 AA672651-201ENSMUST00000151550 489 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
P18530 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
P18530 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
P18530 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
P18530 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
P18530 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
P18530 Olfr1415-203ENSMUST00000204766 403 ntTSL 3 BASIC9.55□□□□□ -0.88
P18530 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
P18530 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
P18530 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
P18530 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
P18530 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
P18530 Axl-201ENSMUST00000002677 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
P18530 Pcgf3-201ENSMUST00000046975 7708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
P18530 Abi2-207ENSMUST00000188618 4723 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
P18530 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
P18530 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
P18530 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
P18530 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
P18530 Rbl2-210ENSMUST00000211136 4504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
P18530 Thsd4-202ENSMUST00000098660 8796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
P18530 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
P18530 Gm3836-201ENSMUST00000211377 1613 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
P18530 Olfm4-201ENSMUST00000088735 1640 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
P18530 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
P18530 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
P18530 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
P18530 Auts2-209ENSMUST00000161804 5392 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
P18530 Pcdh10-202ENSMUST00000170695 8234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
P18530 Zfp236-202ENSMUST00000182122 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
P18530 Btbd9-202ENSMUST00000168787 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
P18530 Sema5b-201ENSMUST00000050625 4350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
P18530 Grin1-208ENSMUST00000114318 3920 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
P18530 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
P18530 Triobp-204ENSMUST00000109690 7023 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
P18530 Wapl-202ENSMUST00000090027 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
P18530 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
P18530 Bmp3-203ENSMUST00000200388 6609 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
P18530 Parp9-203ENSMUST00000114878 3548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
P18530 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
P18530 Arhgef2-206ENSMUST00000175779 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
P18530 Myo18a-222ENSMUST00000168348 6582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
P18530 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
P18530 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
P18530 Dsc2-201ENSMUST00000039247 4630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
P18530 Grm1-202ENSMUST00000105560 4265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
P18530 Zfp654-202ENSMUST00000207826 6261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
P18530 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
P18530 Arg1-201ENSMUST00000020161 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
P18530 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
P18530 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
P18530 Pcdhgb4-202ENSMUST00000195363 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
P18530 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
P18530 Hyal3-202ENSMUST00000148440 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
P18530 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
P18530 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
P18530 Nf1-202ENSMUST00000108251 9217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
P18530 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
P18530 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
P18530 Matn2-201ENSMUST00000022947 3551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
P18530 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
P18530 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
P18530 Gm11700-201ENSMUST00000119409 403 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
P18530 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC9.54□□□□□ -0.88
P18530 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
P18530 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
P18530 Fam166b-206ENSMUST00000171134 1198 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
P18530 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
P18530 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
P18530 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
P18530 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
P18530 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
P18530 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
P18530 Cic-212ENSMUST00000169266 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
P18530 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
P18530 D130051D11Rik-201ENSMUST00000189171 6188 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
P18530 Btnl7-ps-201ENSMUST00000023469 1763 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
P18530 Nek5-202ENSMUST00000209656 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
P18530 Gtf2i-202ENSMUST00000082057 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
P18530 Bdkrb2-201ENSMUST00000001652 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
P18530 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
P18530 Sypl2-201ENSMUST00000141387 4090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
P18530 Tmem168-206ENSMUST00000149123 3337 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
P18530 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
P18530 4930432B10Rik-201ENSMUST00000181688 2085 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.1 ms