Protein–RNA interactions for Protein: P07349

Ifna5, Interferon alpha-5, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifna5P07349 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ifna5P07349 Olfr177-202ENSMUST00000217377 2401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ifna5P07349 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ifna5P07349 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ifna5P07349 Arfgap1-201ENSMUST00000029092 2714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ifna5P07349 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ifna5P07349 Ddx55-201ENSMUST00000071057 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ifna5P07349 4930488L21Rik-201ENSMUST00000181864 3244 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ifna5P07349 Fyco1-202ENSMUST00000167595 7692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ifna5P07349 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ifna5P07349 Pcdhgb8-201ENSMUST00000195764 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ifna5P07349 Gm20427-201ENSMUST00000168978 3703 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ifna5P07349 Fam214a-205ENSMUST00000215370 4205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ifna5P07349 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ifna5P07349 Pex11g-201ENSMUST00000004686 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ifna5P07349 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ifna5P07349 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ifna5P07349 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Ifna5P07349 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ifna5P07349 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ifna5P07349 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ifna5P07349 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ifna5P07349 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ifna5P07349 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ifna5P07349 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ifna5P07349 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ifna5P07349 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ifna5P07349 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ifna5P07349 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ifna5P07349 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Ifna5P07349 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ifna5P07349 Tbc1d14-204ENSMUST00000130417 2665 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ifna5P07349 Bcl2l14-201ENSMUST00000032321 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ifna5P07349 Slc25a42-202ENSMUST00000110127 3196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ifna5P07349 Eng-201ENSMUST00000009705 3422 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ifna5P07349 Pkp4-201ENSMUST00000037903 4378 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ifna5P07349 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ifna5P07349 Tcirg1-204ENSMUST00000126070 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ifna5P07349 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ifna5P07349 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ifna5P07349 AC154404.1-201ENSMUST00000223601 2077 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Ifna5P07349 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ifna5P07349 Mamld1-201ENSMUST00000082088 4796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ifna5P07349 Sec16a-201ENSMUST00000091252 8737 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ifna5P07349 Fli1-201ENSMUST00000016231 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ifna5P07349 Arhgef2-207ENSMUST00000175903 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ifna5P07349 Ncapd3-205ENSMUST00000216677 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ifna5P07349 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ifna5P07349 Shoc2-201ENSMUST00000025932 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ifna5P07349 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ifna5P07349 Zcchc4-201ENSMUST00000031077 5743 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ifna5P07349 Tns1-217ENSMUST00000191104 9904 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ifna5P07349 Trp73-205ENSMUST00000133533 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ifna5P07349 Egr2-201ENSMUST00000048289 2965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ifna5P07349 Gm45140-202ENSMUST00000204419 5061 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ifna5P07349 Gm13093-201ENSMUST00000126212 2485 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ifna5P07349 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ifna5P07349 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Ifna5P07349 Dbh-201ENSMUST00000000910 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ifna5P07349 Elavl2-201ENSMUST00000008633 3730 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ifna5P07349 Fam107b-201ENSMUST00000027965 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ifna5P07349 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ifna5P07349 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Ifna5P07349 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ifna5P07349 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ifna5P07349 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ifna5P07349 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ifna5P07349 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Ifna5P07349 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Ifna5P07349 Tfr2-208ENSMUST00000199054 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ifna5P07349 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ifna5P07349 Olfr1415-203ENSMUST00000204766 403 ntTSL 3 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ifna5P07349 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ifna5P07349 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ifna5P07349 Emp3-203ENSMUST00000210297 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ifna5P07349 Slc37a4-207ENSMUST00000215420 2128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ifna5P07349 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ifna5P07349 AC099934.4-201ENSMUST00000220745 523 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ifna5P07349 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ifna5P07349 Cdk19os-201ENSMUST00000044774 534 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ifna5P07349 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ifna5P07349 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ifna5P07349 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ifna5P07349 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ifna5P07349 Aicda-201ENSMUST00000043301 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ifna5P07349 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ifna5P07349 Foxn4-201ENSMUST00000044790 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ifna5P07349 Rnf40-201ENSMUST00000033088 3906 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ifna5P07349 Nefl-201ENSMUST00000022639 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ifna5P07349 Mcm2-201ENSMUST00000058011 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ifna5P07349 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ifna5P07349 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Ifna5P07349 Bpi-201ENSMUST00000065039 1926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ifna5P07349 Slc23a2-201ENSMUST00000028815 6364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ifna5P07349 Lrrc74b-203ENSMUST00000100123 2231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ifna5P07349 Pabpc1-201ENSMUST00000001809 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ifna5P07349 Bdkrb2-201ENSMUST00000001652 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ifna5P07349 Eps8l2-201ENSMUST00000026577 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ifna5P07349 Wif1-201ENSMUST00000020439 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ifna5P07349 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms