Protein–RNA interactions for Protein: O35740

Cited2, Cbp/p300-interacting transactivator 2, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cited2O35740 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Cited2O35740 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Cited2O35740 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
Cited2O35740 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Cited2O35740 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Cited2O35740 Plpbp-205ENSMUST00000209856 3954 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Cited2O35740 Pcdh11x-202ENSMUST00000113358 8607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Cited2O35740 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Cited2O35740 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Cited2O35740 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Cited2O35740 Spice1-201ENSMUST00000050897 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Cited2O35740 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Cited2O35740 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Cited2O35740 Tnxb-201ENSMUST00000087399 12209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Cited2O35740 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Cited2O35740 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Cited2O35740 Fam53a-203ENSMUST00000065162 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Cited2O35740 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Cited2O35740 Gm6092-201ENSMUST00000121659 2029 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Cited2O35740 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Cited2O35740 Gsdma2-201ENSMUST00000017355 1314 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Cited2O35740 Adora1-203ENSMUST00000169927 4581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Cited2O35740 Gm42463-201ENSMUST00000198041 4886 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Cited2O35740 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Cited2O35740 Mkl2-203ENSMUST00000115809 667 ntTSL 2 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Cited2O35740 Gm15711-201ENSMUST00000118889 535 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Cited2O35740 Gm12380-201ENSMUST00000119012 544 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Cited2O35740 Lamr1-ps1-201ENSMUST00000119759 874 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Cited2O35740 Gm12266-201ENSMUST00000120311 962 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Cited2O35740 Rpsa-ps12-201ENSMUST00000120596 892 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Cited2O35740 Gm10714-201ENSMUST00000131346 874 ntTSL 2 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Cited2O35740 Gm5616-201ENSMUST00000165252 384 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Cited2O35740 Gm17040-202ENSMUST00000170597 889 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Cited2O35740 Apoe-208ENSMUST00000174191 472 ntTSL 2 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Cited2O35740 Gm8741-201ENSMUST00000174736 384 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Cited2O35740 Ap1g1-206ENSMUST00000179104 1096 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Cited2O35740 Atraid-205ENSMUST00000201136 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Cited2O35740 Rpl17-ps3-201ENSMUST00000221295 556 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Cited2O35740 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Cited2O35740 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Cited2O35740 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Cited2O35740 Tnni3-201ENSMUST00000098859 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Cited2O35740 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Cited2O35740 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Cited2O35740 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Cited2O35740 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Cited2O35740 Lamb1-205ENSMUST00000169088 5557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Cited2O35740 Fam189b-201ENSMUST00000041913 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Cited2O35740 Armcx2-202ENSMUST00000113193 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Cited2O35740 Axl-201ENSMUST00000002677 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Cited2O35740 Als2cl-201ENSMUST00000084926 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Cited2O35740 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.87
Cited2O35740 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.87
Cited2O35740 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Cited2O35740 Rxra-206ENSMUST00000166775 3216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.87
Cited2O35740 Cd300lg-202ENSMUST00000107163 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Cited2O35740 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.87
Cited2O35740 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Cited2O35740 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Cited2O35740 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Cited2O35740 Gm9962-202ENSMUST00000186595 1417 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Cited2O35740 4932443L11Rik-202ENSMUST00000177130 2827 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Cited2O35740 Cyp4f16-208ENSMUST00000169591 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Cited2O35740 AC160562.2-201ENSMUST00000216374 2201 ntTSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Cited2O35740 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Cited2O35740 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Cited2O35740 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Cited2O35740 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Cited2O35740 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Cited2O35740 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Cited2O35740 P2rx7-203ENSMUST00000100737 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Cited2O35740 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Cited2O35740 Prrxl1-204ENSMUST00000189022 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Cited2O35740 Arvcf-204ENSMUST00000115613 4800 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Cited2O35740 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Cited2O35740 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Cited2O35740 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Cited2O35740 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Cited2O35740 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Cited2O35740 Dync1i2-202ENSMUST00000100028 2097 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Cited2O35740 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Cited2O35740 Gm23949-201ENSMUST00000104027 127 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Cited2O35740 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Cited2O35740 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Cited2O35740 Zfp629-204ENSMUST00000128731 823 ntTSL 3 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Cited2O35740 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Cited2O35740 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Cited2O35740 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Cited2O35740 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Cited2O35740 Anapc16-202ENSMUST00000182116 581 ntTSL 3 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Cited2O35740 Eloc-207ENSMUST00000187910 620 ntTSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Cited2O35740 Gm28071-201ENSMUST00000190355 478 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Cited2O35740 Gm44136-201ENSMUST00000203819 1106 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Cited2O35740 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Cited2O35740 Abhd14a-201ENSMUST00000048685 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Cited2O35740 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Cited2O35740 4933406M09Rik-201ENSMUST00000162187 1768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Cited2O35740 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Cited2O35740 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Cited2O35740 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.4 ms