Protein–RNA interactions for Protein: O09165

Casq1, Calsequestrin-1, mousemouse

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Length 405 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casq1O09165 Muc3-201ENSMUST00000041226 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Casq1O09165 Slc2a7-201ENSMUST00000059893 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Casq1O09165 Prok1-202ENSMUST00000197758 3063 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Casq1O09165 Awat2-202ENSMUST00000147103 1984 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Casq1O09165 Slc26a2-202ENSMUST00000146409 7814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Casq1O09165 Pdik1l-203ENSMUST00000105877 4674 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Casq1O09165 Pnmal2-201ENSMUST00000094807 4147 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Casq1O09165 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Casq1O09165 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Casq1O09165 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Casq1O09165 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Casq1O09165 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Casq1O09165 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Casq1O09165 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Casq1O09165 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Casq1O09165 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Casq1O09165 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Casq1O09165 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Casq1O09165 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Casq1O09165 Rpp38-201ENSMUST00000062672 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Casq1O09165 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Casq1O09165 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Casq1O09165 4933431E20Rik-201ENSMUST00000131345 5407 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Casq1O09165 Rgs8-201ENSMUST00000041776 8474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Casq1O09165 Slc19a1-201ENSMUST00000105410 2347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Casq1O09165 Hvcn1-202ENSMUST00000100747 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Casq1O09165 Armc3-202ENSMUST00000114640 2818 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Casq1O09165 Rab27b-201ENSMUST00000069749 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Casq1O09165 Ssh1-201ENSMUST00000077689 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Casq1O09165 Madd-211ENSMUST00000111373 5641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Casq1O09165 Cad-203ENSMUST00000200953 6489 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Casq1O09165 Ddx56-201ENSMUST00000004507 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Casq1O09165 Pls3-201ENSMUST00000033547 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Casq1O09165 Erich3-203ENSMUST00000189969 3460 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Casq1O09165 4933407I05Rik-204ENSMUST00000217562 1561 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Casq1O09165 Gm7642-201ENSMUST00000216345 1809 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Casq1O09165 Zfp93-201ENSMUST00000032696 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Casq1O09165 Nr5a1-201ENSMUST00000028084 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Casq1O09165 Asl-203ENSMUST00000160129 2413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Casq1O09165 Dusp10-201ENSMUST00000048655 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Casq1O09165 Phldb2-201ENSMUST00000036355 5483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Casq1O09165 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Casq1O09165 Gm18806-201ENSMUST00000207607 1775 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Casq1O09165 Ascc2-202ENSMUST00000109930 4844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Casq1O09165 Hdac7-205ENSMUST00000118294 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Casq1O09165 Trav13d-4-201ENSMUST00000103607 264 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Casq1O09165 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Casq1O09165 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Casq1O09165 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Casq1O09165 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Casq1O09165 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Casq1O09165 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Casq1O09165 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Casq1O09165 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Casq1O09165 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Casq1O09165 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Casq1O09165 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Casq1O09165 Trav13-4-dv7-202ENSMUST00000184905 264 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Casq1O09165 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Casq1O09165 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Casq1O09165 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Casq1O09165 Slc6a12-205ENSMUST00000166457 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Casq1O09165 Jaml-201ENSMUST00000050020 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Casq1O09165 AC127597.1-201ENSMUST00000225697 5711 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Casq1O09165 Atp6v1d-201ENSMUST00000021536 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Casq1O09165 Pdha1-201ENSMUST00000033662 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Casq1O09165 Gm2822-201ENSMUST00000164299 2910 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Casq1O09165 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Casq1O09165 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Casq1O09165 Ccdc15-206ENSMUST00000217238 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Casq1O09165 Nol6-201ENSMUST00000030138 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Casq1O09165 Pak6-201ENSMUST00000099557 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Casq1O09165 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Casq1O09165 Cyp26b1-202ENSMUST00000168003 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Casq1O09165 Cyp26b1-201ENSMUST00000077705 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Casq1O09165 C5ar1-202ENSMUST00000168818 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Casq1O09165 Rab19-201ENSMUST00000031986 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Casq1O09165 1700025G04Rik-201ENSMUST00000044581 9559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Casq1O09165 Smc4-202ENSMUST00000107803 3983 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Casq1O09165 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Casq1O09165 AC154537.1-201ENSMUST00000226101 1304 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Casq1O09165 Slc6a2-202ENSMUST00000165470 6007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Casq1O09165 Tmem134-216ENSMUST00000171743 3701 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Casq1O09165 Srrt-201ENSMUST00000040873 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Casq1O09165 Aff3-203ENSMUST00000095027 5857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Casq1O09165 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Casq1O09165 Slc17a5-202ENSMUST00000117645 3114 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Casq1O09165 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Casq1O09165 Aar2-202ENSMUST00000109570 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Casq1O09165 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Casq1O09165 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Casq1O09165 Etfrf1-201ENSMUST00000039729 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Casq1O09165 Vmn1r45-202ENSMUST00000226167 2893 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Casq1O09165 Map4-203ENSMUST00000163979 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Casq1O09165 Nsl1-202ENSMUST00000078259 4879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Casq1O09165 Ablim1-210ENSMUST00000111550 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Casq1O09165 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Casq1O09165 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Casq1O09165 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Casq1O09165 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
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