Protein–RNA interactions for Protein: E9PVB3

Ccdc175, Coiled-coil domain-containing protein 175, mousemouse

Predictions only

Length 822 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc175E9PVB3 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccdc175E9PVB3 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccdc175E9PVB3 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccdc175E9PVB3 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccdc175E9PVB3 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccdc175E9PVB3 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccdc175E9PVB3 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccdc175E9PVB3 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccdc175E9PVB3 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccdc175E9PVB3 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccdc175E9PVB3 Rab3gap2-204ENSMUST00000194740 4418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccdc175E9PVB3 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccdc175E9PVB3 S100pbp-203ENSMUST00000106059 4084 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccdc175E9PVB3 Rin1-201ENSMUST00000025818 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccdc175E9PVB3 Trim11-202ENSMUST00000108809 3522 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccdc175E9PVB3 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccdc175E9PVB3 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccdc175E9PVB3 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccdc175E9PVB3 Glyctk-202ENSMUST00000112543 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccdc175E9PVB3 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccdc175E9PVB3 Inpp4a-211ENSMUST00000168546 2964 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccdc175E9PVB3 Emp1-202ENSMUST00000111907 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccdc175E9PVB3 Trip4-202ENSMUST00000119245 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccdc175E9PVB3 Zfp217-202ENSMUST00000109155 5670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccdc175E9PVB3 Als2-204ENSMUST00000163058 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccdc175E9PVB3 Ank3-205ENSMUST00000092433 5072 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccdc175E9PVB3 Gfra1-209ENSMUST00000169850 3224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccdc175E9PVB3 Kat6b-201ENSMUST00000069648 7649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccdc175E9PVB3 Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccdc175E9PVB3 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccdc175E9PVB3 Mical3-217ENSMUST00000207889 9204 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccdc175E9PVB3 Chek1-202ENSMUST00000172702 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccdc175E9PVB3 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccdc175E9PVB3 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccdc175E9PVB3 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccdc175E9PVB3 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccdc175E9PVB3 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccdc175E9PVB3 Gm11434-201ENSMUST00000122379 629 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccdc175E9PVB3 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccdc175E9PVB3 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccdc175E9PVB3 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccdc175E9PVB3 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccdc175E9PVB3 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccdc175E9PVB3 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccdc175E9PVB3 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccdc175E9PVB3 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccdc175E9PVB3 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccdc175E9PVB3 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccdc175E9PVB3 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccdc175E9PVB3 Galr1-201ENSMUST00000065224 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccdc175E9PVB3 Zfp236-202ENSMUST00000182122 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccdc175E9PVB3 E030013I19Rik-201ENSMUST00000148089 2754 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccdc175E9PVB3 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccdc175E9PVB3 Col6a6-203ENSMUST00000166431 7098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccdc175E9PVB3 Myh13-201ENSMUST00000081911 5817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccdc175E9PVB3 Gm38273-201ENSMUST00000194987 2382 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccdc175E9PVB3 Hspa5-201ENSMUST00000028222 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccdc175E9PVB3 Srr-201ENSMUST00000065211 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccdc175E9PVB3 Pla2g4a-202ENSMUST00000111926 2835 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccdc175E9PVB3 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccdc175E9PVB3 Slc38a8-201ENSMUST00000036748 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccdc175E9PVB3 Madd-213ENSMUST00000111376 5927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccdc175E9PVB3 Madd-206ENSMUST00000099725 5905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccdc175E9PVB3 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccdc175E9PVB3 Tfr2-208ENSMUST00000199054 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccdc175E9PVB3 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccdc175E9PVB3 Trub2-201ENSMUST00000048044 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccdc175E9PVB3 Rhoj-203ENSMUST00000118966 4892 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccdc175E9PVB3 Vcp-201ENSMUST00000030164 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccdc175E9PVB3 Stom-201ENSMUST00000028241 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccdc175E9PVB3 Fgl2-201ENSMUST00000035799 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccdc175E9PVB3 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccdc175E9PVB3 Gm21986-201ENSMUST00000113671 5560 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccdc175E9PVB3 Zbtb42-201ENSMUST00000169593 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccdc175E9PVB3 Ttll7-205ENSMUST00000170055 6075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccdc175E9PVB3 Hvcn1-202ENSMUST00000100747 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccdc175E9PVB3 Loxl3-201ENSMUST00000000707 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccdc175E9PVB3 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccdc175E9PVB3 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccdc175E9PVB3 Fibcd1-201ENSMUST00000028188 4751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccdc175E9PVB3 Dglucy-202ENSMUST00000110069 3058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccdc175E9PVB3 Cfap74-209ENSMUST00000151083 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccdc175E9PVB3 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccdc175E9PVB3 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccdc175E9PVB3 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccdc175E9PVB3 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccdc175E9PVB3 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccdc175E9PVB3 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccdc175E9PVB3 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccdc175E9PVB3 Stx5a-219ENSMUST00000177373 995 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccdc175E9PVB3 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccdc175E9PVB3 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccdc175E9PVB3 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccdc175E9PVB3 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccdc175E9PVB3 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccdc175E9PVB3 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccdc175E9PVB3 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccdc175E9PVB3 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccdc175E9PVB3 Fmnl1-202ENSMUST00000042286 3806 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccdc175E9PVB3 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.5 ms