Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M2

Usp12, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 12, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp12Q9D9M2 AC159308.2-201ENSMUST00000213592 2325 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Usp12Q9D9M2 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Usp12Q9D9M2 Gm21027-201ENSMUST00000219300 1236 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Usp12Q9D9M2 AC154849.4-201ENSMUST00000224868 365 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Usp12Q9D9M2 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Usp12Q9D9M2 AC159103.1-201ENSMUST00000228325 429 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Usp12Q9D9M2 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Usp12Q9D9M2 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Usp12Q9D9M2 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Usp12Q9D9M2 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Usp12Q9D9M2 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Usp12Q9D9M2 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Usp12Q9D9M2 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Usp12Q9D9M2 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Usp12Q9D9M2 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Usp12Q9D9M2 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Usp12Q9D9M2 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Usp12Q9D9M2 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Usp12Q9D9M2 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Usp12Q9D9M2 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Usp12Q9D9M2 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Usp12Q9D9M2 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Usp12Q9D9M2 Zfp862-ps-201ENSMUST00000203457 3282 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Usp12Q9D9M2 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Usp12Q9D9M2 Ncf4-201ENSMUST00000096357 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Usp12Q9D9M2 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Usp12Q9D9M2 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Usp12Q9D9M2 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Usp12Q9D9M2 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Usp12Q9D9M2 Fcna-201ENSMUST00000028307 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Usp12Q9D9M2 Frmd3-201ENSMUST00000084474 4136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Usp12Q9D9M2 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Usp12Q9D9M2 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Usp12Q9D9M2 Wdr45-206ENSMUST00000116634 1250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Usp12Q9D9M2 Gm13035-201ENSMUST00000117496 342 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Usp12Q9D9M2 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Usp12Q9D9M2 Gm13888-201ENSMUST00000119148 422 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Usp12Q9D9M2 Gm11667-201ENSMUST00000119828 486 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Usp12Q9D9M2 Gm8566-201ENSMUST00000120174 465 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Usp12Q9D9M2 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Usp12Q9D9M2 Gm21976-204ENSMUST00000186911 528 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Usp12Q9D9M2 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Usp12Q9D9M2 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Usp12Q9D9M2 AC140293.1-201ENSMUST00000225626 1247 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Usp12Q9D9M2 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Usp12Q9D9M2 Cthrc1-201ENSMUST00000067072 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Usp12Q9D9M2 Gm10179-201ENSMUST00000086233 688 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Usp12Q9D9M2 Cd320-202ENSMUST00000087559 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Usp12Q9D9M2 Hist1h3a-201ENSMUST00000091701 534 ntAPPRIS P1 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Usp12Q9D9M2 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Usp12Q9D9M2 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Usp12Q9D9M2 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Usp12Q9D9M2 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Usp12Q9D9M2 2900026A02Rik-203ENSMUST00000212276 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Usp12Q9D9M2 Gtf2i-210ENSMUST00000173341 4302 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Usp12Q9D9M2 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Usp12Q9D9M2 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Usp12Q9D9M2 Brap-202ENSMUST00000111765 3861 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Usp12Q9D9M2 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Usp12Q9D9M2 Ndc1-204ENSMUST00000139560 4584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Usp12Q9D9M2 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Usp12Q9D9M2 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Usp12Q9D9M2 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Usp12Q9D9M2 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Usp12Q9D9M2 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Usp12Q9D9M2 Epb41l1-203ENSMUST00000103136 6249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Usp12Q9D9M2 Olfr140-202ENSMUST00000111506 3449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Usp12Q9D9M2 Osbp2-201ENSMUST00000070552 4097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Usp12Q9D9M2 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Usp12Q9D9M2 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Usp12Q9D9M2 Gm5525-201ENSMUST00000190438 1312 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Usp12Q9D9M2 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Usp12Q9D9M2 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Usp12Q9D9M2 Ighv5-2-201ENSMUST00000103442 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Usp12Q9D9M2 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Usp12Q9D9M2 Gm10961-201ENSMUST00000106703 144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Usp12Q9D9M2 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Usp12Q9D9M2 Cspp1-204ENSMUST00000119714 1268 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Usp12Q9D9M2 Sec11a-204ENSMUST00000120285 875 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Usp12Q9D9M2 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Usp12Q9D9M2 1700001G11Rik-203ENSMUST00000153646 764 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Usp12Q9D9M2 9030616G12Rik-201ENSMUST00000181142 644 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Usp12Q9D9M2 Dusp13-211ENSMUST00000183943 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Usp12Q9D9M2 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Usp12Q9D9M2 Gm18038-201ENSMUST00000197900 485 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Usp12Q9D9M2 Gm44551-201ENSMUST00000208804 171 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Usp12Q9D9M2 Gm29961-201ENSMUST00000214692 644 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Usp12Q9D9M2 Gm1821-202ENSMUST00000227415 750 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Usp12Q9D9M2 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Usp12Q9D9M2 Ankrd2-201ENSMUST00000026172 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Usp12Q9D9M2 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Usp12Q9D9M2 1110025L11Rik-201ENSMUST00000089104 591 ntAPPRIS P1 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Usp12Q9D9M2 Asb3-202ENSMUST00000117883 2509 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Usp12Q9D9M2 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Usp12Q9D9M2 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Usp12Q9D9M2 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Usp12Q9D9M2 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Usp12Q9D9M2 Gm43727-201ENSMUST00000198021 2647 ntBASIC11.71□□□□□ -0.54
Usp12Q9D9M2 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Usp12Q9D9M2 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms