Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4B2

Ttc25, Tetratricopeptide repeat protein 25, mousemouse

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Length 624 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc25Q9D4B2 Gm12316-201ENSMUST00000125853 406 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ttc25Q9D4B2 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
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Ttc25Q9D4B2 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ttc25Q9D4B2 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
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Ttc25Q9D4B2 Thoc5-201ENSMUST00000038237 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ttc25Q9D4B2 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
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Ttc25Q9D4B2 Fam53a-203ENSMUST00000065162 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
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Ttc25Q9D4B2 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ttc25Q9D4B2 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
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Ttc25Q9D4B2 Satb1-208ENSMUST00000144331 6243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ttc25Q9D4B2 Arc-202ENSMUST00000110009 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ttc25Q9D4B2 Arc-201ENSMUST00000023268 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
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Ttc25Q9D4B2 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
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Ttc25Q9D4B2 Eml5-201ENSMUST00000065716 9482 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ttc25Q9D4B2 Cdh20-201ENSMUST00000062528 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ttc25Q9D4B2 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ttc25Q9D4B2 Mad1l1-201ENSMUST00000031534 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ttc25Q9D4B2 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ttc25Q9D4B2 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ttc25Q9D4B2 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ttc25Q9D4B2 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Ttc25Q9D4B2 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ttc25Q9D4B2 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ttc25Q9D4B2 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ttc25Q9D4B2 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ttc25Q9D4B2 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Ttc25Q9D4B2 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ttc25Q9D4B2 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.2 ms