Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWU5

Khdc3, KH domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Khdc3Q9CWU5 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Khdc3Q9CWU5 Zfp597-201ENSMUST00000090522 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Khdc3Q9CWU5 Gm43172-201ENSMUST00000202139 2137 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Khdc3Q9CWU5 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Khdc3Q9CWU5 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Khdc3Q9CWU5 Lepr-203ENSMUST00000106921 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Khdc3Q9CWU5 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Khdc3Q9CWU5 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Khdc3Q9CWU5 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Khdc3Q9CWU5 Gm12715-201ENSMUST00000121430 1128 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Khdc3Q9CWU5 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Khdc3Q9CWU5 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Khdc3Q9CWU5 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Khdc3Q9CWU5 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Khdc3Q9CWU5 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Khdc3Q9CWU5 Gm4607-201ENSMUST00000206649 577 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Khdc3Q9CWU5 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Khdc3Q9CWU5 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Khdc3Q9CWU5 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Khdc3Q9CWU5 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Khdc3Q9CWU5 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Khdc3Q9CWU5 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Khdc3Q9CWU5 Gm5455-201ENSMUST00000058710 715 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Khdc3Q9CWU5 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Khdc3Q9CWU5 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Khdc3Q9CWU5 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Khdc3Q9CWU5 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Khdc3Q9CWU5 Srrm2-201ENSMUST00000088621 8564 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Khdc3Q9CWU5 Gm37348-201ENSMUST00000193104 1789 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Khdc3Q9CWU5 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Khdc3Q9CWU5 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Khdc3Q9CWU5 Myh6-201ENSMUST00000081857 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Khdc3Q9CWU5 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Khdc3Q9CWU5 Cad-204ENSMUST00000201182 6529 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Khdc3Q9CWU5 4931428F04Rik-202ENSMUST00000171788 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Khdc3Q9CWU5 Npr2-201ENSMUST00000030191 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Khdc3Q9CWU5 Sgcb-201ENSMUST00000081170 3786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Khdc3Q9CWU5 Tie1-201ENSMUST00000047421 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Khdc3Q9CWU5 Tnxb-201ENSMUST00000087399 12209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Khdc3Q9CWU5 Ctnnd1-204ENSMUST00000099941 5783 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Khdc3Q9CWU5 Cast-211ENSMUST00000223206 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Khdc3Q9CWU5 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Khdc3Q9CWU5 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Khdc3Q9CWU5 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Khdc3Q9CWU5 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Khdc3Q9CWU5 Scaf4-202ENSMUST00000163419 4169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Khdc3Q9CWU5 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Khdc3Q9CWU5 Myt1l-201ENSMUST00000021009 5027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Khdc3Q9CWU5 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Khdc3Q9CWU5 Myo18a-222ENSMUST00000168348 6582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Khdc3Q9CWU5 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Khdc3Q9CWU5 Cep250-201ENSMUST00000039994 7979 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Khdc3Q9CWU5 Sec14l1-202ENSMUST00000090433 4654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Khdc3Q9CWU5 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Khdc3Q9CWU5 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Khdc3Q9CWU5 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Khdc3Q9CWU5 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Khdc3Q9CWU5 Gm26794-201ENSMUST00000180810 4312 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Khdc3Q9CWU5 Fer1l4-201ENSMUST00000109611 6106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Khdc3Q9CWU5 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Khdc3Q9CWU5 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Khdc3Q9CWU5 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Khdc3Q9CWU5 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Khdc3Q9CWU5 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Khdc3Q9CWU5 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Khdc3Q9CWU5 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Khdc3Q9CWU5 Gm17099-201ENSMUST00000166780 412 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Khdc3Q9CWU5 Rps13-ps2-201ENSMUST00000182017 453 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Khdc3Q9CWU5 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Khdc3Q9CWU5 Aprt-ps-201ENSMUST00000212311 505 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Khdc3Q9CWU5 AC122463.1-201ENSMUST00000214559 597 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Khdc3Q9CWU5 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Khdc3Q9CWU5 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Khdc3Q9CWU5 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Khdc3Q9CWU5 Clec16a-201ENSMUST00000038145 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Khdc3Q9CWU5 Gm12992-201ENSMUST00000124738 4493 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Khdc3Q9CWU5 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Khdc3Q9CWU5 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Khdc3Q9CWU5 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Khdc3Q9CWU5 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Khdc3Q9CWU5 Gm45902-202ENSMUST00000140494 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Khdc3Q9CWU5 Cul5-201ENSMUST00000034529 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Khdc3Q9CWU5 Cep250-204ENSMUST00000109619 7977 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Khdc3Q9CWU5 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Khdc3Q9CWU5 AC129931.1-201ENSMUST00000228865 1861 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Khdc3Q9CWU5 Tnfaip3-201ENSMUST00000019997 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Khdc3Q9CWU5 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Khdc3Q9CWU5 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Khdc3Q9CWU5 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Khdc3Q9CWU5 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Khdc3Q9CWU5 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Khdc3Q9CWU5 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Khdc3Q9CWU5 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Khdc3Q9CWU5 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Khdc3Q9CWU5 Unk-201ENSMUST00000021116 3735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Khdc3Q9CWU5 Bpi-201ENSMUST00000065039 1926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Khdc3Q9CWU5 Abcc10-204ENSMUST00000167360 4866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Khdc3Q9CWU5 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Khdc3Q9CWU5 Usp22-201ENSMUST00000041683 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Khdc3Q9CWU5 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
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