Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHC5

Cabp4, Calcium-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cabp4Q8VHC5 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cabp4Q8VHC5 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cabp4Q8VHC5 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cabp4Q8VHC5 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cabp4Q8VHC5 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cabp4Q8VHC5 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cabp4Q8VHC5 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cabp4Q8VHC5 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cabp4Q8VHC5 Rffl-205ENSMUST00000103218 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cabp4Q8VHC5 Gm13600-201ENSMUST00000117949 744 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Cabp4Q8VHC5 Mfsd11-212ENSMUST00000153084 1194 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cabp4Q8VHC5 Gm7741-201ENSMUST00000181445 989 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Cabp4Q8VHC5 Mir8093-201ENSMUST00000185043 137 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Cabp4Q8VHC5 Gm43692-201ENSMUST00000198236 1062 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Cabp4Q8VHC5 Gm43001-201ENSMUST00000198925 603 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cabp4Q8VHC5 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Cabp4Q8VHC5 1700012D14Rik-204ENSMUST00000210788 547 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cabp4Q8VHC5 Gm45338-206ENSMUST00000211460 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cabp4Q8VHC5 Gm36074-201ENSMUST00000221383 591 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cabp4Q8VHC5 5830428M24Rik-201ENSMUST00000221805 825 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cabp4Q8VHC5 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cabp4Q8VHC5 4930555B11Rik-201ENSMUST00000123210 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cabp4Q8VHC5 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cabp4Q8VHC5 Dclk1-215ENSMUST00000200352 1662 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cabp4Q8VHC5 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cabp4Q8VHC5 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cabp4Q8VHC5 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cabp4Q8VHC5 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cabp4Q8VHC5 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cabp4Q8VHC5 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cabp4Q8VHC5 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cabp4Q8VHC5 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cabp4Q8VHC5 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cabp4Q8VHC5 Zmynd11-206ENSMUST00000110637 3770 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cabp4Q8VHC5 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cabp4Q8VHC5 Dcaf11-202ENSMUST00000117236 2538 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cabp4Q8VHC5 Pisd-203ENSMUST00000120591 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cabp4Q8VHC5 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cabp4Q8VHC5 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cabp4Q8VHC5 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cabp4Q8VHC5 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cabp4Q8VHC5 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cabp4Q8VHC5 Serpina1b-203ENSMUST00000186166 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cabp4Q8VHC5 A530032D15Rik-201ENSMUST00000160792 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cabp4Q8VHC5 4933406C10Rik-201ENSMUST00000180391 1451 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cabp4Q8VHC5 Dnmt3aos-201ENSMUST00000144896 1385 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cabp4Q8VHC5 Cd55b-201ENSMUST00000112488 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cabp4Q8VHC5 Ptges3l-203ENSMUST00000107252 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cabp4Q8VHC5 Gm12030-201ENSMUST00000121917 223 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Cabp4Q8VHC5 Gm13166-201ENSMUST00000123828 940 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cabp4Q8VHC5 Cideb-201ENSMUST00000001497 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cabp4Q8VHC5 Gm13236-201ENSMUST00000153010 940 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cabp4Q8VHC5 Rnf181-212ENSMUST00000154098 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cabp4Q8VHC5 Fam166b-206ENSMUST00000171134 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cabp4Q8VHC5 Gm18059-201ENSMUST00000208073 580 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Cabp4Q8VHC5 CT030653.1-201ENSMUST00000224382 1279 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Cabp4Q8VHC5 AC164437.3-201ENSMUST00000228323 347 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Cabp4Q8VHC5 Gm4744-201ENSMUST00000073642 792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cabp4Q8VHC5 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cabp4Q8VHC5 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cabp4Q8VHC5 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cabp4Q8VHC5 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cabp4Q8VHC5 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cabp4Q8VHC5 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cabp4Q8VHC5 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cabp4Q8VHC5 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cabp4Q8VHC5 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cabp4Q8VHC5 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cabp4Q8VHC5 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cabp4Q8VHC5 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cabp4Q8VHC5 Coro6-202ENSMUST00000052515 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cabp4Q8VHC5 Gabre-201ENSMUST00000064780 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cabp4Q8VHC5 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cabp4Q8VHC5 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cabp4Q8VHC5 Fndc8-201ENSMUST00000018988 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cabp4Q8VHC5 Gm11801-201ENSMUST00000117807 746 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Cabp4Q8VHC5 Gm13117-201ENSMUST00000120894 691 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Cabp4Q8VHC5 Olfr755-ps1-201ENSMUST00000173568 910 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Cabp4Q8VHC5 Gm29040-201ENSMUST00000189899 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cabp4Q8VHC5 Gpx1-204ENSMUST00000193987 653 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cabp4Q8VHC5 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Cabp4Q8VHC5 Gm45758-201ENSMUST00000212448 1006 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Cabp4Q8VHC5 AC122463.1-201ENSMUST00000214559 597 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cabp4Q8VHC5 AC114645.1-201ENSMUST00000215831 187 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Cabp4Q8VHC5 AC134869.4-202ENSMUST00000224350 837 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Cabp4Q8VHC5 1700001K19Rik-201ENSMUST00000070659 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cabp4Q8VHC5 Gm4978-201ENSMUST00000071565 801 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Cabp4Q8VHC5 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cabp4Q8VHC5 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cabp4Q8VHC5 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cabp4Q8VHC5 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cabp4Q8VHC5 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cabp4Q8VHC5 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cabp4Q8VHC5 Btnl4-201ENSMUST00000065841 1761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cabp4Q8VHC5 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cabp4Q8VHC5 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cabp4Q8VHC5 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cabp4Q8VHC5 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cabp4Q8VHC5 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cabp4Q8VHC5 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms