Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFE2

Hpf1, Histone PARylation factor 1, mousemouse

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Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hpf1Q8CFE2 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hpf1Q8CFE2 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hpf1Q8CFE2 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hpf1Q8CFE2 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hpf1Q8CFE2 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hpf1Q8CFE2 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hpf1Q8CFE2 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hpf1Q8CFE2 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hpf1Q8CFE2 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hpf1Q8CFE2 Rims4-201ENSMUST00000044734 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hpf1Q8CFE2 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hpf1Q8CFE2 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hpf1Q8CFE2 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hpf1Q8CFE2 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hpf1Q8CFE2 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Hpf1Q8CFE2 Gtf2e1-201ENSMUST00000023525 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Hpf1Q8CFE2 Preb-201ENSMUST00000074840 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
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Hpf1Q8CFE2 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Hpf1Q8CFE2 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Hpf1Q8CFE2 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Hpf1Q8CFE2 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Hpf1Q8CFE2 Wac-216ENSMUST00000171486 1608 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Hpf1Q8CFE2 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Hpf1Q8CFE2 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Hpf1Q8CFE2 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Hpf1Q8CFE2 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Hpf1Q8CFE2 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Hpf1Q8CFE2 Gm37057-201ENSMUST00000192624 1916 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Hpf1Q8CFE2 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Hpf1Q8CFE2 Slc6a16-201ENSMUST00000179310 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Hpf1Q8CFE2 Gipr-201ENSMUST00000094790 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Hpf1Q8CFE2 Lepr-203ENSMUST00000106921 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Hpf1Q8CFE2 BC026585-202ENSMUST00000119891 1125 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Hpf1Q8CFE2 Gm7722-201ENSMUST00000120646 741 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Hpf1Q8CFE2 Gm10714-201ENSMUST00000131346 874 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Hpf1Q8CFE2 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Hpf1Q8CFE2 Gm5616-201ENSMUST00000165252 384 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Hpf1Q8CFE2 Gm17334-201ENSMUST00000170390 907 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Hpf1Q8CFE2 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Hpf1Q8CFE2 Gm8741-201ENSMUST00000174736 384 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Hpf1Q8CFE2 Mir7070-201ENSMUST00000183657 86 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Hpf1Q8CFE2 Ighv4-2-201ENSMUST00000192975 362 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Hpf1Q8CFE2 4930539M17Rik-201ENSMUST00000194792 846 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Hpf1Q8CFE2 9230114K14Rik-203ENSMUST00000199547 437 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Hpf1Q8CFE2 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
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Hpf1Q8CFE2 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Hpf1Q8CFE2 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Hpf1Q8CFE2 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Hpf1Q8CFE2 Ankrd2-201ENSMUST00000026172 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Hpf1Q8CFE2 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Hpf1Q8CFE2 Asb3-202ENSMUST00000117883 2509 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Hpf1Q8CFE2 Slc2a4-201ENSMUST00000018710 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Hpf1Q8CFE2 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
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Hpf1Q8CFE2 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Hpf1Q8CFE2 Gm28036-202ENSMUST00000132494 5505 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Hpf1Q8CFE2 Tmod2-201ENSMUST00000064433 9884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
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Hpf1Q8CFE2 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Hpf1Q8CFE2 Adamts14-202ENSMUST00000120336 3645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Hpf1Q8CFE2 Hoxa1-201ENSMUST00000000964 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
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Hpf1Q8CFE2 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hpf1Q8CFE2 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hpf1Q8CFE2 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hpf1Q8CFE2 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hpf1Q8CFE2 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Hpf1Q8CFE2 Gm29050-201ENSMUST00000190732 2528 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hpf1Q8CFE2 Slc6a18-201ENSMUST00000022105 2839 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
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Hpf1Q8CFE2 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
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Hpf1Q8CFE2 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hpf1Q8CFE2 Plekhg2-201ENSMUST00000094644 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hpf1Q8CFE2 Ncoa6-203ENSMUST00000109670 7101 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hpf1Q8CFE2 Grm1-202ENSMUST00000105560 4265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hpf1Q8CFE2 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hpf1Q8CFE2 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hpf1Q8CFE2 Ssh1-201ENSMUST00000077689 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hpf1Q8CFE2 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hpf1Q8CFE2 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hpf1Q8CFE2 Tbcd-201ENSMUST00000103013 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hpf1Q8CFE2 Ncmap-202ENSMUST00000105857 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hpf1Q8CFE2 Dynlrb1-202ENSMUST00000109682 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hpf1Q8CFE2 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hpf1Q8CFE2 Gm16481-201ENSMUST00000119074 1227 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
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Hpf1Q8CFE2 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 101.5 ms