Protein–RNA interactions for Protein: Q8C8T8

Tsr2, Pre-rRNA-processing protein TSR2 homolog, mousemouse

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Length 191 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsr2Q8C8T8 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tsr2Q8C8T8 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tsr2Q8C8T8 Zfp516-202ENSMUST00000171238 7725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tsr2Q8C8T8 Zfp516-201ENSMUST00000071233 7703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tsr2Q8C8T8 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tsr2Q8C8T8 Cxcr5-202ENSMUST00000179828 2824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tsr2Q8C8T8 Pabpc1-201ENSMUST00000001809 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tsr2Q8C8T8 Nrros-202ENSMUST00000115163 3559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tsr2Q8C8T8 Nnt-203ENSMUST00000109204 3198 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tsr2Q8C8T8 Gm33677-201ENSMUST00000220074 2765 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tsr2Q8C8T8 Gm21939-201ENSMUST00000221137 2773 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Tsr2Q8C8T8 Pip5kl1-201ENSMUST00000055304 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tsr2Q8C8T8 Mfrp-201ENSMUST00000034654 4316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tsr2Q8C8T8 Csgalnact1-203ENSMUST00000130214 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tsr2Q8C8T8 Cd40-201ENSMUST00000017799 2986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tsr2Q8C8T8 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tsr2Q8C8T8 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Tsr2Q8C8T8 Dntt-201ENSMUST00000051806 2128 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tsr2Q8C8T8 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Tsr2Q8C8T8 Sox9-201ENSMUST00000000579 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tsr2Q8C8T8 Neat1-202ENSMUST00000174287 3004 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tsr2Q8C8T8 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tsr2Q8C8T8 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tsr2Q8C8T8 Hmbox1-202ENSMUST00000067843 2931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tsr2Q8C8T8 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Tsr2Q8C8T8 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tsr2Q8C8T8 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tsr2Q8C8T8 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tsr2Q8C8T8 Pcbd2-202ENSMUST00000124968 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tsr2Q8C8T8 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tsr2Q8C8T8 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tsr2Q8C8T8 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tsr2Q8C8T8 Rps13-ps2-201ENSMUST00000182017 453 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Tsr2Q8C8T8 Gm27530-201ENSMUST00000184096 98 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Tsr2Q8C8T8 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Tsr2Q8C8T8 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Tsr2Q8C8T8 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Tsr2Q8C8T8 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Tsr2Q8C8T8 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tsr2Q8C8T8 Amigo3-201ENSMUST00000085060 2543 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tsr2Q8C8T8 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Tsr2Q8C8T8 Metap2-208ENSMUST00000181091 1876 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tsr2Q8C8T8 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tsr2Q8C8T8 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tsr2Q8C8T8 Spag16-202ENSMUST00000113940 3559 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tsr2Q8C8T8 Inpp4a-211ENSMUST00000168546 2964 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tsr2Q8C8T8 Taf6-202ENSMUST00000110936 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tsr2Q8C8T8 Slc38a3-201ENSMUST00000010208 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tsr2Q8C8T8 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tsr2Q8C8T8 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tsr2Q8C8T8 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tsr2Q8C8T8 Syne3-202ENSMUST00000095439 3357 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tsr2Q8C8T8 Sowahc-201ENSMUST00000182161 4482 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tsr2Q8C8T8 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tsr2Q8C8T8 Ppp2r1b-201ENSMUST00000034560 3647 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tsr2Q8C8T8 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tsr2Q8C8T8 Alg12-204ENSMUST00000162183 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Tsr2Q8C8T8 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tsr2Q8C8T8 B4galt4-201ENSMUST00000023482 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tsr2Q8C8T8 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tsr2Q8C8T8 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tsr2Q8C8T8 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Tsr2Q8C8T8 Washc3-201ENSMUST00000020248 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tsr2Q8C8T8 C530044C16Rik-202ENSMUST00000205217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Tsr2Q8C8T8 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tsr2Q8C8T8 Rpp38-201ENSMUST00000062672 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tsr2Q8C8T8 Lect2-201ENSMUST00000062806 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tsr2Q8C8T8 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tsr2Q8C8T8 Traf7-202ENSMUST00000088464 2504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tsr2Q8C8T8 Qrich1-202ENSMUST00000112155 3040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tsr2Q8C8T8 Kcnk18-201ENSMUST00000065204 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Tsr2Q8C8T8 Dbx2-201ENSMUST00000054244 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tsr2Q8C8T8 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Tsr2Q8C8T8 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tsr2Q8C8T8 Epb42-201ENSMUST00000023987 2695 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tsr2Q8C8T8 Lox-201ENSMUST00000025409 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tsr2Q8C8T8 Mpv17-202ENSMUST00000200744 1653 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tsr2Q8C8T8 Kifc5b-201ENSMUST00000078961 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tsr2Q8C8T8 Pacsin1-201ENSMUST00000045896 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tsr2Q8C8T8 Lck-208ENSMUST00000167288 2074 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tsr2Q8C8T8 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tsr2Q8C8T8 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tsr2Q8C8T8 AC165351.1-201ENSMUST00000219078 2020 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Tsr2Q8C8T8 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tsr2Q8C8T8 Snap23-201ENSMUST00000028743 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tsr2Q8C8T8 B430119L08Rik-201ENSMUST00000130054 1994 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tsr2Q8C8T8 Awat2-202ENSMUST00000147103 1984 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tsr2Q8C8T8 Gm33831-201ENSMUST00000211696 1542 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tsr2Q8C8T8 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tsr2Q8C8T8 Fam110b-201ENSMUST00000054857 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tsr2Q8C8T8 A930038B10Rik-202ENSMUST00000181044 3415 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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