Protein–RNA interactions for Protein: Q80VM8

Pnma8a, Paraneoplastic antigen-like protein 8A, mousemouse

Predictions only

Length 430 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pnma8aQ80VM8 Serpina1b-203ENSMUST00000186166 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pnma8aQ80VM8 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Pnma8aQ80VM8 Gm43807-201ENSMUST00000200678 1781 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Pnma8aQ80VM8 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pnma8aQ80VM8 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pnma8aQ80VM8 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pnma8aQ80VM8 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pnma8aQ80VM8 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Pnma8aQ80VM8 Gm11511-201ENSMUST00000118146 540 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Pnma8aQ80VM8 Gm15004-201ENSMUST00000119192 630 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Pnma8aQ80VM8 Odf4-202ENSMUST00000125134 646 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pnma8aQ80VM8 Gm21859-201ENSMUST00000178424 1045 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pnma8aQ80VM8 Gm26782-202ENSMUST00000181697 971 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pnma8aQ80VM8 1110008E08Rik-202ENSMUST00000183621 723 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Pnma8aQ80VM8 Gm28071-201ENSMUST00000190355 478 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Pnma8aQ80VM8 Gm14267-206ENSMUST00000226870 1209 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Pnma8aQ80VM8 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pnma8aQ80VM8 C1qb-201ENSMUST00000046384 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pnma8aQ80VM8 Il17c-201ENSMUST00000050963 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pnma8aQ80VM8 Krtap19-1-201ENSMUST00000081334 493 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pnma8aQ80VM8 C530043K16Rik-201ENSMUST00000201865 3109 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Pnma8aQ80VM8 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Pnma8aQ80VM8 Matn2-202ENSMUST00000163455 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pnma8aQ80VM8 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pnma8aQ80VM8 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pnma8aQ80VM8 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pnma8aQ80VM8 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pnma8aQ80VM8 Reps1-201ENSMUST00000126390 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pnma8aQ80VM8 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Pnma8aQ80VM8 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pnma8aQ80VM8 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pnma8aQ80VM8 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Pnma8aQ80VM8 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Pnma8aQ80VM8 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pnma8aQ80VM8 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pnma8aQ80VM8 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pnma8aQ80VM8 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pnma8aQ80VM8 Tsga10-202ENSMUST00000088072 3837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pnma8aQ80VM8 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pnma8aQ80VM8 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pnma8aQ80VM8 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pnma8aQ80VM8 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pnma8aQ80VM8 Ngef-202ENSMUST00000068681 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pnma8aQ80VM8 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pnma8aQ80VM8 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pnma8aQ80VM8 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pnma8aQ80VM8 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pnma8aQ80VM8 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pnma8aQ80VM8 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pnma8aQ80VM8 Tpm1-201ENSMUST00000030185 1797 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pnma8aQ80VM8 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pnma8aQ80VM8 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pnma8aQ80VM8 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pnma8aQ80VM8 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pnma8aQ80VM8 Xkr6-202ENSMUST00000120820 1702 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pnma8aQ80VM8 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pnma8aQ80VM8 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pnma8aQ80VM8 Aplp2-209ENSMUST00000217641 3462 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pnma8aQ80VM8 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pnma8aQ80VM8 Gipr-201ENSMUST00000094790 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pnma8aQ80VM8 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pnma8aQ80VM8 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pnma8aQ80VM8 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pnma8aQ80VM8 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pnma8aQ80VM8 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pnma8aQ80VM8 Cstl1-201ENSMUST00000109952 629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pnma8aQ80VM8 Zfp157-203ENSMUST00000110912 886 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pnma8aQ80VM8 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pnma8aQ80VM8 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pnma8aQ80VM8 Hcfc1r1-203ENSMUST00000180140 693 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pnma8aQ80VM8 Gm28686-201ENSMUST00000187404 609 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Pnma8aQ80VM8 4930448A20Rik-201ENSMUST00000205988 1034 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pnma8aQ80VM8 Camsap3-209ENSMUST00000207970 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pnma8aQ80VM8 Cacng1-201ENSMUST00000021065 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pnma8aQ80VM8 Gm9797-202ENSMUST00000218003 294 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Pnma8aQ80VM8 Spcs1-203ENSMUST00000226374 592 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Pnma8aQ80VM8 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pnma8aQ80VM8 Acly-201ENSMUST00000007131 4393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pnma8aQ80VM8 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pnma8aQ80VM8 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pnma8aQ80VM8 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pnma8aQ80VM8 Rbpsuh-rs3-201ENSMUST00000182751 1441 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Pnma8aQ80VM8 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pnma8aQ80VM8 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pnma8aQ80VM8 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pnma8aQ80VM8 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pnma8aQ80VM8 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pnma8aQ80VM8 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pnma8aQ80VM8 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pnma8aQ80VM8 Rasal2-204ENSMUST00000132699 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pnma8aQ80VM8 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pnma8aQ80VM8 Btbd9-201ENSMUST00000079924 6657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pnma8aQ80VM8 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pnma8aQ80VM8 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pnma8aQ80VM8 Camk2g-203ENSMUST00000100837 3564 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pnma8aQ80VM8 Esrp1-201ENSMUST00000043781 3743 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pnma8aQ80VM8 Fam214a-205ENSMUST00000215370 4205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pnma8aQ80VM8 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pnma8aQ80VM8 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pnma8aQ80VM8 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms